李进斌
- 作品数：91 被引量：504H指数：16
- 供职机构：云南省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程环境科学与工程更多>>
- T-DNA插入对稻瘟病菌基因组中SSR的影响
- 本研究利用 T-DNA 随机插入稻瘟病菌 Magnaporthe grisea 基因组的转化菌株,对稻瘟病菌基因组中含 SSR 的基因或区域和不含 SSR 的基因进行多态性分析。结果表明, T-DNA 插入稻瘟病菌基因组...
- 刘林杨静张悦苏源徐玲李进斌梁飞王云月朱有勇李成云
- 文献传递
- 云南地方稻种资源Pid2等位基因的鉴定及稻瘟病抗谱分析
- 【研究背景】稻瘟病是世界各稻区最为严重的病害之一。抗病基因序列进化与抗性分子机制的认识,将有助于制定新的防治与抗病育种策略。主效抗稻瘟病基因Pid2属于RLK类基因,是一种新型的抗稻瘟病基因,前期研究表明Pid2除了抗/...
- 孙一丁李进斌马继琼杨奕许明辉
- 关键词：水稻稻瘟病
- 文献传递
- 哀牢山国家级自然保护区蝴蝶区系及多样性被引量：11
- 2019年
- 明确云南省哀牢山国家级自然保护区蝴蝶资源及区系组成,以期为蝴蝶多样性保护提供策略。采用样线观测法,于2016年4月—2017年10月对保护区5个不同生境的蝴蝶资源进行了12次观测。结果表明:共观测记录5967只蝴蝶,采集鉴定为133种,隶属于新分类系统5科75属。蛱蝶科个体数量及属种数最多,其次为粉蝶科和灰蝶科。5个不同生境中缓冲区张家寨蝶类属种数最多。多样性分析结果也表明:蛱蝶科及张家寨具有最丰富的属种多样性及物种丰富度。不同生境的蝴蝶群落相似性较低。哀牢山蝴蝶区系以东洋界种类为主。87%的蝴蝶种类及73%的蝴蝶数量分布于海拔1100 m以下的缓冲区张家寨及保护区外围嘎洒镇新街,暗示了哀牢山蝴蝶具有明显的垂直分布特征。不同生境蝴蝶多样性存在明显差异,为大尺度下蝴蝶多样性观测奠定了基础。
- 王群郭志祥李进斌马方舟吴文伟王凯博何成兴
- 关键词：蝴蝶多样性区系
- 拟南芥蛋白组中含有RxLx模体的分泌蛋白
- 拟南芥基因组是第一个完成测序的高等植物基因组,对其结构和功能的研究是了解植物遗传、调控、生理、进化机制的重要基础。本文报道用多个准确性较高的预测分泌蛋白的软件 SignalP v3.0、TargetP v1.01、big...
- 杨静刘林于钦亮张悦李进斌王云月朱有勇李成云
- 文献传递
- 灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)蛋白激酶编码基因中SSR变异及其对蛋白结构的潜在影响被引量：2
- 2010年
- 病原菌可以利用多种方式激活或者抑制蛋白激酶信号通路来增强其自身侵染力,在病原物与植物互作初期的信号识别和转导中蛋白激酶扮演着重要的角色。已有研究结果表明灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)蛋白激酶基因中含有丰富的SSR。作者通过对灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)基因组中的89个蛋白激酶基因的外显子区、内含子区、5′-UTR和3′-UTR区中的SSR进行了查找和分析,并对编码区中SSR的扩张或收缩对蛋白结构的影响进行了预测。结果表明,SSR在基因的调控区和编码区中的分布是不均一的,且这些基因的外显子区、内含子区、5′-UTR和3′-UTR区中SSR的组成和分布也均不相同;基因的编码区中三碱基和六碱基SSR相对较多,且SSR基序大都表现为GC含量较高,编码的亲水性氨基酸出现的频率也远远高于疏水性氨基酸。通过病菌群体中变异幅度的检测表明,几乎所有的SSR序列都存在多态性。根据灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)自然群体中SSR的变化幅度,对SSR的扩张或收缩对蛋白二级结构的影响进行预测,发现SSR的扩张或收缩都可能对蛋白的结构产生影响。这暗示着SSR的变异在致病相关基因的变异中可能起着十分重要的作用。
- 刘林李进斌张悦苏源杨静陈梦琪李成云
- 关键词：蛋白激酶编码区调控区
- 稻瘟病抗性基因Pita在中日韩粳稻中的分布被引量：1
- 2020年
- 为了解2 350份来源中国、日本和韩国粳稻品种(系)稻瘟病抗性基因Pita的分布,利用2个KASP分子标记对该基因进行了检测,605份材料表现有利,1 732份不利,7份为杂合,6份不确定。在有利、不利和杂合三个群体中分别随机选取316份、101份和7份材料,对Pita基因功能片段进行了测序分析,结果显示有利群体中KASP检测结果准确率为95.89%,不利群体100%,2个KASP分子标记可以用来联合检测水稻种质资源的Pita抗性基因。根据KASP分子标记检测结果,在中国北方地方稻种中仅0.69%品种携带Pita抗性基因,在中国13个省区市育成品种(系)和日本韩国外来稻种中均有一定的分布,频率7.02%~55.81%,表明Pita基因在东亚地区范围内均得到了一定的应用,但各地区应用程度相差较大,其中中国吉林、辽宁、宁夏、浙江四省地区较高。通过415份材料Pita基因功能片段609个碱基序列的比较,仅发现3个变异位点(第2 388位,第2 752位,第2 766位)和4种基因单倍型,其中抗性基因仅一种单倍型(H1),感病基因有三种单倍型(H2, H3, H4),H2为优势单倍型(84.84%)。本研究结果为开发和利用中日韩地区稻种资源和品种布局提供了依据。
- 马继琼孙一丁杨奕李进斌许明辉
- 关键词：水稻
- 微量提取小麦叶片中条锈菌DNA的方法初探被引量：4
- 2010年
- 小麦条锈菌DNA的提取对于研究条锈菌遗传群体结构,条锈菌遗传多样性以及揭示条锈菌群体类型和预测优势小种的流行,具有重要的意义。但是常规的病原菌DNA提取首先需要获得大量的病原物纯化体,再对病原物进行DNA提取,费时费力。本文直接对含有条锈菌的小麦叶片标样进行DNA提取,从中获得条锈菌的DNA,用于后续研究。既节省了大量的人力、物力和财力,又为快速检测和获得所需的DNA提供了参考方法,为快速了解病原菌的群体遗传结构变化和毒性演化的规律创造了可行性,为深入研究小麦条锈菌群体生物学和流行学奠定了基础。
- 张庆李枝桦李进斌李成云曾莉
- 关键词：小麦条锈菌
- 云南省稻瘟病菌无毒基因的地理分布(英文)被引量：3
- 2011年
- 了解稻瘟病菌无毒基因的出现频率及分布,有助于制定有效的合理利用持有不同抗性基因的水稻品种及在多样性种植系统中抗性基因的组合的策略。本文对在云南省11个地(州)采集的稻瘟病菌中无毒基因的出现频率及地理分布进行分析,并利用持有20个抗性基因的水稻单基因系对供试的467个稻瘟病菌株的致病型进行鉴定。结果表明,稻瘟病菌无毒基因在云南省10个地(州)的出现频率差异不显著,而无毒基因在西双纳版纳的出现频率与其它10个地(州)的出现频率之间差异显著;无毒基因Avr-Pi9、Avr-Piz 和 Avr-Pizt 在11个地(州)的稻瘟病菌中出现频率最高,它们的平均检出率在80%以上。本研究结果表明,水稻遗传多样性的组成和分布对于水稻稻瘟病菌遗传多样性的形成和保持比气候和其它环境条件更重要。通过无毒基因的平均出现频率,可将无毒基因划分为4个类群,不同类群的无毒基因出现频率差异显著,而同一类群中的无毒基因出现频率的差异不显著。本研究结果将为水稻抗性基因的评价及稻瘟病有效防控提供有用的信息。
- 李进斌杨静刘林何汉明何霞红朱有勇李成云
- 关键词：稻瘟病菌无毒基因单基因系地理分布
- 一种微生物菌落培养物的摄影装置
- 本实用新型公开了一种微生物菌落培养物的摄影装置，包括拍摄箱，所述拍摄箱的上端通过螺丝固定安装有安装架，所述拍摄箱的上端设有拍摄孔，所述安装架的上端固定连接有电动推杆，所述安装架的内部滑动连接有安装板，所述电动推杆的输出端...
- 裴卫华施竹凤杨明英杨佩文张庆李进斌孔垂思
- 酿酒酵母分泌蛋白组的计算机分析被引量：29
- 2005年
- 结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件 SignalP v3.0、TargetP v1.01、Big-PI predictor 和 TMHMM v2.0 对已公布的 6 700 个酿酒酵母(Saccaromyces cerevieiae)基因的 N-端氨基酸序列进行信号肽分析,同时系统分析了信号肽的类型及结构。结果表明,在 6 700 个酿酒酵母蛋白中,163 个为Sec-信号肽分泌蛋白,经 Sec 途径分泌。在 163 个分泌蛋白中,有 47 个的信号肽没有典型的 N-区,仅有 H-区和C-区,其余 116 个分泌蛋白的信号肽包含完整的 3 个区,即 N-区、H-区和 C-区。比较了酿酒酵母与白假丝酵母菌(Candida albicans)分泌蛋白信号肽的氨基酸组成顺序,表明酿酒酵母与白假丝酵母菌的信号肽的氨基酸组成和顺序差异很大,两者信号肽长度分布范围、氨基酸种类及其出现频率大体一致。在酿酒酵母分泌蛋白中出现了少数氨基酸组成完全一致的信号肽,为进一步确认具有相同信号肽的分泌蛋白是否具有同源性,分别采用 BLAST 2SEQUENECES 和 CLUSTAL W 对具有相同信号肽的分泌蛋白进行了序列比对。结果表明具有相同信号肽的分泌蛋白同源性非常高,氨基酸组成也非常保守。由此可以推断,编码这些分泌蛋白的基因属于旁系同源基因(paralogous)。酿酒酵母作为一种模式生物,以其诸多的优点,被认为是表达?
- 杨静李成云王云月朱有勇李进斌何霞红刘林业艳芬周晓罡唐萍
- 关键词：分泌蛋白信号肽白假丝酵母菌酿酒酵母外源蛋白
