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陈昱东
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
供职机构:
中国计量学院理学院
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发文基金:
浙江省“钱江人才计划”
浙江省自然科学基金
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相关领域:
理学
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合作作者
何志兴
中国计量学院理学院
徐鹏
中国计量学院理学院
姜舟婷
中国计量学院理学院
王亚楠
中国计量学院理学院
孙婷婷
浙江工商大学信息与电子工程学院
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分子动力学模...
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白质
机构
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浙江工商大学
作者
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孙婷婷
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王亚楠
1篇
姜舟婷
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徐鹏
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陈昱东
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何志兴
传媒
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高分子学报
年份
1篇
2014
共
1
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全α蛋白质体系能量转变的分子动力学模拟
被引量:3
2014年
采用简化的NHP模型并考虑蛋白质链的二级结构信息,对全α型蛋白质链进行构建.利用分子动力学模拟研究全α蛋白质体系势能的变化情况,得出键伸缩和弯曲能量随蛋白质的链长线性增加;单键的伸缩能和弯曲能随着温度的升高而线性增加,且伸缩能比弯曲能随温度的增加更为明显的结论.键扭转能随二级结构α螺旋数目的增加而线性降低,随温度的上升,扭转能变化呈现先增加后减少的趋势.非键能的大小随疏水残基在蛋白质组分中的比例增加而降低,但线性关系不明显.键扭转能和非键能都存在转变温度.蛋白质链的结构是由多种势能协同作用的结果,键能和非键能的相互竞争以及组成蛋白质链的氨基酸亲疏水性和二级结构组分都会影响蛋白质体系的能量,这些结果对深入理解蛋白质的结构提供理论依据.
姜舟婷
孙婷婷
王亚楠
陈昱东
何志兴
徐鹏
关键词:
分子动力学模拟
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