王桢
- 作品数：7 被引量：13H指数：2
- 供职机构：国家海洋局第一海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学天文地球更多>>
- 北极海洋沉积物中可培养细菌及其多样性分析
- 王桢李阳车帅林学政
- 关键词：海洋沉积物细菌多样性系统发育分析
- 北极海冰细菌Pseudoalteromonas issachenkonii A2的基因组学和转录组学的初步研究
- 以北极海冰细菌Pseudoalteromonas issachenkonii A2为研究对象,通过基因组和转录组测序研究其与抗氧胁迫适应相关的关键功能基因.基因组测序表明,该菌株基因组全长4176861bp,包含一个rR...
- 王桢李阳车帅林学政
- 南极适冷菌Psychrobacter sp.G冷激蛋白基因Csp2039的表达分析被引量：1
- 2016年
- 以南极适冷菌Psychrobacter sp.G为研究对象,利用qRT-PCR和Western blot技术从转录水平和翻译水平对冷激蛋白基因Csp2039在不同温度/盐度胁迫条件下的表达特征进行了研究。在转录水平上,qRT-PCR分析表明,冷激蛋白基因Csp2039的表达于6h时显著被低温(0℃,10℃)和高温(30℃)诱导;低盐(0)胁迫下,基因Csp2039的表达先被诱导后被抑制,在盐度为15的胁迫下,基因Csp2039的表达均被诱导,高盐(90,120)时基因Csp2039的表达在6h时显著被诱导;在温度和盐度协同胁迫条件下,温度为0℃时,无论盐度高低,基因Csp2039的表达均显著上升,而高温(30℃)时,除2h被低盐诱导以外,其余条件下均显著被抑制。在翻译水平上,Western blot分析表明,冷激蛋白Csp2039的表达被低温(0℃,10℃)显著诱导,但高温(30℃)对其抑制并不明显;在低盐(0,15)胁迫下,Csp2039蛋白的表达均被诱导,高盐(90)胁迫下,Csp2039蛋白的表达先被抑制,然后逐渐升高;在温度和盐度协同胁迫条件下,低温(0℃)时,当盐度为15时,Csp2039蛋白的表达被诱导,盐度为90时,Csp2039蛋白的表达量被显著抑制;而高温(30℃)时,该蛋白在盐度15时6h的表达量最大,盐度90时于6h其表达被显著抑制。比较分析表明,在转录水平上基因Csp2039表达量的变化更容易受温度影响,而在翻译水平上盐度对Csp2039蛋白的影响作用大于温度;基因Csp2039在翻译水平上对温度/盐度胁迫的应答时间要迟于转录水平的。
- 李阳车帅王桢林学政
- 关键词：PSYCHROBACTERQRT-PCRWESTERNBLOT
- 北极海洋沉积物高抗氧化活性菌株的筛选及其多样性分析被引量：2
- 2015年
- 利用过氧化氢耐受性实验对北极海洋沉积物中具有高抗氧化活性的菌株进行初筛,通过其对DPPH(1,1-二苯基-2-三硝基苯肼)自由基、羟自由基和超氧阴离子清除能力的测定进一步验证其抗氧化能力;并对其进行了分子鉴定与系统发育分析。根据过氧化氢耐受性实验,从145株供测菌株中筛选出25株对过氧化氢具有较强耐受性的抗氧化活性菌株,占总供测菌株的17.2%;其对DPPH自由基、羟自由基和超氧阴离子均具有较强的清除能力,可分别高达84.15%,88.61%和45.77%。基于16SrRNA基因的分子鉴定与系统发育分析表明,筛选出的25株活性菌株多样性较高,分别属于细菌域的5个纲,15个属,20个种;其中以γ-Proteobactria纲的菌株数量最多。北极海域的海洋沉积物中存在着丰富的具抗氧化活性的菌株资源,将为了解极地微生物的抗氧胁迫机制及极地来源的新型生物活性物质的研发打下一定的基础。
- 王桢李阳车帅林学政
- 关键词：海洋沉积物抗氧化活性系统发育分析
- 北极海洋抗氧化活性菌株多样性及Pseudoalteromonassp.A2的氧胁迫转录组分析
- 特殊的地理、环境和气候特征造就了独特的极地微生物生态系统。极区海水中的高溶解氧、UV-B辐射和冷胁迫等多个因素决定了氧胁迫是影响极地微生物生存与生长的重要因子之一。本文对北极海洋中具有较高抗氧化活性菌株的多样性进行了分析...
- 王桢
- 关键词：抗氧化活性系统发育功能基因
- 文献传递
- 北极海洋沉积物中可培养细菌及其多样性分析
- 北极地区蕴含着丰富的微生物种质资源,由于其特殊的地理位置和气候条件,生存于处于其中的微生物大多有其特殊的生理生化特性和代谢特征。由于数万年的沉积作用,深海沉积物所含成分繁复,是非常复杂的微生物栖息地。有机质是微生物所能利...
- 王桢李阳车帅林学政
- 关键词：海洋沉积物细菌多样性系统发育分析
- 文献传递
- 北极海洋沉积物中可培养细菌及其多样性分析被引量：10
- 2014年
- 利用Zobell 2216E培养基和涂布平板法对北极海洋沉积物中可培养细菌进行分离纯化,并利用16SrRNA基因进行分子鉴定与系统发育分析。根据菌落形态学特征,从59个站点的沉积物样品中共分离纯化获得570株细菌;基于16SrRNA基因的分子鉴定与系统发育分析表明,分离到的可培养细菌分别属于细菌域的4个门,5个纲,12个目,23个科,47个属,102个种,其中γ-Proteobactria占绝大多数;有14株菌株与模式菌株的16SrRNA基因序列相似性小于97%,为6个潜在的新种。北极海域的海洋沉积物中存在着丰富的微生物种质资源,为开发新型生物活性物质和特殊功能基因打下了基础。
- 王桢李阳车帅林学政
- 关键词：海洋沉积物细菌多样性系统发育分析
