王其强
- 作品数：3 被引量：4H指数：2
- 供职机构：江南大学理学院更多>>
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- 相关领域：生物学理学医药卫生更多>>
- 基于碱基三周期性研究P53家族基因的特征被引量：2
- 2013年
- 为了进一步研究P53抑癌基因的性质,采用信号处理和分析的方法,在Voss数值映射下,利用离散傅里叶变换,结合出现最大功率谱位置的频率与1/3的差值(d)及信噪比(R)两个指标,来讨论P53家族基因的碱基三周期性。选取人类P53家族(P53、P63和P73)DNA序列及家鼠P53家族DNA序列的外显子,讨论了其三周期性与外显子长度、碱基成分及碱基分布的关系,在三周期性的前提下分析了P53基因密码子的偏好性。结果表明:P53家族基因的短外显子(N<100)碱基三周期性不显著,P53家族基因的较长外显子(100≤N<1000)碱基三周期性较显著;具有三周期性的外显子GC、GC3含量较高,且GC含量和功率谱峰值显著相关,说明三周期性与碱基成分及分布相关;具有三周期性的外显子频谱最大值处为G或C的可能性高,且GC3含量高,R值与最优密码子使用频率正相关,说明功率谱峰值与P53家族基因密码子偏好性具有相关性。该研究结果对P53家族基因的进一步研究具有重要的理论和现实意义。
- 王其强谈承杰晏寒冰朱平
- 关键词：功率谱信噪比
- P53基因三周期性与密码子偏好性的相关性被引量：2
- 2014年
- 为了进一步研究分析P53抑癌基因的性质,对P53基因的蛋白质编码区以及对应的mRNA的三周期性进行比较分析.通过同义密码子相对使用度和拟同义密码子相对使用度方法对其分别进行计算,分析了蛋白质编码区密码子的偏好性以及mRNA密码子的偏好性.结果表明:P53蛋白质编码区具有很强的三周期性,而对应的mRNA不具有三周期性;P53蛋白质编码区的密码子偏好G或C结尾的密码子程度强于对应的mRNA.说明P53基因密码子的偏好性与三周期性紧密相关,密码子的偏好程度影响着三周期性.进一步从生物角度诠释了P53蛋白质编码区和对应mRNA三周期性的异同.结合P53基因这一特性,有助于提高其基因识别的正确率,对P53基因的深入研究具有重要的意义.
- 王其强谈承杰朱平
- 关键词：P53基因
- 基于模糊综合评价方法对TP53家族的mRNA序列的分析及应用
- 2012年
- p53蛋白在人体肿瘤当中具有重要作用,它已成为癌症治疗的焦点.本文利用数学中模糊综合评价的方法通过建立隶属函数,对人类TP53、TP63以及TP73的mRNA序列及其蛋白质序列进行了分析,讨论了以不同碱基(a,c,g,u(t))结尾的密码子对它们的氨基酸亲疏水性的影响程度.结果表明:以碱基c结尾的密码子对TP53、TP63和TP73的氨基酸的亲疏水性的影响程度为非常强,以碱基u(t)结尾的密码子对其影响程度为强,以碱基g结尾的密码子对其影响程度为中,以碱基a结尾的密码子对其影响程度为弱.
- 孔娟娟王其强朱平
- 关键词：MRNA序列隶属函数
