邵晨
- 作品数：14 被引量：32H指数：3
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学理学环境科学与工程更多>>
- 机器学习方法预测PDZ结构域的结合蛋白
- PDZ结构域特异地结合配体蛋白C末端的3-7个氨基酸残基。我们收集了613种PDZ(swissprot52.1)和文献报道的105种PDZ的338对相互作用信息,选取了PDZ上23个决定相互作用的位点及配体C末端的8位氨...
- 张玲邵晨高友鹤
- 文献传递
- 机器学习方法预测蛋白质相互作用应用Logistic回归提高质谱多肽鉴定的准确度
- 蛋白质组学成为后基因组时代的热点学科。生物质谱、蛋白质芯片等高通量实验技术的发明极大地推动了蛋白质组学的发展。本文致力于通过生物信息学的方法,进一步提高当前高通量实验技术的效率和精确程度,以更低的实验代价,获得更加全面、...
- 邵晨
- 关键词：蛋白质组学串联质谱机器学习算法
- 文献传递
- MedPortal:面向精准医学的生物医学本体资源存储和应用平台被引量：8
- 2017年
- 在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中。本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加。为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应用平台。通过复用NCBO BioPortal技术,搭建MedPotal软件框架。遴选精准医学相关本体,建立本体资源库。对原框架中的代码和本体处理工具进行修正和完善,使之能够在本体稳定运行的基础上满足大批量数据的自动化处理。目前,该平台已整合42个生物医学本体,建立了本体之间术语映射关系,通过页面和REST API方式,提供术语检索、本体映射、数据标准化注释等本体应用服务(http://medportal.bmicc.cn)。MedPortal本体平台将为生物医学数据整合提供帮助。
- 郭靖文杨晟史涪仁邵晨张璐璐王恒杨啸林
- 关键词：数据库本体映射
- The urinary protein biomarker database
- 尿蛋白作为疾病标志物来源，可无创、大量地获得，可直接反映肾脏、膀胱等泌尿系统的变化，能够在一定程度上反映血液的变化,因此也可以用来研究全身系统性的疾病。然而尿蛋白标志物蛋白质组实验的重复性很低，绝大部分标志物都只被鉴定一...
- 邵晨
- 关键词：疾病诊断尿蛋白质谱技术数据库
- 尿蛋白质组学在疾病标志物研究中的应用被引量：3
- 2010年
- 尿液是重要的疾病标志物来源.本文介绍了当前尿蛋白质组学的研究进展和尿液中疾病标志物研究的主要问题,并对未来的发展进行了展望.由于实际的临床问题通常是对症状相似的多种疾病进行鉴别诊断,仅仅比较某一种疾病组和健康人对照组的尿蛋白质组差异不足以找到具有诊断能力的标志物.另外,尿蛋白质组在个体间和同一个体的不同生理条件下的变化也为疾病标志物的寻找带来了困难.本文提出,进行正常人群个体间和不同生理条件下尿蛋白质变化范围的研究可以为鉴定疾病标志物提供参考标准,从而帮助研究者发现由疾病、而不是生理学差异引起的蛋白的变化.比较蛋白在血浆和尿液中丰度的变化可以揭示肾脏的生理学功能和发现疾病标志物.最后提出,建立一个数据共享平台,收集和整合已有的疾病标志物研发成果,将大大推动尿蛋白质组研究的发展.
- 邵晨王燕高友鹤
- 关键词：尿液蛋白质组学疾病标志物
- 尿液中冠心病的蛋白标志物及其用途
- 本发明公开了尿液中冠心病的蛋白标志物及其用途。进一步地，本发明公开了选自以下的蛋白的鉴定试剂在制备用于诊断受试者的冠心病的试剂中的用途：TFF1、APOD及其组合。本发明公开的两种蛋白在冠心病的大规模筛选具有较好的应用前...
- 孙伟曾勇孙海丹王丹琪刘东方郭正光邵晨
- Opportunities and Challenges for Urinary Biomarker Discovery Using Proteomic Approaches
- In comparison to other biofluid and tissue samples,urine has some unique advantages that make it a suitable so...
- 邵晨
- 尿蛋白标志物数据库--现状和未来
- 本文讲述了收集所有尿液中的蛋白标志物的相关研究，分析了帮助研究者判断自己发现的标志物的特异性和灵敏度，从数据库看尿蛋白标志物研究的现状，尿液中可检出非泌尿系统疾病的潜在标志物，收录了大量的高通量实验结果，有可能成为数据挖...
- 邵晨
- 关键词：尿液蛋白标志物数据库数据挖掘
- 尿液中心肌梗死的蛋白标志物及其在诊断和预后中的用途
- 本发明涉及尿液中心肌梗死的蛋白标志物及其在诊断和预后中的用途。具体而言，本发明涉及选自以下的蛋白的鉴定试剂在制备用于诊断和/或预后受试者的心肌梗死的试剂中的用途：抗凝血酶‑III、补体C3、α‑1‑酸性糖蛋白1、血清转铁...
- 孙伟郭正光孙海丹邹莉丽邵晨杨晔宏
- 文献传递
- 尿液中冠心病的蛋白标志物及其用途
- 本发明公开了尿液中冠心病的蛋白标志物及其用途。进一步地，本发明公开了选自以下的蛋白的鉴定试剂在制备用于诊断受试者的冠心病的试剂中的用途：TFF1、APOD及其组合。本发明公开的两种蛋白在冠心病的大规模筛选具有较好的应用前...
- 孙伟曾勇孙海丹王丹琪刘东方郭正光邵晨
- 文献传递
