郑伟贤
- 作品数：7 被引量：11H指数：2
- 供职机构：宁波大学海洋学院应用海洋生物技术教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金浙江省科技厅创新团队建设与人才培养项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 鲈鱼TauT基因的cDNA克隆及组织表达
- 牛磺酸转运蛋白(taurine transporter， TauT)，也命名为solutecarrierfamily6,member6(SLC6A6)，是Na+和Cl-依赖型转运蛋白中的一种，胞内牛磺酸主要来源于TauT...
- 郑伟贤
- 关键词：鲈鱼CDNA克隆
- 文献传递
- 鲈鱼ZnT基因的cDNA克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 锌转运蛋白(zinc transporters,Zn T)在细胞锌的储藏,释放和分布中起了重要的作用。运用RT-PCR和SMART RACE方法从鲈鱼肝脏克隆得到了鲈鱼Zn T基因全长c DNA序列。结果显示,鲈鱼Zn T全长为1747 bp,包括5'非翻译区84 bp,3'非翻译区490 bp,开放阅读框1173 bp,可编码390个氨基酸。生物信息学分析表明该蛋白有6次跨膜结构,N端和C端均位于细胞膜内侧,第IV和第V跨膜区之间的环富含组氨酸。鲈鱼Zn T的氨基酸序列与其他生物的Zn T7序列有高度的相似性:斑马鱼,85.6%;大西洋鲑,85.4%;红鳍东方鲀,84.3%;人,75.1%;小鼠,73.8%。聚类分析显示鲈鱼Zn T首先与其它鱼类和人Zn T7成一簇,再与鱼的其他类别Zn T聚合,说明分离到的鲈鱼Zn T为Zn T7。
- 舒欢欢郑伟贤钱云霞
- 关键词：鲈鱼克隆
- 鲈3种视黄醇类X受体基因cDNA的克隆和组织表达被引量：2
- 2011年
- 视黄醇类X受体(retinoid X receptor,RXR)属于配体激活的核受体家族,在调节细胞内各种信号途径中起重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,分离到鲈RXR基因3种亚型RXRα、RXRβ和RXRγ的cDNA序列。结果表明,得到的RXRα是长度为1 686 bp 3'末端不完整的cDNA序列,其中包括364 bp的5'非翻译区和1 322 bp的编码序列,可编码440个氨基酸。RXRβcDNA全长为1 741 bp,其中包括150 bp的5'非翻译区,256 bp的3'非翻译区和1 335 bp的开放阅读框,共编码444个氨基酸,理论分子量为49.5 ku。RXRγcDNA全长为1 847 bp,其中5'非翻译区为88 bp,3'非翻译区为397 bp,开放阅读框为1 362 bp,共编码453个氨基酸,分子量约为49.9 ku。氨基酸序列分析显示,鲈RXRα、RXRβ和RXRγ和其它物种的RXRs结构类似,在DNA结合区有P box和D box结构,配体结合区包括12个α螺旋和2个β折叠结构,H12的C端含有AF-2的激活区。系统进化树分析表明,鲈RXRα、RXRβ和RXRγ分别与其他动物的相应亚型聚类。组织分布特异性研究表明,鲈RXRα在肌肉、心脏、眼、大脑、肠、肾脏、脂肪、脾脏、鳃和肝脏10种组织中均有表达,但表达量较低;RXRβ在这10组织中都有较高表达,但心脏中表达量较低;在所检测的10种组织中,RXRγ都有表达,在肌肉、肠、肾脏、脂肪和脾脏表达量较高。
- 童彩环钱云霞郑伟贤
- 关键词：克隆
- 鲈鱼CPTⅠ基因cDNA克隆及表达分析被引量：1
- 2012年
- 肉毒碱棕榈酰转移酶(carnitine palmitoyltransferases,CPT,EC.2.3.1.2)在脂肪酸的β-氧化中起重要作用。线粒体内膜外侧的脂酰CoA经CPTⅠ催化与肉毒碱结合形成脂酰肉毒碱而得以穿过线粒体内膜,进入线粒体。在线粒体内膜内侧的CPTⅡ催化下,脂酰肉毒碱上的脂酰基又转移到CoA上,重新形成脂酰CoA,成为β-氧化的底物。利用RT-PCR和SMART RACE的方法从鲈鱼(Lateolabrax japonicus)肝脏中克隆了CPT I全长cDNA。该序列全长3007 bp,5'非翻译区166 bp、3'非翻译区477 bp、开放阅读框2364 bp,编码一个由787个氨基酸组成的蛋白质,分子量为89.60 kDa,等电点为8.85。氨基酸序列分析表明,鲈鱼CPT I具有较高的保守性,与金头鲷(Sparus aurata)、虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、斑马鱼(Danio rerio)、人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)等7个物种的同源性为93%～66%,其中与金头鲷同源性最高,为93%。用RT-PCR分析CPT I基因在10个组织中的表达,结果表明在肌、肾中有较高的表达,心、脑、鳃、肝、肠次之,眼、脂肪、脾表达最低。
- 郑伟贤钱云霞童丽娟
- 关键词：鲈鱼克隆
- 鲈鱼视黄酸受体α和视黄酸受体γ cDNA克隆和基因表达分析被引量：1
- 2012年
- 本文旨在研究鲈鱼视黄酸受体α(RARα)和视黄酸受体γ(RARγ)的结构及其基因的组织表达特点。采用反转录PCR和cDNA末端快速克隆(RACE)技术,从鲈鱼肝脏中克隆得到RARα和RARγ全长cDNA序列。检测鲈鱼肝脏、肌肉、心脏、眼、肠、肾脏、脂肪、脾脏、鳃和大脑10个组织中RARα和RARγ基因的表达情况。结果表明:1)鲈鱼RARαcDNA全长2 094 bp,5'端和3'端的非翻译区分别为124和608 bp,开放阅读框为1 362 bp,推测编码453个氨基酸,分子质量为50.64 ku,理论等电点为8.20。2)RARγcDNA全长1 671 bp,其中包括36 bp的5'端非翻译区、129 bp的3'端的非翻译区和1 506 bp的开放阅读框,共编码501个氨基酸,分子质量为56.20 ku,理论等电点为4.96。3)鲈鱼RARα和RARγ都具有典型的核受体结构,两者氨基酸序列同源性高达63.1%。鲈鱼的RARα和RARγ与红鳍东方鲀有较高的同源性,分别为96.9%和95.2%。4)RARα和RARγ基因在所有检测组织中均有表达,其中RARα基因在心脏和大脑中表达较少,在眼、鳃和肠中表达较高,而RARγ基因仅在鳃和脾脏中有较高表达。总之,本试验成功克隆了鲈鱼RARα和RARγ的全长cDNA;鲈鱼RARα和RARγ有着典型的核受体结构,在各组织中广泛分布。
- 钱云霞韩柳童彩环郑伟贤
- 关键词：维生素A视黄酸受体克隆鲈鱼
- 鲈鱼FBP基因的克隆和表达分析
- 2012年
- 果糖-1,6-二磷酸酶(fructose-1,6-bisphosphatase,FBP,EC 3.1.3.11)可催化果糖-1,6-二磷酸水解成果糖-6-磷酸和无机磷酸盐,是糖异生途径中的关键酶之一。本研究运用SMART RACE技术从鲈鱼Lateolabrax japonicus肝脏中分离克隆了FBP基因的全长cDNA序列,该基因全长1 357bp,其中5’非翻译区和3’非翻译区分别为42bp和301bp,开放阅读框为1 014bp,共编码337个氨基酸。蛋白质分子量约为36.7kD,理论pI为6.90。氨基酸序列分析表明,鲈鱼FBP与其它动物的肝脏型FBP相似性很高,与裸盖鱼、彩虹胡瓜鱼、斑马鱼、异育银鲫和大西洋鲑的肝脏型FBP的同源性分别为94.3%,90.8%,89.3%,88.1%和84.1%。系统发育分析显示,鲈鱼FBP与其它鱼类的肝脏型FBP成簇后再与哺乳动物的肝脏型FBP聚成一支,然后才与哺乳动物的肌肉型FBP汇成簇。同时用RT-PCR分析了FBP基因在鲈鱼肝脏、肌肉、心脏、眼、肠、肾脏、脂肪、脾脏、鳃和大脑等10个组织的表达,结果表明FBP仅在肝脏、肾脏和肠这3个组织中有较高的表达,与糖异生发生组织基本一致,因此推测该FBP属于肝脏型。
- 童彩环钱云霞郑伟贤韩柳
- 关键词：鲈鱼克隆
