单云晶
- 作品数:3 被引量:17H指数:2
- 供职机构:中国水产科学研究院黑龙江水产研究所更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划公益性行业(农业)科研专项国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 镜鲤头长及头长体长比性状的主效QTL挖掘被引量:2
- 2014年
- 为挖掘镜鲤头长及头长体长比性状的主效QTL区间,实验利用368个SSR、336个SNP标记对镜鲤良种后代杂交F1群体的68个个体进行基因型检测,运用JoinMap 4.0软件包构建遗传连锁图谱。该图谱包含535个分子标记并被分配到50个连锁群上,覆盖基因组总长度为2 244.66 cM,标记间平均距离为4.63 cM。利用MapQTL 5.0(interval mapping,IM)区间作图法进行QTL检测。结果显示,共得到2个与头长相关的QTL区间,分别分布在LG21和LG42,可解释型变异分别为28.2%、32.6%;6个与头长体长比性状相关的QTL位于LG8、LG15、LG18、LG21、LG39、LG40,可解释表型变异范围是16.4%-49.3%。全部QTL区间中贡献率大于20%的主效QTL有7个,HL-21和HL-42是头长性状的主效区间;HBR-8、HBR-15、HBR-21、HBR-39和HBR-40是头长体长比性状的主效QTL区间。利用SPSS的一般线性模型(GLM)针对另一群体进行验证,结果表明HLJ692与镜鲤头长体长比显著相关。
- 单云晶鲁翠云张晓峰李超程磊孙效文
- 关键词:镜鲤遗传连锁图谱
- 采用AFLP和SSR分析鲤生长不同阶段的遗传结构及遗传差异
- 在对鲤进行遗传多样性分析时,发现很多标记不平衡的现象;在对鲤进行QTL分析中和基于单家系的遗传作图中,发现了很多偏离平衡的位点,这说明某一种基因型严重偏离孟德尔平衡比例,对于这种现象出现的原因还不清楚。本研究利用高效的A...
- 单云晶
- 关键词:AFLPSSR不同生长阶段基因差异
- 文献传递
- 基于线粒体COI基因序列的5种鲤养殖品种遗传多样性研究被引量:15
- 2013年
- 本研究通过对5个鲤养殖品种即高寒鲤(Cyprinus carpio Frigid carp)、松浦鲤(Cyprinus carpio Songpu carp)、蓝鳞鲤(Cyprinus carpio blue var)、松浦镜鲤(Cyprinus carpio Songpu mirror carp)和红镜鲤(Cyprinus carpio Red mirror carp)的线粒体COI基因部分序列的测定, 比较并分析了其遗传多样性和系统进化关系。在5个鲤品种共100个样本的线粒体COI序列中检测到8种单倍型, 其中5个单倍型(H1、H2、H4、H5、H6)涵盖样本较多, 占总样本数的94.06%。蓝鳞鲤的单倍型数最少, 仅有1个, 红镜鲤单倍型数为2个, 其余3个品种的单倍型数均为5个。5个品种单倍型多样性(Hd)在0.160±0.070-0.811±0.055, 其中, 遗传多样性最高的为高寒鲤。AMOVA结果表明, 品种间变异(50.28%)略高于品种内变异(49.72%), 各品种间的FST值在0.711 4-0.831 2, 其中蓝鳞鲤与其他群体之间差异最大。用MEGA4.0软件构建的基于遗传距离的进化树表明, 5个养殖品种中, 高寒鲤和红镜鲤的遗传距离最近(D=0.31), 聚为一支; 松浦镜鲤和松浦鲤的遗传距离较近(D=0.33), 聚为一支; 蓝鳞鲤与其他品种存在较大遗传差异, 单独形成一个分支。除蓝鳞鲤外, 其余4个养殖品种间均存在共享的单倍型(H2、H4、H5、H6), 可能是由于其在选育过程中亲本的遗传背景存在交叉, 同时也证明DNA条码在分析种内品种间遗传关系时具有可行性但具有一定的局限性。
- 单云晶鲁翠云李超张明昭顾颖孙效文
- 关键词:DNA条形码COI基因