魏帆
- 作品数：5 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院计算机网络信息中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学一般工业技术更多>>
- NWCHEM软件在生物体系中的应用
- 生物体系结构和功能比较复杂，对其进行简单的振动柔性分析，研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后，使用量子化学程序进行精确计算，再采用MFCC结合RE...
- 张宝花李国辉魏帆刘倩金钟迟学斌
- 关键词：并行计算多肽
- 文献传递网络资源链接
- 面向新一代高性能计算机的量子化学程序并行化框架
- <正>当前,新一代达到亿亿次量级的高性能计算机系统已经逐步浮出水面。在带来巨大的计算能力的同时也给传统的量子化学计算程序提出了新的挑战。高性能计算机系统的分布式内存结构、海量节点特征和广泛采用的异构化计算技术使基
- 魏帆张宝花刘倩金钟
- 文献传递
- 自洽场方法在Xeon Phi上的并行实现被引量：1
- 2014年
- 量子化学中,随着分子体系或所用基组的增大,计算量将显著增长。如何提高量子化学计算中的计算效率一直是研究的热点。随着计算机科学的发展,发挥计算机的多核优势提高量子化学的计算效率成为当前量子化学软件的通用方法。本文实现了自洽场方法 (Self-Consistent Field method,SCF)的单点能计算的OpenMP并行,并探索实现了在Intel Xeon Phi协处理器上的OpenMP并行方法。
- 万波魏帆金钟
- 关键词：量子化学SCFOPENMPXEONPHI
- NWCHEM软件在生物体系中的应用
- 2011年
- 生物体系结构和功能比较复杂,对其进行简单的振动柔性分析,研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后,使用量子化学程序进行精确计算,再采用MFCC结合REMD技术来研究生物体系精确作用问题。本文使用NWCHEM软件计算不同规模大小的"多肽"体系在深腾7000的不同架构节点上随处理器核数的加速效率,以确定大生物体系分割研究片段的大小和计算采取的处理器核数,并以此分析NWCHEM软件在生物体系研究中的适用性。
- 张宝花李国辉魏帆刘倩金钟迟学斌
- 关键词：并行计算多肽
- 面向高性能计算化学的专业计算社区
- 随着互联网和高性能计算机的快速发展,能够为计算化学研究提供更为强大的计算能力。网格技术的成熟,使得在不同地域的高性能计算集群间调度计算作业成为可能。我们基于为科学计算设计研发的'中国科学院超级计算环境',开
- 金钟魏帆张宝花刘倩
