刘医萌
- 作品数：57 被引量：232H指数：8
- 供职机构：北京市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：北京市优秀人才培养资助北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 一种检测新型冠状病毒的变异位点的引物组合物
- 本发明涉及分子生物学检测技术领域，具体提供了一种检测新型冠状病毒的变异位点的引物组合物及其应用。本发明还提供了一种SARS‑CoV‑2的变异位点的检测方法，所述的检测方法将特异性引物组合物、单碱基延伸反应以及基质辅助激光...
- 张代涛黄瑛张新沈玲羽潘阳梁志超冯兆民李夫吕冰崔淑娟刘医萌赵佳琛彭晓旻卢桂兰石伟先杨鹏王全意
- 2016-2017年北京市A组链球菌耐药特征及相关因素分析被引量：5
- 2018年
- 目的分析北京市2016—2017年A组链球菌耐药特征及相关影响因素。方法收集北京市2016—2017年16个区分离到的A组链球菌,定量测定青霉素和红霉素等12种抗生素对菌株的最低抑菌浓度(MIC)。结果共对243株A组链球菌进行耐药性检测,菌株对头孢噻肟、青霉素、美洛培南和利奈唑胺的敏感率均为100%;对头孢吡肟、万古霉素的敏感率均为99.18%;对左氧氟沙星和氧氟沙星的敏感率分别为97.53%和90.95%;对红霉素、克林霉素和四环素敏感率分别为1.65%、2.06%和2.88%。结论北京市A组链球菌对大环内酯类抗生素,克林霉素和四环素等仍维持较高的耐药率,对青霉素类、头孢菌素类和喹诺酮类抗生素保持敏感,青霉素仍为治疗该菌感染的首选药物。
- 张代涛杨鹏杨鹏张奕马春娜卢桂兰刘医萌赵佳琛王全意
- 关键词：A组溶血性链球菌药敏试验最低抑菌浓度
- 2007—2012年北京市流感样病例和流感病原学监测被引量：75
- 2013年
- 目的阐明2007—2012年北京市流行性感冒（流感）流行特征和病原学监测结果。方法使用“北京市医疗机构传染病监测预警系统”中二级以上医院流感样病例数和百分比的周数据以及流感病原学监测周数据，分析流感样病例发病趋势和流感病毒构成情况。结果2007—2012年，北京市二级以上医院共监测流感样病例3，045，527例，其中流感样病例百分比2．11％。期间共检测标本49，868件，检出阳性标本8，289件，其中甲型H1N1亚型573件（6．91％）、甲型H3N2亚型2，578件（31．10％）、甲型H1N1流感2，021件（24．38％）、B型Victoria系945件（11．40％）、B型Yamagada系681件（8．22％）。各年度流感病毒亚型构成不同：2007—2008年度主要为B型Yamaga—da系（60．36％）和甲型H3N2亚型（23．68％），2008—2009年度为甲型H1N1亚型（78．63％），2009—2010年度为甲型H1N1流感（40．28％）和甲型H3N2亚型（20．29％），2010—2011年度为甲型H3N2亚型（64．34％）和甲型H1N1流感（23．44％），2011—2012年度为B型Victoria系（57．28％）、B型Yamagada系（20．80％）和甲型H3N2亚型（18．66％），2012—2013年度为甲型H3N2亚型（77．40％）和甲型H1N1流感（20．36％）。结论近年来，甲型H1N1亚型、甲型H3N2亚型、甲型H1N1流感、B型Victoria系和B型Yamagada系均有流行，且各年度优势毒株不一。
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- 关键词：流感流感样病例
- 2016年北京市儿童腺病毒感染疫情的流行病学和病原学研究被引量：5
- 2019年
- 目的对2016年北京市儿童腺病毒感染暴发疫情及同期散发病例进行流行病调查和病原学分析,以了解腺病毒在北京市儿童的感染状况以及基因遗传特征。方法选取2016年10月下旬至12月初暴发疫情及同年9月21日至12月31日散发病例咽拭子样本,提取核酸进行hexon基因扩增,扩增产物经测序和比对后,采用MEGA 5.0软件进行基因进化树构建和分析。结果 2016年北京市报告的腺病毒暴发疫情均发生在小学。疫情1发生于10月底,累及11名病例,病例年龄均为9岁,罹患率为35.48%。疫情2发生于12月初,累及17名病例,病例年龄均为7岁,罹患率为37.78%。两起暴发疫情均由B组HAdV-3 (human adenovirus-3)型腺病毒导致。散发病例样本分型结果以B组HAdV-3型为主(11/16,68.75%),其余为C组HAdV-1 (1/16,6.25%)、5型(1/16,6.25%)、6型(2/16,12.50%)以及E组HAdV-4(1/16,6.25%)。序列比对和进化分析结果显示分离的暴发和同期散发病例分离HAdV-3型毒株hexon序列核苷酸和氨基酸的同源性均为100%,与国内分离株亲缘关系较近。结论目前北京市儿童腺病毒感染主要为B组HAdV-3导致,其hexon基因未见明显的变异。
- 卢桂兰石伟先张代涛刘医萌张莉孙瑛杨鹏王全意
- 关键词：儿童人腺病毒遗传进化分析
- 北京市儿童A族链球菌emm基因型别及药敏特征变化分析
- 2022年
- 目的了解北京市儿童A族链球菌(GAS)M蛋白基因(emm基因)型别及药敏特征变化。方法回顾性研究。收集2018年、2019年、2021年北京市16区猩红热病原学监测哨点医院儿童临床诊断猩红热及咽部感染病例咽拭子样本分离的GAS菌株。采用PCR扩增及测序进行emm基因分型,采用微量肉汤稀释法测定10种抗生素最低抑菌浓度(MIC)。采用χ^(2)检验和Fisher′s确切概率法进行组间比较。结果共收集GAS菌株557株,检测到11种emm基因型(emm1、emm3、emm4、emm6、emm11、emm12、emm22、emm75、emm89、emm128、emm212)。其中emm1型42.73%(238/557株),emm12型48.65%(271/557株),其他emm型8.62%(48/557株)。emm1、emm12、其他emm型2018年分别为37.50%(105/280株)、57.14%(160/280株)、5.36%(15/280株);2019年分别为49.05%(129/263株)、39.54%(104/263株)、11.41%(30/263株);2021年分别为28.57%(4/14株)、50.00%(7/14株)、21.43%(3/14株)。2018年和2019年≤6岁儿童组中感染emm12型的构成比均高于>6岁儿童组(62.50%比46.88%,46.36%比30.36%),差异均有统计学意义(χ^(2)=7.182、6.973,均P<0.05)。选取225株GAS进行药敏检测,结果对青霉素、左氧氟沙星、美罗培南、利奈唑胺、头孢噻肟、头孢吡肟、万古霉素7种抗生素敏感率均为100.00%,对红霉素、四环素、克林霉素的耐药率分别为:2018年88.57%(93/105株)、87.62%(92/105株)、86.67%(91/105株);2019年94.34%(100/106株)、94.34%(100/106株)、87.74%(93/106株);2021年3种抗生素耐药率100.00%(14/14株)。2018年青霉素MIC_(50)、MIC_(90)均为0.03 mg/L;2019年分别为0.03 mg/L、0.06 mg/L;2021年均为0.06 mg/L。225株GAS中207株存在耐药,且均为联合耐药,红霉素-四环素-克林霉素三重耐药占94.69%(196/207株),红霉素-克林霉素双重耐药占4.35%(9/207株),红霉素-四环素双重耐药占0.97%(2/207株)。结论北京市2018年、2019年、2021年儿童GAS的emm基因型别多样,优势基因型为emm12与emm1,以emm12为主导流行型别。GAS菌�
- 赵佳琛刘医萌彭晓旻崔淑娟卢桂兰石伟先马春娜李夫张代涛王全意杨鹏
- 关键词：A族链球菌药敏试验儿童
- 北京地区2015年11月-12月流感样病例中人腺病毒的感染情况分析被引量：3
- 2017年
- 目的了解北京地区2015年11月-12月流感样病例中人腺病毒感染情况及型别分布特征,为北京地区呼吸道病毒传染病防控策略的制定提供依据。方法选取2015年11月-12月的874份流感样病例,收集病例的临床资料,采集咽拭子样本,采用实时荧光PCR法,进行人腺病毒核酸筛查。核酸阳性的标本进行病毒的分离培养。之后对培养物提取核酸,进行hexon基因扩增,对扩增产物测序和序列比对;采用MEGA 5.0软件进行基因进化树构建和分析。结果874份样本中,共检出人腺病毒核酸阳性19份,阳性率为2.17%(19/874);15岁以下患者阳性检出率最高,为4.15%(13/313)。男、女病毒检出率差异无统计学意义(χ2=1.360,P>0.05)。成功分离到18株人腺病毒,序列比对和进化分析结果显示,人腺病毒基因型别分布为C组HAd V-1(3/18,16.67%)、HAd V-2(3/18,16.67%)、B组HAd V-3型(12/18,66.67%)。结论调查期间北京地区流感样病例中有3种型别的人腺病毒流行,主要流行为HAd V-3型。人腺病毒感染病例主要分布于15岁以下人群。
- 卢桂兰刘医萌崔淑娟张代涛王全意杨鹏
- 关键词：流感样病例人腺病毒
- 北京市Redondoviridae流行情况初步调查与分析
- 2023年
- 目的了解Redondoviridae在北京市流行情况、分析其流行特征。方法收集北京市健康人群及急性呼吸道感染病例,包括流感样病例、住院严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)病例的咽拭子样本,使用实时荧光PCR法进行核酸检测,对Redondoviridae阳性样本通过扩增测序,分析其种别,通过统计分析获得Redondoviridae年龄分布、性别分布及种别分布等流行特征。使用多重PCR法对流感样病例、SARI病例中Redondoviridae阳性样本进行其他常见呼吸道病原体检测,分析Redondoviridae的致病性。结果健康人群、急性呼吸道感染病例Redondoviridae阳性率分别为20.48%(189/923)、11.23%(43/390),差异具有统计学意义(χ^(2)=16.834,Ρ<0.001)。健康人群中男性阳性率高于女性,老年组阳性率高于成年组与未成年组,差异具有统计学意义(χ^(2)=11.061,Ρ<0.05;χ^(2)=10.088,Ρ<0.05)。急性呼吸道感染者中男性阳性率高于女性,但差异无统计学意义,未成年组阳性率低于老年组与成年组,差异具有统计学意义(χ^(2)=25.724,Ρ<0.05)。Redondoviridae阳性样本中Vientovirus占比高于Brisavirus,差异有统计学意义(P<0.05)。呼吸道感染病例咽拭子中有43例Redondoviridae阳性,其中24例未检测到其他病原体。结论Redondoviridae在北京市各年龄组健康人群中广泛存在,在急性呼吸道感染病例中也有发现,其检出阳性率在不同年龄、性别间存在差异。Vientovirus与Brisavirus两种病毒均有检出,Vientovirus占比明显高于Brisavirus。
- 赵佳琛刘医萌邹林彭晓旻卢桂兰钱城崔淑娟张代涛石伟先
- 关键词：流行病学分析
- 2010年北京市不同地区儿童甲3亚型流行性感冒暴发疫情的病原学分析被引量：1
- 2012年
- 目的:对2010年北京市某两区发生的儿童甲3亚型流行性感冒暴发疫情进行病原学研究。方法:荧光RT-PCR方法检测疫情患者标本,对核酸阳性者进行病毒培养;对毒株血凝素HA1基因进行序列比对和进化分析。结果:两起疫情标本甲3亚型流感病毒核酸阳性检出共14件;毒株共分离到6株。各疫情毒株同源性序列为100%;两起疫情的HA1序列同源性为97.3%。与疫苗株A/Perth/16/2009(H3N2)比较,其中疫情2分离株共有8个氨基酸(aa)变异。结论:两起疫情均为甲3亚型(H3N2)流感所致;同一起疫情均由同一病毒株传播所致;两起疫情甲3亚型(H3N2)毒株的血凝素HA1区存在不同程度的aa变异。
- 卢桂兰张代涛刘医萌吴占国任淑敏梁慧洁张莉吴双胜杨鹏
- 关键词：流行性感冒暴发疫情病原学分析
- 一种针对新冠病毒omicron株S蛋白的单域抗体VHH-3及编码序列和应用
- 本发明提供了一种针对新冠病毒omicron株S蛋白的特异性单域抗体及VHH‑3的基因序列和编码序列，同时还公开了omicron株单域抗体能够在真核细胞中高效表达，可应用于新冠病毒omicron株检测试剂的研发及靶向治疗。
- 崔淑娟刘医萌赵佳琛彭晓旻卢桂兰石伟先孙瑛段玮张娇娇潘阳张代涛杨鹏王全意
- 北京市2021-2022年流行季首起乙型流感疫情的血凝素基因分析被引量：4
- 2022年
- 目的分析2021—2022年流行季北京市首起乙型流感Victoria系(BV)疫情的病毒血凝素(HA)的基因变异和进化特征以及与流感疫苗株的匹配性。方法采集北京市朝阳区某小学乙型流感疫情流感样病例的咽拭子标本,提取核酸后利用二代测序技术进行测序分析。应用BioEdit分析HA基因的核苷酸和氨基酸变异位点,采用Mega 6.0软件中的NJ模式构建HA基因的遗传进化树并分析。结果通过二代测序获得了2株BV的HA基因全长序列。与本年度的疫苗株HA基因相比较,疫情株有9个氨基酸位点发生变异,其中6个变异位点位于3个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示疫情株HA基因位于Clade 1A.3a2分支,与2021—2022年度北半球推荐的流感疫苗株(B/Washington/02/2019)不在同一分支。结论本起BV疫情毒株的HA基因在抗原表位发生多处变异,必需加强BV流感的监测与变异规律分析,为BV防控策略的制定提供有力的数据支撑。
- 刘医萌潘阳彭晓旻赵佳琛石伟先冯兆民徐晖卢桂兰张代涛杨鹏王全意
- 关键词：乙型流感病毒HA基因基因变异
