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海洋病毒生态学动态参数和研究技术的进展: 2011年; 病毒在海洋中无处不在,是海洋生态系统中丰度和基因多样性最高的生命粒子。病毒是海洋生态系统中的活跃分子,通过感染和裂解宿主细胞使生命颗粒有机碳再返回到非生命的溶解有机碳,形成了微食物环中的"病毒回路"。病毒丰度,多样性和分布是海洋病毒生态学研究中重要的基本参数,但是由于病毒对生态系统的影响是一个动态过程,上述静态参数无法满足病毒生态学研究的需要,因此对病毒生态过程中的动态参数进行研究有着至关重要的意义。文章介绍了近20年来海洋病毒生态学研究中的主要动态参数包括接触率、感染率、裂解量、病毒引起的宿主死亡率以及病毒自身的生产率和降解率的研究进展及相关研究技术。; 李黎徐宪忠; 关键词：海洋病毒生态研究动态参数

深海沉积物微生物宏基因组文库中IMP环水解酶的筛选及基因克隆被引量：1: 2011年; 为了解嘌呤合成途径的关键酶——IMP环水解酶的多样性,从深海沉积物样品中提取总DNA构建Cosmid宏基因组文库,从中筛选出一个具有IMP环水解酶活性的克隆(CAIMP1).通过基因步移的方法从CAIMP1的约35 kb的插入片段中扩增出长度为1 599 bp的完整的IMP环水解酶基因,该基因包含MGS和AICARFT_IMPCHas两个保守结构域.活性检测结果表明CAIMP1克隆的发酵液上清具有较强的IMP环水解酶活性.该酶与数据库中收录的IMP环水解酶的氨基酸序列同源性较低,系统发育分析也表明该酶与其它参照序列亲缘关系较远,表明该序列可能为一个新的IMP环水解酶基因.; 陈兴麟赵晶徐宪忠曾润颖; 关键词：深海沉积物宏基因组文库保守结构域

南极产碱性淀粉酶菌株NJ270的选育及酶学性质被引量：1: 2012年; 从南极中山站排污口沉积物样品中筛选到一株产碱性淀粉酶的耐冷菌株NJ270,结合形态学观察和16S rDNA序列分析表明该菌属于假单胞菌属(Pseudomonas).发酵试验发现添加淀粉能使产酶量提高8.42倍.采用硫酸铵沉淀、Q Sepharose XL离子交换层析和Sephadex G-75凝胶层析对假单胞菌NJ270淀粉酶进行了纯化,获得电泳纯的淀粉酶,SDS-PAGE检测结果表明该酶大小约为55 kDa.酶学性质研究表明其最适pH值为9.0,最适作用温度为50℃.在低于40℃的条件下具有较高的热稳定性,属于碱性中温淀粉酶.该酶可水解可溶性淀粉生成麦芽五糖.酶活力受多种金属离子和螯合剂的影响,其中Mg2+可使酶活力提高10%,而Fe3+、Co2+、Cu2+、Zn2+、Hg2+、EDTA则能抑制酶活性,抑制率均为60%左右.该酶的性质特征表明其在洗涤剂制造等工业生产中有一定的应用潜力.; 杨帆徐宪忠赵晶曾润颖; 关键词：海洋生物学碱性淀粉酶耐冷菌

粤东-闽南沿岸海域上升流区软水母亚纲一新种和一新记录的记述被引量：2: 2010年; 报道了2009年5月在粤东-闽南上升流区发现软水母亚纲（Leptomedusae Haeckel,1866）一新种,大腺触丝水母（Lovenella macrogonaLin,XuetHuang,sp.nov.）和我国海域一新记录,脆弱似杯水母[Phi-alella fragilis（Uchida,1938）].大腺触丝水母,新种的鉴别特征如下：伞半球形,外伞上有分散刺细胞,4个大的生殖腺,卵圆形,在辐管中部;4条主辐触手,触手球背部有块状黑色素,具有6~8对侧丝;4个大的间辐位缘疣,球形,具排泄乳突,背部有黑色素分布;24个平衡囊,每个平衡囊具1个平衡石.; 林茂徐宪忠王春光许振祖黄加祺; 关键词：海洋生物学软水母亚纲

10种蟹类18S rDNA和COⅠ基因序列分析及其分子系统发育研究被引量：1: 2012年; 应用分子系统发育学的方法,以蟹类18S rDNA和线粒体细胞色素C氧化酶亚单位[(COI)基因序列片段为分子标记,结合形态学特征对10种蟹类的分类地位进行探讨。实验共获得10条18S rDNA序列,长度为1780～1787 bp,其中A、T、G、C平均含量分别为23.72%,24.58%,24.52%和27,17%;通过序列对比,发现18S rDNA序列相对保守,只含有1个从88 bp到130 bp约5()bp的高可变区;物种澡碱基距离比较小,从0.001到0.017。18S rDNA系统发育树为方蟹总科、沙蟹总科和梭子蟹总科起源于同一海洋蟹类祖先提供了分子生物学证据,并且支持将厚蟹属从相手蟹科移至弓蟹科。获得的5条COI基因序列,长度均为709 bp,A、T、G、C平均含量分别为26.88%,37.62%,17.50%和18.00%;COI基因片段变异性高,物种澡碱基距离从0.016到0.138。COⅠ基因系统发育树真实地反映了蟳属各物种之间的进化关系,和传统分类非常吻合,为形态特征相似的蟳类鉴定提供了一种快速准确的方法。; 邢炳鹏林荣澄徐宪忠牛文涛; 关键词：蟹类分子系统发育

浅谈构建国家海洋科技创新体系被引量：2: 2009年; 文章分析构建国家海洋科技创新体系的意义和必要性,在此基础上提出了构建国家海洋创新体系的几点对策。; 徐宪忠; 关键词：海洋科技海洋发展战略

10种蟹类18S rDNA和COⅠ基因序列分析及其分子系统发育研究: 应用分子系统发育学的方法,以蟹类18S r DNA和线粒体细胞色素C氧化酶亚单位Ⅰ(COⅠ)基因序列片段为分子标记,结合形态学特征对10种蟹类的分类地位进行探讨。实验共获得10条18S r DNA序列,长度为1780~1...; 邢炳鹏林荣澄徐宪忠牛文涛; 关键词：蟹类分子系统发育; 文献传递

沉积物对珊瑚礁及礁区生物的影响被引量：15: 2010年; 海水中日益增多的悬浮物和泥沙沉降是导致珊瑚礁严重衰退的原因之一。沉积物覆盖在珊瑚礁生物表面,影响其呼吸作用,而海水浊度的增加会减少光合作用的可利用光。过多的沉积物改变了礁区的物理以及生物过程,从而对珊瑚礁生态系的结构和功能产生不利影响。为了有效评估珊瑚礁的变化趋势,如优势种丰度以及空间分布的变化等,应用标准的监测方法进行长期监测对于掌握这一复杂生态系统的变化是非常关键的。综述了沉积物对珊瑚生长率、生长形态、代谢和繁殖与补充以及礁区生物的影响,并指出未来的研究方向,以期为珊瑚礁的保护提供参考。; 牛文涛徐宪忠林荣澄黄丁勇; 关键词：珊瑚礁沉积物浊度

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徐宪忠