王月兰
- 作品数：21 被引量：64H指数：5
- 供职机构：军事医学科学院生物工程研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程军队医药卫生科研基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学农业科学更多>>
- 基于生物信息学的致病菌特有基因预测及分析
- 2010年
- 目的:利用生物信息学方法对致病菌特有基因进行大规模预测,同时探讨致病菌特有基因与致病菌毒力之间的关系。方法:构建致病性细菌蛋白质序列数据库和非致病性细菌蛋白质序列数据库,利用同源性比对的方法(BlastP工具)对致病菌特有基因进行预测;同时从文献中提取与致病菌毒力紧密相关的毒力因子,构建具有代表性的毒力因子分析库,对预测的致病菌特有基因进行比较分析。结果:在致病菌780310个基因中,预测了致病菌特有基因79166个,约占致病菌总基因的10.15%;预测的致病菌特有基因包含了构建的毒力因子分析库中的大部分毒力基因。结论:预测的致病菌特有基因与致病菌毒力紧密相关,大大减少了进一步在致病菌基因组中鉴定毒力基因时整个基因组的数据量。
- 牛超王月兰岳俊杰程义勇高志贤梁龙
- 关键词：毒力因子毒力
- 未知修饰病原菌确认及毒力、重组检测研究
- 未知病原菌是目前我们尚未发现、尚不了解的病原菌.它应该包括未发现或新发现的传染病病原菌、经天然突变致病性发生重大改变的病原菌,以及人工重组改构的生物恐怖及生物战剂病原菌.随着我国经济建设、国际交流及西部大开发的蓬勃发展,...
- 梁龙王月兰岳俊杰牛超
- 关键词：快速筛查
- 应用适应性进化研究SARS病毒的起源问题
- 引发SARS世界流行的人类SARS病毒的起源问题一直受到广泛关注,本研究目的在于应用适应性进化研究方法来研究人类SARS病毒的起源问题,通过对SARS病毒Spike蛋白和N蛋白正选择位点的研究,来检验果子狸是否是人类SA...
- 梁龙王月兰
- 关键词：SARS病毒SPIKE蛋白病毒感染
- 文献传递
- 蛋白质相互作用的生物信息学研究进展被引量：13
- 2006年
- 生命过程的分子基础在于生物分子之间的相互作用,其中蛋白质分子之间的相互作用占有极其重要的地位。研究蛋白质相互作用对于理解生命的真谛、探讨致病微生物的致病机理,以及研究新药提高人们的健康水平具有重要的作用。用生物信息学的方法研究蛋白质的相互作用已经取得了许多重要的成果,但也有很多问题还需解决。本文从蛋白质相互作用的数据库、预测方法、可预测蛋白质相互作用的网上服务、蛋白质相互作用网络等几方面,对蛋白质相互作用的生物信息学研究成果及其存在的问题做了概述。
- 任仙文李北平王月兰岳俊杰梁龙
- 关键词：蛋白质相互作用生物信息学
- 节杆菌K1108乙内酰脲酶三维结构的模建和分析被引量：5
- 2003年
- 利用同源模建技术,以节杆菌DSM3745乙内酰脲酶的晶体结构为模板,模建了节杆菌K1108乙内酰脲酶的三维结构。模建的节杆菌K1108乙内酰脲酶结构由一个中心的(α/β)8桶状结构域和富含β-折叠的结构域两个区域组成,富含β-折叠的结构域在中心(α/β)8桶状结构域的侧面,由分子的N端和C端组成。根据K1108乙内酰脲酶和其它酶在结构和活性部位的保守性,确定了K1108乙内酰脲酶的底物结合部位,并对酶的活性中心的特征进行了分析,对L-Hyd的底物选择性进行了解释。
- 岳俊杰王月兰周秀菊张惟材梁龙黄培堂
- 关键词：节杆菌乙内酰脲酶活性部位
- 生物胺受体配基结合区域及其位点的预测被引量：7
- 2005年
- 生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标,用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能,对于药物设计具有重要的指导意义。从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型,预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ,其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用,E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程,这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸。从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的motif,提出了父家族可变子家族保守motif概念,即父家族可变区中出现的子家族保守的motif。最后结合整体与局部分析结果分析了各motif的功能,预测了行使配基结合功能的motif及其相应位点,结果证明与突变实验结果有很好的吻合度。
- 郭志云张怀渝王月兰岳俊杰梁龙黄培堂
- 关键词：配基
- 中国北方汉族人群APOA5、ICAM-1、PPARs亚型基因多态与冠心病的关联研究
- 血脂水平是冠心病易感性的主要的决定因素，而载脂蛋白基因家族的基因对决定脂质水平起重要的作用，这些分子在表达水平或结构上的改变会导致脂质水平异常，并易患动脉粥样硬化。2001年一种新的载脂蛋白基因—载脂蛋白A5基因(APO...
- 王月兰
- 关键词：单核苷酸多态单体型冠心病
- 文献传递
- 胰岛素受体胞外区三维结构的模建及结构功能关系被引量：2
- 2002年
- 利用计算机辅助分子设计技术模建了人胰岛素受体α亚基N端三个结构域的空间结构。实验研究证明胰岛素受体结合胰岛素的主要决定要素在这三个结构域。在模建的结构中,三个结构域围成了一个很大的开放的空洞,这个空洞的体积大小足以容纳一个胰岛素分子,这个空洞可能就是胰岛素受体与底物的作用的部位。另外,突变实验研究表明在胰岛素受体中有一个结合底物的“footprint”,由4个在一级结构上不连续的片段组成。从三维结构角度看,这4个片段中,有3个出现在邻近的平行折叠股。在我们的模型中,胰岛素受体分子中有一个两性表面,这个表面位于L1结构域,并且面向三个结构域围成的空洞。这个表面可能就是受体识别胰岛素和与底物发生初始作用的部位。“foot-print”和两性表面的大部分残基是相同的。
- 岳俊杰梁龙王月兰俞炜源黄培堂
- 关键词：胰岛素受体
- SARS病毒S蛋白三维结构预测被引量：6
- 2003年
- 蛋白质结构类型识别方法可以在没有序列同源性的蛋白质之间检测有没有结构相似性。利用蛋白质结构类型识别方法预测了SARS病毒S蛋白N端区域的结构。模建的SARS病毒S蛋白N端区域是一个全折叠的结构。
- 岳俊杰汪莉王月兰李北平梁龙俞炜源黄培堂
- 关键词：SARS病毒S蛋白
- 幽门螺杆菌TNF-α诱导蛋白的生物信息学分析被引量：6
- 2009年
- 肿瘤坏死因子诱导蛋白Tipα是幽门螺杆菌特有的一个膜相关蛋白。它可以激活核因子κB,并诱导多种细胞因子和趋化因子的表达,导致胃炎和随后的肿瘤发生。它是幽门螺杆菌和胃癌发生之间的关键分子。本文利用生物信息学工具分析Tipα序列,预测其信号肽、跨膜区、疏水性、二级结构、三级结构等性质。结果:Tipα具有一段信号肽、脂蛋白信号肽酶切位点及脂盒模体。另外该蛋白没有跨膜区,可能是一个外周膜蛋白。Tipα的三级结构说明,该蛋白形成了一个致密的球状结构,Tipα的二级结构以α螺旋为主。
- 岳俊杰谭明峰李北平牛超周围王月兰梁龙
- 关键词：肿瘤坏死因子-Α诱导蛋白生物信息学
