谷晶晶
- 作品数：4 被引量：56H指数：4
- 供职机构：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室更多>>
- 发文基金：国家科技基础条件平台建设计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 微卫星标记对红鳍东方鲀繁殖的指导应用及遗传分析被引量：13
- 2010年
- 利用已有设计的20个具有多态性的微卫星标记对16尾红鳍东方鲀亲鱼(10尾♂,6尾♀)的有效等位基因数、观望杂合度、期望杂合度、多态信息含量、遗传相似性系数、遗传距离等进行了检测。据此设计了10对亲鱼配组,获得10个子代家系。其中母本中16和8号的平均有效等位基因数和平均期望杂合度较其他亲本高,将其分别与3个父本配组,其他则参照遗传距离进行配组。于次年,对F110个家系的体质量、体长均值进行了比对,发现16♀与11♂配组得到的子代体质量、体长均值为最大。8♀和10♂配组得到的子代体质量、体长均值最小。结果表明,红鳍东方鲀子代杂种优势与亲本个体差异有关。
- 谷晶晶朱迎军孟雪松孙效文
- 关键词：红鳍东方鲀微卫星
- 中华绒螯蟹部分基因组文库构建和微卫星位点的筛选被引量：15
- 2009年
- 利用磁珠富集和放射性杂交相结合构建了中华绒螯蟹基因组微卫星文库。并利用生物素标记的(GA)12探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与pGEM-T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后利用γ-32P同位素标记的(GA)12探针进行第二次筛选。结果共获得微卫星基因组文库1 500个菌,杂交前菌落PCR检测阳性克隆率为62.5(;杂交后得到的阳性克隆为447个,占29.8(。经测序,有248个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列。在得到的微卫星序列中,重复单元除GA/CT外,还观察到三碱基、四碱基重复单元。根据侧翼序列设计引物164对,选择合成50对,通过优化PCR反应条件,结果有21对引物可扩增出清晰可重复的目的条带,15对具有多态性。本研究对中华绒螯蟹基因组资源的开发利用提供了相关资料。
- 毛瑞鑫鲁翠云刘福军赵莹莹谷晶晶常玉梅梁利群孙效文
- 关键词：中华绒螯蟹微卫星磁珠富集
- 长江、珠江、黑龙江水系野生鲢遗传多样性的微卫星分析被引量：21
- 2009年
- 采用34个微卫星分子标记，对长江（湘江、监利、枞阳）、珠江、黑龙江（抚远）鲢共5个群体的观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He ）、多态信息含量（PIC）和有效等位基因数（Ne）等进行了遗传检测，根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离，以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡，以近交系数（FST）和基因流（Nm）分析群体的遗传分化。同时，基于Nei氏标准遗传距离获得NJ聚类图。共检测出154个等位基因，其中有80个共有基因。位点等位基因1～9个不等，平均等位基因4.666 7，平均有效等位基因2.948 9。5群体平均观测杂合度为0.329 5～0.461 9，平均期望杂合度为0.500 2～0.552 9，平均多态信息含量为0.443 5～0.493 0。表明5群体为中度多态，遗传多样性较低，且长江不同地理群体的遗传多样性也有差异，但差异不显著。通过群体间遗传相似性和遗传距离比较显示：长江3个群体间遗传相似系数最大，遗传距离最小；黑龙江与长江鲢群体间相似系数较大（平均0.871 8），遗传距离较小（平均0.137 4）表明二者遗传分化亦最小；珠江鲢与长江鲢间的相似系数最小（平均0.831 0），遗传距离最大（平均0.185 2），其遗传分化差异较大，结果未显现出群体间遗传差异的大小与其地理距离远近呈正相关。
- 姬长虹谷晶晶毛瑞鑫朱新平孙效文
- 关键词：微卫星
- 大菱鲆微卫星标记的分离及其多态性位点检测被引量：9
- 2009年
- 以生物素标记的（CA）12为探针进行杂交，借助磁珠筛选出含微卫星的Mbo I酶切片段，构建了大菱鲆Scophthalmus maximus微卫星富集文库，用同位素γ-^23P标记的探针（CA）12进行二次筛选，获得1600个阳性克隆，占59．3％。测序347个序列，得到335个（96．54％）含有微卫星序列的克隆，其中含有微卫星座位378个。完美型的微卫星序列有236个（62．4％），非完美型的有121个（32．0％），复合型的有21个（5．6％），从所得序列中分离和鉴定了32对微卫星标记。利用31尾大菱鲆养殖个体评价微卫星位点，分析表明，10个位点具有多态性。不同位点等位基因数目为3～11不等，期望杂合度（He）和多态信息含量（PIC）变动范围分别为0．5061—0．8995和0．4133～0．8742。本研究中开发的微卫星多态性较高，将为大菱鲆养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等打下基础。
- 顾颖郭忠宝谷晶晶毛瑞鑫鲁翠云孙效文
- 关键词：大菱鲆微卫星多态性磁珠
