黄于艺 作品数:20 被引量:9 H指数:2 供职机构: 广州医科大学 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 广东省医学科学技术研究基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 轻工技术与工程 化学工程 更多>>
全国过敏人群信息化综合服务平台及数据库的设计与构建 2023年 过敏性疾病被世界卫生组织列为21世纪需要重点研究和防治的三大疾病之一。其发病率高,在我国影响人群广泛。然而我国过敏人群的科普、患者教育、患者治疗跟进以及防诊治工作的综合水平都有待提高。依托我国互联网技术的发展优势,设想并构建一个集过敏性疾病多层次科普、风险预测、自我筛查与诊断、线上线下就诊指引、患者管理、资料入库、流行病学调查及回顾分析、多中心临床试验开展、患者宣教、治疗依从性提升、预防产品开发与功效认证、疑难罕见病跨区域会诊、成果推广等多功能于一体的综合服务平台和数据库,并以此平台和数据库作为重要工具,向广大过敏人群提供更好服务的同时,为我国在过敏性疾病防诊治新方法的研发中提供便利,助力于我国变态反应事业的发展。 张俊艳 赵思捷 陈汝治 黄于艺关键词:过敏性疾病 数据库 综合服务平台 重组巴西坚果过敏原MHC低亲和力突变蛋白的构建 郑俊斌 王珊 黄于艺 何颖 李燕芳 肖兰艳 邹泽红 陶爱林子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d 1之间关系的生物信息学分析 被引量:1 2013年 目的:分析人子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d 1之间关系。方法 :运用ClustalW 1.83和MEGA5.1 Beta3软件比较人分泌球蛋白家族序列及猫过敏原Fel d 1两个亚基P30438和P30440之间的进化树形图;采用在线软件平台NetMHCII 2.2比较分析P30438与子宫珠蛋白典型序列P11684之间抗原性差异;利用Swiss-Model程序模拟并比较P11684、P30438和P30440的三级结构。结果 :分泌球蛋白家族充斥着大量冗余数据,经逐步聚类收缩至13个代表性序列进一步分析发现,整个分泌球蛋白家族划分成两个大家族三个亚家族,而子宫珠蛋白典型序列与猫主要过敏原Fel d 1的一个亚基P30438之亲缘关系最近,两者均具有与HLA高亲和力结合位点,而且三级结构相似。结论:子宫珠蛋白具有潜在的过敏原性。 欧阳穗 黄于艺 凌春芳 何颖 陈惠芳 邹泽红关键词:抗原性 一种借助支持向量机建立过敏原家族特征肽的过敏原的预测方法 本发明属于生物信息学技术领域,更确切的是涉及一种借助支持向量机建立过敏原家族特征肽的过敏原的预测方法。该预测方法包括建立过敏原数据库;形成过敏原聚类与家族;提取过敏原家族代表肽;建立支持向量机模型;模型性能参数的优化训练... 陶爱林 张利达 邹泽红 黄于艺文献传递 疥螨主要过敏原Sar s 14的重组表达与鉴定 目的 利用基因工程的技术原核表达疥螨主要过敏原Sar s 14.方法 对Sar s 14的核酸序列进行密码子优化并人工合成其全基因序列.构建pET-44a为表达载体的原核表达系统,对Sar s 14进行蛋白表达,并通过免... 黄于艺 邹泽红 赖荷 何颖 陈惠芳 陶爱林寡细胞哮喘的特征基因挖掘及其对哮喘治疗靶点的应用前景评估 2022年 目的 应用生物信息学方法对寡细胞型哮喘患者的基因表达谱芯片进行分析,以研究寡细胞型哮喘的病理机制,进而寻找寡细胞型哮喘的精准治疗靶标。方法 从GEO平台库获取GSE143303芯片数据集,在对数据集进行整理与初步分析后,对寡细胞型哮喘和健康对照的表达谱进行基因表达分析。利用R语言进行功能基因集富集分析,对基因进行功能聚类。利用基因集互作信息,构建与表型正负关联度最强的基因互作网络,并计算不同网络间的相关性,结合差异基因分析,筛选出关键基因和调控网络。结果 GSE143303数据集包含47例成人支气管活检样本,其中有16例寡细胞型哮喘和13例健康对照。筛选出显著意义的通路基因集115个,其中正相关的通路基因集有37个,负相关的通路基因集有78个。与寡细胞型哮喘强负相关的通路基因网络之间,存在基因纠缠。对互作网络进行基因共集分析,结果发现网络交叉主要出现在HLA相关基因。结合差异基因分析,发现网络交联基因TNFRSF13B、HLA-DQB1、HLA-DRB5在正常对照组相比存在表达差异,其中TNFRSF13B有显著差异。结论 TNFRSF13B、HLA-DQB1、HLA-DRB5及由此组成的基因调控网络可能是寡细胞型哮喘的关键基因与主要相关调控网络,研究结果为寻找寡细胞型哮喘的精准治疗靶标和病理机制提供了研究方向。 黄于艺 张俊艳关键词:调控网络 生物信息学 重组巴西坚果过敏原MHC低亲和力突变蛋白的构建 郑俊斌 王珊 黄于艺 何颖 李燕芳 肖兰艳 邹泽红 陶爱林基于公共数据库的“医学科研设计”全流程沉浸式案例教学探讨 2024年 为培养医学生创新思维及科研能力,医学院校大多开设了“医学科研设计”等课程。然而,该课程现有教学方式存在内容联结不紧密,学生课堂参与度不高,对学生实践能力提升不够等问题。为此,笔者提出基于公共数据库的全流程沉浸式案例教学方式。以Dryad等公共数据库的真实临床研究案例为基础,深度剖析研究案例,科学有机地设计和整合授课内容,涵盖文献检索、研究背景与综述撰写、研究设计与方案制定、数据分析与结果展示、论文撰写与发表,以及成果推广与转化等内容。案例教学法贯穿该课程整个教学过程,通过“亲身经历”的形式,激发学生的学习兴趣,让学生通过线上线下课堂“参与”科研,以实现科研理论与实践能力双提升的目标。 张俊艳 黄于艺关键词:医学科研设计 案例式教学 课程设计 一种借助支持向量机建立过敏原家族特征肽的过敏原的预测方法 本发明属于生物信息学技术领域,更确切的是涉及一种借助支持向量机建立过敏原家族特征肽的过敏原的预测方法。该预测方法包括建立过敏原数据库;形成过敏原聚类与家族;提取过敏原家族代表肽;建立支持向量机模型;模型性能参数的优化训练... 陶爱林 张利达 邹泽红 黄于艺文献传递 重组巴西坚果过敏原MHC低亲和力突变蛋白的构建 目的:获得巴西坚果重组过敏原蛋白的MHC低亲和力突变蛋白,并通过体外细胞水平与小鼠动物实验证实其低过敏原性.方法:利用NetMHC Ⅱ在线软件分析巴西坚果重组蛋白的过敏原表位,确定于MHC-Ⅱ结合力高位点,并且依据小鼠的... 郑俊斌 王珊 黄于艺 何颖 李燕芳 肖兰艳 邹泽红 陶爱林关键词:巴西坚果