刘新宇
- 作品数：6 被引量：26H指数：3
- 供职机构：四川大学华西医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金四川省应用基础研究计划项目教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 用电喷雾质谱和特异PCR初步鉴定粳稻GluB蛋白突变体
- 2008年
- 用十二烷基硫酸钠.聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)方法对采集于中国、日本、印尼、老挝的42份特异粳稻资源进行了分析。结果显示,在编号为 B104的粳稻中有谷蛋白亚家族 GluB 基因沉默现象。将对照材料 B90的对应蛋白进行回收染色、原位酶解,然后利用电喷雾-四极杆飞行时间质谱(ESI-Q-TOF-MS)技术进行鉴定分析。用 MASCOT 数据库进行比对的结果显示,该蛋白的推测分子量为54kD,被包括 GluB2、GluB4、GluB7等基因在内的 GluB 亚家族基因编码。为了深入探讨 GluB 蛋白的突变机制,设计了2对特异引物,以 B90为对照,用基因组 PCR 方法来钓取并鉴定其中的 GluB4和 GluB7基因。鉴定结果表明 GluB7基因在 DNA 水平上未发生变化,而 GluB4基因发生了点突变,导致一个氨基酸的变异。研究证实,电喷雾电离质谱(ESI-MS)可以用来辅助解析植物蛋白质的复合体。
- 刘成蔡光泽杨足君刘新宇周建平雷孟平李霜蓉任正隆
- 关键词：粳稻谷蛋白突变体点突变质谱分析特异PCR
- 锐性开通技术在血液透析相关中心静脉闭塞性疾病中的临床应用被引量：9
- 2019年
- 本研究拟回顾性评估锐性开通技术在治疗中心静脉闭塞性疾病(central venous obstructive disease,CVOD)中的有效性及安全性。收集2015年1月至2016年12月期间于四川大学华西医院诊断CVOD且在中心静脉血管成形中使用锐性开通技术的维持性血液透析(maintenance hemodialysis,MHD)患者。治疗指征:中心静脉闭塞导致的动静脉内瘘障碍。记录患者一般资料、影像学特点、治疗指征、手术成功率、并发症等有效性与安全性指标,进行分析并随访。结果发现,共有19例CVOD患者使用锐性开通术,手术成功率为94.7%(18/19),1例患者因右锁骨下静脉伴右无名静脉闭塞而未能开通,所有患者均未出现气胸、血胸、动脉损伤等并发症。本研究初步总结了锐性开通在MHD合并CVOD患者中的诊治经验,认为该技术具有一定的手术风险与技术难度,需在具有丰富介入操作经验的情况下谨慎开展。
- 刘新宇刘新宇于洋李洪李洪李洪
- 关键词：肾透析血管通路
- 成年大鼠急性脊髓全横断损伤后差异表达蛋白的蛋白组学研究被引量：3
- 2008年
- 为进一步阐明脊髓损伤(SCI)的修复机制,对SD成年大鼠进行急性全横断损伤,将损伤前后的大鼠脊髓总蛋白质进行固相pH梯度双向凝胶电泳(2D-PAGE),经考马斯亮蓝染色后,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出38种蛋白质.其中表达上调的蛋白质有电压依赖的阴离子选择通道蛋白1、α-烯醇酶、硫氧还蛋白依赖的过氧化物还原酶3、生长因子受体结合蛋白2等,表达下调的蛋白质有谷氨酰胺合成酶、14-3-3 epsilon、磷脂酰乙醇胺结合蛋白1、血红蛋白-β1等.鉴定出的差异蛋白多数涉及到神经细胞的增殖、凋亡、应激反应等过程.
- 谢玲林胡火珍杨明理刘新宇
- 关键词：急性脊髓损伤差异表达蛋白质
- 脊髓全横断损伤后差异表达蛋白的蛋白质组学分析被引量：8
- 2007年
- 对脊髓全横断损伤前后的大鼠脊髓全蛋白质进行双向凝胶电泳,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱,对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出18种蛋白质.脊髓损伤3d后表达上调的蛋白质有巨噬细胞游走抑制因子、S期激酶相关蛋白1、热休克蛋白27、多配体蛋白聚糖3、T细胞受体β链可变区、膜联蛋白Ⅲ、腺苷酸激酶1、半乳凝素3、丙酮酸脱氢酶、磷脂酶B、嗜铬粒蛋白A、热休克蛋白70凝结蛋白1;同时表达下调的蛋白质有磷酸丙糖异构酶、神经鞘氨醇磷酸化受体、热休克蛋白10、肽酰-脯氨酰-顺反式异构酶A.多数差异蛋白质涉及到神经细胞的增殖、凋亡、应激反应等过程,为进一步阐明中枢神经系统的损伤和修复机制提供了理论依据.
- 杨明理刘新宇杨金亮王黎明张勇刚胡火珍
- 关键词：差异表达蛋白质双向电泳蛋白质组学
- 汉、藏族肺结核患者血清差异蛋白质的质谱分析被引量：4
- 2010年
- 目的用表面增强激光解析电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术比较汉、藏族肺结核患者之间及其与相应的非结核对照者之间的血清差异蛋白,以寻找各自的质谱诊断模型并比较两个民族肺结核的蛋白质差异。方法收集2008年6月至2009年3月四川大学华西医院呼吸科结核病区、西藏自治区驻成都办事处医院内科、成都市传染病医院和成都市结核病防治研究院内科住院患者及门诊健康体检者共154份血清样本,其中87例活动性肺结核患者(汉族38例,藏族49例),67例非结核对照(汉族36例,藏族31例)。SELDI-TOF MS质谱分析分为训练组和测试组:训练组包含53例肺结核(汉族23例,藏族30例)和42例非结核对照(汉族20例,藏族22例),所获得的血清质谱用决策树的学习算法来进行分析,得到的诊断模型再用另一个独立的测试组来进行准确性验证,测试组包含59份血清样本:34例肺结核(汉族15例,藏族19例),25例非结核对照(汉族16例,藏族9例)。结果训练组中得到的诊断模型质荷比(m/z)为3193.61、4592.11可以诊断出20/23例汉族肺结核和17/20例汉族对照,准确度86.04%(敏感性为86.95%,特异性为85.00%),模型m/z为4821.45能够诊断出28/30例藏族肺结核和19/22例藏族对照,准确度90.38%(敏感性93.33%,特异性86.36%),而模型m/z为4091.98、3398.27、7970.44、4965.51、7970.44则能够将藏族肺结核从汉族患者中区分出来(准确度92.45%)。在相应的验证组中,3个诊断模型的准确度分别为70.96%、71.42%和67.92%。同时发现藏、汉族肺结核之间有16个差异蛋白峰。结论SELDI-TOF MS对汉、藏族肺结核的诊断均具有较高价值,两个民族的肺结核患者存在一定的蛋白质表达差异。
- 刘琦刘新宇张仁卿吴桂辉岳冀李晓萍文富强
- 关键词：肺结核蛋白质组学蛋白质阵列分析
- 应用蛋白质组学技术研究反义Cyclin B1的抗肿瘤作用机制被引量：3
- 2007年
- 背景与目的:先前研究发现采用反义技术下调cyclin B1基因表达水平,可产生抗肿瘤的作用,但其抗肿瘤机制有待进一步研究。本研究旨在利用比较蛋白质组学的方法来探讨反义cyclin B1抗肿瘤作用的分子机制。方法:首先用含有小鼠cyclin B1反义全长cDNA的重组质粒转染小鼠CT26结肠癌细胞,经双向凝胶电泳(2-DE)分离转染组和未转染组的总蛋白,再用PDQuest图像分析识别2-DE胶图像,然后对差异表达的蛋白质点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间(MALDI-TOF-MS)质谱分析,再经Mascot软件搜索数据库鉴定这些差异蛋白。最后根据被鉴定肽段的可信度,从这些蛋白质中选出肽段可信度最高的2个,用Western blot对其丰度差异进行了验证。结果:初步鉴定出7个差异表达蛋白,其中Axin2、CCTθ、DR5和HPCM27蛋白质在实验组上调,RFP17、mKIAA1195及LOC77035蛋白在实验组下调,而可信度最高的Axin2和DR5的蛋白质表达丰度差异为Western blot所证实。结论:多种蛋白质在反义cyclin B1后表达有明显差异,这些差异蛋白质参与细胞的增殖、分化、迁移、凋亡及转录调控等多条信号通路,提示反义cyclin B1的抗肿瘤机制可能与上述蛋白质的作用有关。
- 杨涛张伶严飞仝爱平刘新宇刘涣义黄灿华
- 关键词：抑瘤机制双向电泳激光解吸电离飞行时间质谱
