吴昕彦
- 作品数：13 被引量：91H指数：4
- 供职机构：上海血液学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家杰出青年科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 新基因HSPCSET的蛋白结构分析和功能初探
- 2009年
- 目的研究人脐血CD34＋造血干／祖细胞来源的新基因HSPCSET的结构和生物学功能。方法采用生物信息学技术对HSPCSET蛋白进行结构分析和同源性比较。酵母双杂交实验筛选与HSPCSET蛋白相互作用的蛋白分子，测序后筛选出功能较明确的阳性克隆进一步回复性杂交，采用G—gal实验和GST拉下试验验证。免疫荧光共定位方法分析HSPCSET和相关基因细胞内定位情况。结果蛋白结构分析和同源性比对揭示HSPCSET是古老的SET基因家族的成员，可能具有非常保守而重要的生物学功能。应用酵母双杂交技术筛选能与之相互作用的蛋白，获得13个阳性克隆，分别涉及信号传导、转录调控、细胞凋亡、肿瘤发生、发育等途径，与细胞增殖、分化、凋亡及肿瘤发生密切相关。采用GST拉下试验进一步在体外水平验证了其中4个基因：GADD34（凋亡相关分子）、SIVA（凋亡相关分子）、DNAJ（分子伴侣）和PHF1（转录相关因子）与HSPCSET蛋白确实存在相互作用。免疫荧光共定位方法显示HSPCSET和GADD34共转染细胞株后共同定位于细胞核内，两者之间存在强烈的相互作用。结论新基因HSPCSET可能参与凋亡途径、具有非常保守而重要的生物学功能。本研究结果为进一步研究HSPCSET在造血调控中的作用及研究肿瘤发生奠定基础。
- 卫菊孙晓建吴昕彦陈赛娟陈竺王椿黄秋花
- 关键词：肿瘤发生
- 一种组蛋白甲基转移酶及其制备方法
- 本发明提供了一种新的组蛋白甲基转移酶－HSPC069SET蛋白，编码HSPC069SET蛋白的多核苷酸和经重组技术产生这种HSPC069SET蛋白的方法。本发明还公开了编码这种HSPC069SET蛋白的多核苷酸的用途。H...
- 陈竺孙晓建黄秋花吴昕彦胡鸣陈赛娟
- 文献传递
- 胃癌相关抗原MG7-Ag模拟肽表位的筛选及测序分析被引量：14
- 2000年
- 目的 从噬菌体呈现的随机肽库中筛选胃癌单克隆抗体MG7所识别的胃癌相关抗原的短肽模拟表位 ,为进一步研究胃癌相关抗原与单抗结合的结构基序奠定基础。方法 用胃癌单克隆抗体MG7对呈现于噬菌体衣壳蛋白pⅧ上的 2个九肽库分别进行亲和富集和免疫筛选 ;阳性克隆进一步用荧光标记和硝酸纤维素膜斑点印迹法证实其结合活性 ;经随机抽取部分阳性克隆进行DNA序列分析 ,推导出相应噬菌体呈现肽的氨基酸序列 ,通过序列比较分析相对保守的表位信息 ;运用HLA分子结合分析软件预测已测序短肽与HLA分子结合的可能性。结果 经反复多轮筛选和结合活性检测 ,从pⅧ和pⅧ cys 2个噬菌体肽库中分别得到了 12和 30个阳性克隆 ;通过对部分阳性克隆进行测序分析 ,推导相应的随机肽序列和序列比较分析 ,得到具有相对保守性的表位信息如PLX0 2 S、SAVR、XRMX、YARN等。经计算机预测分析 ,发现它们可与HLA多个分子结合。结论 PLX0 2 S、SAVR、XRMX、YARN等有可能为胃癌单克隆抗体MG7所识别的表位基序。
- 徐立乔泰东陈宝军欧阳为明丁杰张庆华周隽吴昕彦金伯泉樊代明
- 关键词：噬菌体单克隆抗体肽类胃肿瘤
- 用随机肽库筛选胃癌相关抗原MGb2-Ag模拟肽表位被引量：2
- 1999年
- 的 运用肽库筛选技术寻找胃癌单克隆抗体ＭＧｂ２ 所识别的胃癌相关抗原的短肽模拟表位。方法 以胃癌单克隆抗体ＭＧｂ２ 作为筛选配基，对呈现于噬菌体衣壳蛋白ｐⅧ上的两个九肽库进行了亲和富集和免疫筛选；阳性克隆用荧光标记和硝酸纤维素膜斑点印迹证实结合活性；随机抽取部分阳性克隆进行了ＤＮＡ 测序分析。结果 经ＤＮＡ 测序分析推导出相应的氨基酸序列并加以比较分析，得到具有保守性的表位信息。结论 具有相对保守性的ＶＣＸＸＤＧＶ 可能为胃癌单克隆抗体ＭＧｂ２所识别的表位基序。
- 徐立陈宝军乔泰东欧阳为明何凤田张庆华周隽吴昕彦金伯泉樊代明
- 关键词：胃肿瘤噬菌体呈现单克隆抗体
- 一种组蛋白甲基转移酶及其制备方法
- 本发明提供了一种新的组蛋白甲基转移酶-HSPC069SET蛋白，编码HSPC069SET蛋白的多核苷酸和经重组技术产生这种HSPC069SET蛋白的方法。本发明还公开了编码这种HSPC069SET蛋白的多核苷酸的用途。H...
- 陈竺孙晓建黄秋花吴昕彦胡鸣陈赛娟
- 文献传递
- 正常人垂体组织基因表达谱的研究被引量：12
- 2000年
- 目的 建立正常人垂体组织基因表达谱。方法 垂体cDNA文库构建、大规模表达序列标记 (EST)测序及生物信息学处理。结果 在所测的 72 2 2条可分析的EST中 ,2 949条 (4 1% )为已知基因 ,其中参与基因 /蛋白表达者最高 (2 3.2 % ) ,13 .7%的基因与内分泌相关 ,18.1%的基因参与信号转导。前 2位高表达的基因是促生长素和催乳素。垂体表达甘丙肽、可卡因和安非他明调节的转录肽 (CART)及黑色素浓集激素 (MCH)等与食欲调节有关的激素。还表达与免疫有关的细胞因子和受体。Pit 1、锌指蛋白 (ZNF) 74和PLAG1在垂体中是相对特异表达的。结论 正常垂体组织中参与信号转导的基因明显高于心脏和CD34 +造血前体细胞 ,而与脑、下丘脑、肾上腺组织相近。甘丙肽和CART可能是参与食欲调节的垂体激素。垂体和免疫系统之间存在广泛的相互作用。Pit 1、ZNF74和PLAG1可能是垂体特异表达的转录因子。
- 宋怀东胡仁明彭永德黄秋花周隽吴昕彦任双喜高国峰王立毛羽丰余亚萍戴蒙徐淑华范惠泳沈宇付刚陈名道张庆华陈家伦
- 关键词：垂体计算生物学基因表达谱
- 运用生物信息学推测造血干/祖细胞来源的新基因的功能
- 1999年
- 吴昕彦叶珉沈宇张庆华陈竺
- 关键词：生物信息学新基因造血干祖细胞亮氨酸拉链信号肽
- 人胰岛β细胞瘤基因表达谱的研究
- 目的:建立人胰岛β细胞瘤基因表达谱.方法:经病理证实为胰岛β细胞瘤的患者,术中取部分瘤组织.用TRIzol试剂(GIBCO/BRL)抽提总RNA,Qiagen mRNA纯化试剂盒(Qiagen,California)分离...
- 王宣春俞放徐飒英毛羽丰范惠咏吴昕彦陈钦达张庆华陈名道宋怀东陈家伦胡仁明
- 文献传递
- 单核苷酸多态性研究及应用被引量：50
- 2000年
- 人类基因组计划诣在解读人类分布于24条染色体上的30亿对碱基,它们涵盖了人的所有生存信息。面对如此庞大的信息量,人类基因组测序的策略是以作图为基础,将染色体分为较易分析操作的结构区域。人类基因组作图的分子标记从第1代的限制性酶切片段长度多态性(restrictionfrag...
- 吴昕彦张庆华陈竺
- 关键词：单核苷酸多态性SNP
- 大规模测序研究CD_(34)^+造血干/祖细胞基因表达谱被引量：1
- 2000年
- 目的 建立大规模测序方法 ,并用于造血干 祖细胞 (HSPC)基因表达谱的初步识别。方法 从脐血中分离CD34+ 细胞 ,构建cDNA文库 ,对其进行大规模表达序列标签 (EST)测序 ,用生物信息学的方法进行结果分析。结果 在获得的 986 6条EST中 ,有意义序列归并为 2 0 6 0个连续克隆 ,其中10 5 4个为已知基因 ,10 0 6个为至今尚未被公共数据库公布的新基因片段。 10 5 4个已知基因根据功能分为八个大类 :①造血相关的 73个 ;②染色体结构及细胞分裂相关的 91个 ;③细胞信号传导相关的111个 ;④细胞结构 运动相关的 48个 ;⑤细胞和机体防御相关的 41个 ;⑥基因表达 (转录、翻译及加工 )相关的 2 6 5个 ;⑦代谢相关的 192个 ;⑧未分类的 2 33个。结论 获得了HSPC表达的 10 5 4个已知基因和 10 0 6个新基因片段构成的初步基因表达谱 。
- 吴济生张庆华叶珉吴昕彦周隽傅刚黄秋花顾健包其郁余亚平沈宇徐淑华茅矛陈竺
- 关键词：造血干细胞基因表达计算生物学
