匡峰磊
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：南京农业大学农学院作物遗传与种质创新国家重点实验室更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 基于连锁图的QTL综合分析方法研究
- 数量性状基因座(quantitative trait loci:QTL)定位可以将数量性状与它相应的QTL或基因联系起来。利用在QTL定位结果基础上的分子标记辅助育种,可以加速新品种育成,改进作物品质。另一方面,比较基因...
- 匡峰磊
- 关键词：粗糙集重组率QTL比较基因组META分析
- 文献传递
- 关联图分析:一种基于连锁图的QTL综合分析方法被引量：1
- 2010年
- 通过统合分析整合多个独立实验QTL(quantitative trait locus)定位结果获得的一致性QTL,可为标记辅助育种和基因图位克隆提供坚实基础.但是这种方法没有充足的生物学背景支撑,而且遗传图谱间不同映射会严重影响分析结果.为此,本文提出一种基于连锁图的QTL综合分析法,简称关联图分析.首先,利用连锁群构建图模型;然后,利用非监督分类法来寻找基因组间具有模式性共分离趋势的标记区间;最后,通过频繁集挖掘法对这些标记区间挖掘以获得与QTL紧密连锁的分子标记(区间).新方法通过Monte Carlo模拟研究和3个棉花QTL定位结果的综合分析予以证实.新方法的优点在于:不需要构建参考图谱;利用基因组间的分子标记模式性共分离趋势来查找特异性QTL,在一定程度上排除了初始QTL的干扰;通过非特异性QTL获得的具有潜在育种价值的分子标记,在作物育种上更有利用价值.
- 匡峰磊汪霞周玲章元明
- 关键词：连锁图数量性状基因座
