白有煌
- 作品数：4 被引量：11H指数：2
- 供职机构：浙江大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 植物中编码基因TIFY家族和非编码基因lncRNA的生物信息学研究
- 本文利用生物信息学手段，对植物特异的转录因子蛋白家族、RNA介导的DNA甲基化通路和长非编码RNA的发掘和研究进行了深入研究。本研究分为三个部分： 第一部分主要利用生物信息手段对多个全基因组数据进行挖掘，从序列分析、基...
- 白有煌
- 关键词：植物遗传蛋白结构DNA甲基化
- 文献传递
- 毛竹Stowaway-like MITEs转座子的分离与分析被引量：3
- 2010年
- 微型颠倒重复序列(miniature inverted repeat transposable elements,MITEs)是一类对基因组进化和基因表达有重要调节作用的转座子。为分析MITEs在毛竹基因组中的分布特性,借鉴Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats(FIASCO)方法,首次构建Stowaway-like MITEs富集文库。随机挑取21个克隆,测序发现2个含有Stowaway-like MITEs序列(Stow-Ph1和Stow-Ph2),阳性率为9.52%。Stow-Ph1和Stow-Ph2的长度分别为260和258bp,具有Stowaway-like MITEs典型的末端颠倒重复序列(terminal inverted repeats,TIRs)和靶位点重复序列(target site duplication,TSD)。Stow-Ph1和Stow-Ph2与水稻的Stow-Os8(FJ266024)的同源性分别为46.4%和52.6%。Stow-Ph1和Stow-Ph2与水稻16类Stowaway-like MITEs的TIRs前20bp的相似性均高于50%,表明毛竹的Stowaway-like MITEs在TIRs上是高度保守的。
- 钟浩周明兵白有煌汤定钦
- 关键词：毛竹磁珠富集转座子MITES
- 植物中编码基因TIFY家族和非编码基因IncRNA的生物信息学研究
- 本文利用生物信息学手段,对植物特异的转录因子蛋白家族、RNA介导的DNA甲基化通路和长非编码RNA的发掘和研究进行了深入研究。第一部分主要利用生物信息手段对多个全基因组数据进行挖掘,从序列分析、基因结构和系统进化树等方面...
- 白有煌
- 关键词：生物信息植物
- 文献传递
- 毛竹细胞色素P450的基因组学分析被引量：7
- 2014年
- 细胞色素P450单加氧酶(P450s)是一类在450 nm处有特征吸收峰的血红素硫蛋白基因超家族,在许多物质代谢中至关重要,还与解毒代谢密切相关。在毛竹基因组中鉴定出41个P450家族,共197个成员,涉及10个基因簇(clan)。通过基因结构与进化树的比较,进一步了解结构与进化之间的联系。通过与水稻和拟南芥一起构建的进化树,分析了毛竹P450基因家族的差异性。二级结构分析表明,毛竹P450蛋白序列同样具备有P450蛋白特征性结构域。在毛竹中,共有104个P450基因能够在不同生长发育时期有不同程度的表达。
- 林翩翩白有煌周明兵
- 关键词：毛竹细胞色素P450基因结构系统进化树进化
