徐建平
- 作品数：15 被引量：233H指数：9
- 供职机构：麦克马斯特大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金中国留学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学石油与天然气工程文化科学更多>>
- 油茶炭疽病菌种群遗传结构研究
- 油茶炭疽病是油茶最重要的病害之一.目前对于该病原菌种群的遗传结构尚未见报道.研究病菌种群的遗传结构对制定科学的防治方法具有重要意义.本研究比较中国6个省12个不同地区的126个胶孢炭疽菌的ITS序列的差异，以期研究各不同...
- 李河徐建平周国英朱丹雪何苑皥
- 关键词：遗传分化
- 文献传递
- 分子动力学在聚合物驱油中的应用研究进展被引量：2
- 2021年
- 传统上,实验室测试和测量被认为是最可靠的表征方法,然而在许多情况下,由于对储层性质范围的敏感性和非均质储层性质的局部变化认识不清,以及基于过于简化的假设条件,使得这种确定性策略获得的特征预测具有高度的不确定性。近年来,分子动力学(MD)模拟在储层岩石、流体性质及其相互作用和原子水平上的研究得到了广泛的关注。在MD中,通过对系统中所有原子运动的牛顿方程的数值解,从原子位置和速度的时间演化分析中提取出有趣的性质。这项技术有助于进行计算机实验,以及进行可能无法完成的、成本极高的或者非常危险的实验。综述了MD模拟技术及其在驱油机理和驱油剂性质研究中的应用,阐述了MD的理论概念和程序,特别是在聚合物驱分析中。这将提供有用的指导方针,以表征储层岩石和流体及其在各种油藏中的行为,有助于更好地优化设计生产计划的运行,为油田聚驱技术的发展提供了理论基础。
- 徐建平徐建平谢青谢青冯震
- 关键词：聚合物驱驱油机理提高采收率分子动力学
- 引起油茶炭疽病胶孢炭疽菌种群遗传结构研究被引量：11
- 2014年
- 胶孢炭疽菌是引起油茶炭疽病的主要病原之一。目前对于该病原菌种群的遗传结构尚未见报道。研究病菌种群的遗传结构对制定科学的防治方法具有重要意义。本研究比较中国6个省12个不同地区的126个胶孢炭疽菌的ITS序列的差异,以期研究各不同群体的单倍体型多样性,不同地区群体之间的遗传关系,以及遗传距离与地理距离的线性关系。遗传分析发现,得到的126个胶孢炭疽菌样品ITS序列可定义为27种单倍体型。27种单倍体型中,一个主要的单倍体型(Haplotype12)含有78个样品,且基本上每个样品采集地都有分布。遗传分化指数(Fst)表明病菌不同地理种群间的遗传分化较大。AMOVA分析显示,种群间的遗传变异占总变异的6%,种群内部变异占总变异的94%。Mantel测试显示地理距离与遗传距离没有显著的线性关系。对所有地理种群病原菌ITS序列的核苷酸不配对进行分析,发现油茶炭疽病菌未经历过大规模的种群扩张过程。系统发育分析表明,来自不同地区的油茶炭疽病菌散乱的分布在系统树中。研究结果表明油茶炭疽病菌种群具有丰富的遗传多样性。
- 李河朱丹雪徐建平周国英胡茉田丰
- 关键词：遗传分化
- 一种油茶新炭疽病原的多基因系统发育分析鉴定被引量：46
- 2014年
- 为明确我国油茶炭疽病病原菌的种类,对采集自我国6个省市油茶产区的炭疽病样本进行病原菌分离,通过形态学特征并结合多基因谱系分析方法构建系统发育树进行比较分析。结果表明共分离到能引起油茶叶出现炭疽病症状的病原菌23株。病原菌在PDA培养基上28℃培养7 d后,菌落圆形,初期白色,逐渐变为灰色,最终为灰黑色;分生孢子堆橘黄色,分生孢子椭圆形、单胞、无色,大小为(16.8±0.7)μm×(5.7±0.4)μm;菌丝附着孢椭圆形,褐色,边缘光滑、完整,大小为(9.5±1.5)μm×(6.1±0.6)μm。多基因系统发育树显示,这23株病原菌与包括模式菌株ICMP18581在内的所有果生刺盘孢菌Colletotrichum fructicola菌株序列聚为一个进化枝,置信度高达100%。根据形态特征及多基因系统发育树,鉴定这23株病原菌为果生刺盘孢菌C.fructicola,为国内油茶上果生刺盘孢菌的首次报道。
- 李河周国英徐建平朱丹雪
- 关键词：油茶炭疽病病原菌
- 海南省不同寄主植物炭疽病菌侵染油茶研究被引量：10
- 2016年
- 为了明确海南省不同寄主植物炭疽病菌侵染油茶的潜力,本研究分离、鉴定海南省4个油茶林中不同寄主植物的炭疽病菌种类及其致病性。结果从油茶、葛根、山麻杆、飞机草、蒲葵、鲫鱼胆、桃花心木、黄兰、羊蹄甲、山矾、银柴、降香黄檀和檀香等13种植物上,共获得135株炭疽病菌,其中果生刺盘孢菌(Colletotrichum fructicola)85株、暹罗刺盘孢菌(C.siamense)45株,盘长孢状刺盘孢菌(C.gloeosporioides)3株,君子兰刺盘孢(C.cliviae)和山茶刺盘孢(C.camelliae)各1株;4个采样地的油茶树与葛根等当地其他12种植物具有相同的炭疽病菌C.fructicola和C.siamense,这两种菌占总分离炭疽菌的96%;通过致病性测定,不同寄主来源的这5种炭疽菌均能引起油茶炭疽病。海南省当地多种植物的炭疽病菌是油茶的潜在侵染源。
- 李河李杨蒋仕强万智李航宇徐建平周国英
- 关键词：油茶炭疽病菌
- 线粒体DNA序列多位点分析揭示全球松茸复合种种内有限基因变异和种间稳定区别
- 2020年
- 松茸是外生菌根真菌,分布在北半球,在温带生态系统的物质循环和改善植物健康中发挥着重要作用。这类食用菌也具有很高的经济价值,尤其在日本。根据形态特征和基于细胞核核糖体RNA基因簇转录间隔区(ITS)序列的DNA条形码,已经把松茸按不同地理区域来源归为几个物种:Tricholoma matsutake(欧亚大陆),T.anatolicum(地中海区域),T.magnivelare(北美东部),T.murrillianum(北美西部)和T.mesoamericanum(墨西哥)。这些物种共同构成全球松茸复合种。本研究通过多位点序列分析进一步调查松茸系统地理学,更深入的理解这种生物的全球分布和进化历史。来自北美、北欧和东亚的42个松茸样品的ITS序列和4个线粒体位点被检测。总体上线粒体DNA多位点系统分析呈现出和ITS系统发育分析一致的模式和拓扑结构,即各个地理区域的样品分别聚在一起。然而,在我们的4个被检测物种的样品间,几乎没有或没有发现所选线粒体位点的基因变异。我们的研究结果表明松茸物种复合体中的线粒体基因组的进化速度较慢,或各个物种的广泛分布源于近期的扩散。深入理解松茸复合种的遗传多样性和演化关系,对制定保护政策有重要意义。
- SANDOR Sarah R王汉臣VAARIO LuminTRUDELL Steven A徐建平
- 关键词：系统地理学
- 橙黄乳菇遗传多样性分析被引量：2
- 2012年
- 分析来自湖南省道县(DX)、张家界市(ZJJ)、芷江县(ZJ)、麻阳县(MY)和贵州省玉屏县(YP)以及泰国(TL)6个橙黄乳菇种群38个菌株的ITS-5.8S序列的遗传结构和遗传多样性。所有的ITS-5.8SrDNA序列样品共检测到2个变异位点,碱基A、T、G、C的平均含量分别为22.5%、26.9%、22.7%和27.9%。根据序列的核苷酸变异共定义了3种单倍型,其中单倍型Hapolotype 3是湖南和贵州5个种群共享单倍型,Hapolotype 2为6个种群的共享单倍型。中国橙黄乳菇各地区种群的单倍型多样性(haplotype diversity,HD)在0.21875～0.59375之间,表明橙黄乳菇种群具有较高的单倍型多样性。遗传分化指数(fixation index,FST)表明,不同地理种群间的遗传分化较大。AMOVA分析显示,种群间的遗传变异占总变异的17%,种群内部变异占总变异的83%。Mantel测试显示地理距离与种群的遗传分化FST值之间线性关系显著(P<0.05)。采用N-J法构建的分子系统树表明,当与乳菇属相近种进行比较时,湖南、贵州和泰国不同地区的所有橙黄乳菇样品紧密聚为一支。采用中性检验进行分析,推测湖南橙黄乳菇群体样品在进化上遵循中性模型,并且经历过种群扩张过程。研究结果表明橙黄乳菇种群具有丰富的遗传多样性。
- 李河徐建平郭亮刘君昂周国英朱丹雪
- 关键词：地理种群遗传分化
- 一种新油茶炭疽病原多基因序列鉴定被引量：21
- 2015年
- 从湖南、广西油茶叶上分离获得5株能侵染油茶树的病原菌。通过柯赫氏法则证明该病原菌为油茶炭疽病的致病菌。病菌菌落圆形,初期为白色,逐渐变为浅灰色;气生菌丝由白色和灰白色渐变为深灰色绒状;菌落背面中心颜色深,外部颜色浅;菌丝划伤后在PDA培养基上能产生橘黄色的分生孢子堆,分生孢子为单胞、直、圆柱状、无色、光滑、两头钝圆或一端稍尖,分生孢子大小（11~15）μm×（4~5）μm;菌丝体附着胞不规则状,浅褐色,（8~12）μm×（5.5~7）μm。采用形态学结合多基因（核糖体内转录间隔区（ITS）、钙调蛋白-CAL、3-磷酸甘油醛脱氢酶-GAPDH）系统学的方法对它们进行鉴定,结果发现,5个菌株均为暹罗刺盘孢（Colletotrichum siamense）。这是国内油茶上C.siamense的首次报道。
- 李河周国英徐建平
- 关键词：油茶COLLETOTRICHUM炭疽病病原菌
- 纽芬兰鸡油菌群体遗传多样性的主要影响因素分析
- 2023年
- 纽芬兰鸡油菌是北美东部一种深受欢迎的美味食用菌。火烧山,位于加拿大格罗莫恩国家公园中心、三面环水,该地纽芬兰鸡油菌的持续出菇时间至少可追溯至20世纪60年代且未见于周边地区。研究该持续存在的孤立种群,对于资源保护和开发具有重要意义。本研究在火烧山共采集纽芬兰鸡油菌子实体109个,包括间距100 m以上的6个局域群体共81个个体以及5 d后随机采集的28个个体。基于微卫星标记的基因分型结果显示,3个位点上分别有3、5和2个等位基因,而每个局域群体的各位点均被1到2个等位基因主导;共有多位点基因型29个。每个局域群体和总样本中的基因型频率总体上符合哈迪-温伯格平衡。虽然总样本中存在显著的遗传分化,但克隆校正后未检测到差异。比较间隔5d的两次取样,等位基因和基因型频率存在微小差异。此外,与纽芬兰岛另外两地(分别相距约200 km和600 km)和安大略省哈密尔顿市一地(约2000 km外)共3个地区群体样本进行了比较。结果表明,突变、有性生殖、基因流、选择和遗传漂变都对纽芬兰鸡油菌种群的遗传多样性产生了影响。
- 赵宽徐建平
- 关键词：鸡油菌微卫星位点基因频率
- 基因型和环境互作在食用菌育种中的潜力和应用被引量：15
- 2018年
- 与动植物育种目标类似,食用菌育种的目标是利用菌株和种群的天然表型变异来繁育满足人们需求的优良栽培品种。要进行高效的食用菌育种,既需要了解菌株自然的基因型和表型的变异,也需要一套能够结合所需基因和性状的育种方法。笔者简要说明基因型和环境互作(genotype-environment interactions,GEI)是食用菌育种时应考虑的关键因素的理由,并阐述通过改进实验设计来准确评估GEI的方法。以香菇(Lentinula edodes)、金针菇(Flammulina velutipes)和双孢蘑菇(Agaricus bisporus)为例,探讨了有效利用GEI不仅可以得到新的基础生物学数据,而且可以培育出食用菌新品种。这些新知识和品种不仅可以满足特定地区的栽培需求,而且可减少食用菌菌株的退化。
- 徐建平王汉臣王汉臣
- 关键词：种质分子标记数量性状位点
