谈忠鸣 作品数:54 被引量:320 H指数:10 供职机构: 江苏省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 江苏省“科教兴卫工程”医学重点人才基金 江苏省医学重点学科基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
江苏地区2011年恙虫病暴发的分子流行病学研究 被引量:7 2012年 恙虫病是由携带恙虫病东方体的恙螨幼虫叮咬而传播的自然疫源性虫媒传染病。2006年江苏省盐城市滨海县出现恙虫病局部暴发,至2010年,我省恙虫病疫情较平稳,全年病例数维持在150例左右。2011年全省恙虫病病例出现大幅增加,共计报告临床诊断病例500人。本研究对2011年92份恙虫病临床标本进行核酸分子鉴定,在56-kDa基因序列分析的基础上揭示了病原的分子流行特征,为进一步监测和防控提供实验依据。 谈忠鸣 李志峰 储凯 孟繁岳 崔仑标 鲍昌俊 顾玲 祁贤 董晨 钱慧敏 周璐 汤奋扬 朱凤才 周明浩关键词:恙虫病东方体 分子流行病学 临床诊断病例 基因序列分析 虫媒传染病 江苏省首例人感染猪种布鲁菌的分子诊断及特征分析 2020年 目的鉴定人感染猪种布鲁菌,掌握其生物及分子特征,为布鲁菌病的防控提供依据。方法自江苏省首例人感染猪种布鲁菌患者体内分离布鲁菌菌株,采用血清凝集试验进行血清分型;采用普通PCR方法进行布鲁菌特异性基因bcsp-31检测;采用AMOS-PCR方法进行分型序列IS-711鉴定;采用多重PCR方法进行种及生物型鉴定,对wboA基因扩增产物进行测序,并构建系统发育树;采用多位点序列分析(multilocus sequence analysis,MLSA)进行分子分型分析,并与参考菌株进行聚类分析。结果通过血清凝集试验及PCR方法,确认该菌为猪种布鲁菌生物3型。wboA基因测序后,参考序列聚类分析发现与生物3型猪种布鲁菌str.686(CP007719)最为接近。MLSA分型为ST17型(1-6-4-1-5-3-5-2-4)。结论江苏省首次发现人感染猪种布鲁菌生物3型,MLSA分型为ST17型。今后在该地区进行人间布鲁菌病防控的同时,还应积极与畜牧兽医部门合作,加强生猪的检疫、免疫等防治措施。 谈忠鸣 汪秀斌 周伟忠 董晨 周璐 洪捷 钱慧敏 胡建利 鲍倡俊关键词:多重PCR 2016-2022年江苏省扬州市临床分离金黄色葡萄球菌克林霉素耐药性及耐药基因分析 2024年 目的了解耐克林霉素金黄色葡萄球菌(SA)的耐药性及耐药基因分布情况,为耐克林霉素SA感染的诊疗及科学防治提供实验室依据。方法收集2016—2022年江苏省扬州市部分三甲医院临床检测样本分离SA,用微量肉汤稀释法检测SA耐药表型,全基因组测序分析后用多位点序列分型(MLST)方法进行分型,并在耐药基因数据库中筛选耐药基因。结果共收集到临床SA分离株200株,86株SA确定为克林霉素耐药,其中43株(43/86,50%)为诱导耐药(iMLSB)。86株SA耐药模式多样,固有耐药(cMLSB)共有15种耐药表型,其中有4株菌对6种以上药物不敏感;iMLSB共有13种耐药表型,有7株菌对6种以上药物不敏感。对9类17种耐药基因进行分析,携带超过6个耐药基因的菌株中,iMLSB占9.30%(8/86),高于cMLSB(2.33%,2/86)。86株SA分为12个不同的克隆复合体(CC),优势型别为CC398(27.90%)、CC5(15.12%)和CC59(12.79%)。结论与cMLSB相比,iMLSB对6种以上抗菌药物不敏感的菌株数更多,耐药基因携带率也更高。CC5克隆群多为iMLSB(84.62%,11/13),平均携带耐药基因数为7。扬州市iMLSB SA的耐药现状及耐药基因特征值得关注,CC5-ermA-SA在抗生素的威胁下可能更具耐受性。 徐娅雯 陆荣荣 许蓉蓉 朱倩 谈忠鸣 周乐关键词:金黄色葡萄球菌 克林霉素耐药 耐药基因 江苏泰州地区一起秋季恙虫病暴发的调查分析 被引量:7 2013年 目的分析江苏省泰州地区一起恙虫病暴发的流行病学及临床特征,了解江苏省恙虫病疫源地的新变化。方法确定病例定义,开展现场流行病学调查,分析临床特征,PCR法核酸检测诊断恙虫病,并对部分阳性结果进行分型扩增、测序。结果本次暴发为2011年10月至11月,疫源地为气候湿润、雨量充沛的平原地带。共发现恙虫病病例15例,其中实验室确诊病例6例,临床诊断病例5例,疑似病例4例。15例均有发热,其中皮疹14例,淋巴结肿大3例,焦痂或溃疡12例,肝功能损害3例,所有病例均无严重并发症,经治疗后均康复。分型测序结果比对,与Kawasaki型的碱基序列同源性为99.00%。结论江苏省泰州地区此次恙虫病暴发是过渡型疫源地秋季型恙虫病,病原体为Kawasaki型恙虫病东方体。 储凯 谈忠鸣 闻栋 移钱华 孟繁岳 汤奋扬关键词:丛林斑疹伤寒 聚合酶链反应 无菌部位分离65株金黄色葡萄球菌耐药情况及耐药机制 被引量:1 2019年 目的研究无菌部位分离的金黄色葡萄球菌(金葡菌)对红霉素、克林霉素耐药率及耐药机制。方法微量肉汤稀释法检测金葡菌3种抗生素的最小抑菌浓度以及克林霉素诱导试验,采用PCR检测4种耐药基因。结果65株金葡菌中,共检出耐甲氧西林金葡菌(MRSA)35株,甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)30株,MRSA检出率为53.8%;对红霉素、克林霉素耐药率分别为67.7%、33.8%;MRSA的红霉素、克林霉素耐药率均高于MSSA,差异有统计学意义(P值均<0.05)。克林霉素诱导耐药率为95.5%。耐药基因ermC携带率最高,MRSA携带耐药基因数高于MSSA。结论无菌部位分离的金葡菌对红霉素和克林霉素耐药率较高,且MRSA比MSSA携带有更多的耐药基因。 洪捷 周璐 孔筱筱 顾玲 董晨 钱慧敏 谈忠鸣关键词:金黄色葡萄球菌 克林霉素 诱导耐药 分子分型 南京市羊种布鲁氏菌分离鉴定及rpob基因分析 被引量:3 2018年 目的:分离鉴定及分子快速诊断方法确诊布鲁氏菌病,并对2011—2016年间南京地区分离到的布鲁氏菌rpob基因进行特征分析。方法:对疑似布鲁氏菌病患者全血进行分离培养,并通过生化鉴定、Real-time PCR对分离到的布鲁氏菌进行bcsp31基因特异性分析及IS-711插入序列分型。利用PCR方法对rpob基因进行扩增,产物测序并分析。结果:2011—2016年共收集到7株布鲁氏菌,经Real-time PCR方法检测,全部为羊种布鲁氏菌。通过测序分析发现7株羊种布鲁氏菌bpob基因仅出现1个碱基差异。结论:南京地区发现的布鲁氏菌病患者全部为羊种布鲁氏菌感染,羊种布鲁氏菌bpob基因高度同源,在种间水平上显示出良好的多态性。城市地区布鲁氏菌病的传播途径及危险因素更为复杂。 张颖 张之峰 洪捷 周伟忠 鲍倡俊 周明浩 谈忠鸣关键词:羊种布鲁氏菌 分子检测 REAL-TIME RPOB基因 非布鲁菌病疫区江苏省连云港市13株布鲁菌分离株的MLVA基因分型特征分析 被引量:2 2020年 目的了解非布鲁菌病疫区江苏省连云港市布鲁菌分离株的基因分型特征。方法对2018年连云港市第一人民医院临床微生物室血培养分离的13株疑似布鲁菌菌株进行初步鉴定;同时,采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测布鲁菌特异性基因bcsp31和插入序列IS-711,对鉴定结果进行复核和分型。运用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)进行基因分型,测序结果用Mega 4.0软件进行编辑。结果13株分离株经初步鉴定均为布鲁菌属。经Real-time PCR检测,13株分离株均为羊种布鲁菌。MLVA结果显示,13株羊种布鲁菌分为12个基因型,且聚类在"中地中海簇"中。13株羊种布鲁菌中有3株生物1型、2株生物2型和8株生物3型。结论连云港市分离的布鲁菌菌株均为羊种布鲁菌,MLVA聚类在"中地中海簇"中。 金丹婷 左春磊 吴昕哲 刘洪书 赵勇 谈忠鸣 茆海丰2018年江苏省人感染布鲁氏菌分离株分子特征分析 被引量:2 2020年 目的掌握江苏省2018年人感染布鲁氏菌主要流行株的种型和基因型。方法运用普通PCR及AMOS多重PCR确认分离株的生物种型;采用多位点序列分型(Multilocus sequence analysis,MLSA)和多位点串联重复序列分析(Multiple-locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)鉴定基因型,并与国内外流行株进行聚类分析。结果2018年共分离到56株布鲁氏菌,MLSA分型显示一株菌为猪种布鲁氏菌ST(Sequence type)17型,其他均为羊种布鲁氏菌ST8型。MLVA将56株菌分为47个基因亚型(46个羊种,1个猪种),聚类显示羊种布鲁氏菌全部为“东地中海簇”。结论2018年江苏省人感染布病主要为“东地中海簇”的ST8型羊种布鲁氏菌,并首次发现一例人感染ST17型猪种布鲁氏菌。 谈忠鸣 汪秀斌 周伟忠 董晨 周璐 洪捷 钱慧敏 胡建利 鲍倡俊关键词:布鲁氏菌病 羊种布鲁氏菌 江苏地区A群链球菌耐药及分子特征研究 被引量:2 2021年 目的研究江苏省A群链球菌的耐药性、耐药基因和分子分型的特征联系。方法收集2016年-2018年全省A群链球菌50株,采用微量肉汤稀释法测定12种抗生素最小抑菌浓度,采用PCR方法检测7种不同的耐药基因和转座子Tn916,并采用emm分型、多位点序列分型(MLST)和sof分型方法进行分子分型。结果 50株GAS对四环素、红霉素和克林霉素耐药率较高,对其他9种抗生素均敏感。耐药基因tet M、erm B及转座子Tn916携带率较高,未发现携带tet L的菌株,其他耐药基因携带率较低。emm分型分为5个emm型别,MLST分型分为5个ST型,有25株菌株可以扩增出sof基因,分为3个OF型。引起猩红热的GAS其耐药率、耐药种数和耐药基因携带数均高于引起其他症状的GAS(P <0.05)。主要分子型别之间(emm1和emm12,ST28和ST36,OF可分型和OF不可分型)其转座子Tn916携带率有差异。结论江苏地区GAS对四环素、红霉素和克林霉素耐药率较高,以携带耐药基因tet M和erm B为主,菌株主要emm型别为emm1和emm12,主要ST型别为ST28和ST36,主要OF型为12。 洪捷 谈忠鸣 许可 黄昊頔 李楚楚关键词:A群链球菌 耐药性 转座子 分子分型 江苏省2016—2019年不同来源小肠结肠炎耶尔森菌血清、生物型分布及分子特征分析 被引量:2 2022年 目的:了解江苏地区2016—2019年间不同来源小肠结肠炎耶尔森菌血清、生物型分布及分子特征。方法:收集2016—2019年江苏地区各类标本进行小肠结肠炎耶尔森菌分离培养,对分离株进行生化和血清分型,并通过二代测序方法进行毒力基因和多位点序列分析。结果:2016—2019年在江苏地区共采集各类标本6398份,分离小肠结肠炎耶尔森菌186株,其中105株菌为血清型无法鉴定,可鉴定血清型中以O:8、O:3为主,存在3个生物型,大部分为生物型1A。通过测序分析发现毒力基因以Ⅲ型(ail-、ystA-、ystB+、yadA-、virF-)和Ⅳ型(ail-、ystA-、ystB-、yadA-、virF-)为主,多位点序列分析(MLST)将所有分离株分为81个ST型。结论:江苏地区不同来源小肠结肠炎耶尔森菌血清型较复杂,生物型相对集中,腹泻患者中可分离到毒力基因Ⅳ型菌株,ST基因型呈多样性发散分布,应重点加强猪、鸡、狗等动物的管控和监测。 周璐 段然 祝雯雯 朱莹莹 鲍倡俊 王鑫 谈忠鸣关键词:小肠结肠炎耶尔森菌 血清型 全基因组测序 毒力基因