王志鹏
- 作品数:15 被引量:32H指数:3
- 供职机构:中国农业大学更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划国家杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 利用贝叶斯网络模型推断基因调控网络方法的比较研究
- 在利用基因芯片的高通量特性的情况下,研究者们希望利用这些数据获得基因间的调控关系,提出的推断方法很多,如布尔网络、相关分析、微分方程、贝叶斯网络等。本文研究了现在较为热点的贝叶斯网络模型,主要对它的结构学习算法进行了比较...
- 王志鹏
- 关键词:贝叶斯网络贪婪算法基因调控
- 文献传递
- 猪2、7和8号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)检测被引量:5
- 2008年
- 以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测.通过似然比检验,并以自由度为2的卡方分布作为检验统计量的分布,共发现22个在P<5%水平下显著的QTL,其中在2号染色体上有9个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞体积、血红蛋白含量、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、平均血小板体积、血小板分布宽度和血小板压积,在7号染色体有7个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞血红蛋白浓度、血红蛋白含量、血小板总数、平均红细胞体积和红细胞分布宽度变异,在8号染色体上有6个,分别影响中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、血小板压积和平均红细胞体积.为尽可能地避免由于多重检验所造成的假阳性率的升高,我们采用了控制假检出率(false discovery rate,FDR)的方法来对这22个QTL进行进一步检验,发现有14个达到FDR<5%显著水平,其中又有9个达到FDR<1%显著水平.
- 巩元芳卢昕王志鹏李珊邱小田张勤
- 关键词:血常规指标
- 一种用于一般系谱的零重组单倍型推断方法被引量:1
- 2007年
- 大量单核苷酸多态标记(single nucleotide polymorphism,SNP)的出现,使以单个标记为中心的关联分析方法逐渐转变成以单倍型为主的关联分析方法.以单倍型为主的分析方法的首要问题是如何获取单倍型.通过实验手段获取单倍型成本较高,利用基因型数据通过单倍型推断获取单倍型是当前首选方法.针对一般系谱和紧密连锁的SNP标记,本研究提出了一种快速和准确的单倍型推断方法.该方法通过3步6条规则,利用亲子关系确定有序基因型,逐步剔除多余的单倍型,最后通过最大似然法确定单倍型组合.利用模拟数据验证在不同系谱大小、不同标记数目和不同标记基因型缺失率等参数组合条件下单倍型推断方法的效率和准确性,并与PEDPHASE程序作比较.结果表明我们的方法的运行速度和准确性都优于PEDPHASE.本方法的运行速度比PEDPHASE快10~15倍,准确性高4%~10%.同时结果还说明了本方法的准确性几乎不受系谱大小、标记数目和标记基因型缺失率的影响.
- 王春考王志鹏邱小田张勤
- 牛全基因组预测转录因子数据库
- DCTF利用HMMER在全基因组范围内预测了牛(Bos taurus)5479个预测转录因子,这些转录因子一共涉及了64个蛋白质家族。所收录数据是非冗余的。同时DCTF还包含每个转录因子所涉及的注释信息:序列特点,功能结...
- 王志鹏张勤
- 关键词:转录因子数据库全基因组表型性状
- 文献传递
- 标记辅助导入中不同背景选择方法的比较被引量:8
- 2006年
- 模拟比较了随机选择、标记值选择及BLUP选择3种背景选择方法在标记辅助导入(利用标记辅助将供体群中的一个有利QTL等位基因导入到受体群中)的选择效果。前景选择是借助与目标基因连锁的两侧标记对目标基因进行间接选择。研究结果表明,在背景选择中,利用标记值选择能使受体基因组很快得到恢复,2个世代的回交就能恢复90%以上,4个世代的回交就能完全恢复。利用BLUP选择虽然不能使受体基因组迅速全部恢复,但能使特定的背景性状得到最大的遗传进展。
- 白俊艳张勤丁向东王春考殷宗俊王志鹏
- 关键词:标记辅助导入
- 一种用于圆形喷灌机喷灌施肥的注射喷嘴
- 本发明涉及一种用于圆形喷灌机喷灌施肥的注射喷嘴,其特征在于:它包括一长条状的喷嘴主体,喷嘴主体内部设置一条由宽逐渐变窄的收缩型流道;喷嘴主体的流道较宽的一端连接一喷嘴帽,喷嘴主体的另一端插入圆形喷灌机进水管内,且该端部一...
- 严海军王志鹏马开
- 文献传递
- 一种泵注式施肥装置
- 本实用新型涉及一种泵注式施肥装置,其特征在于:它包括底座、动力装置、肥量调节装置、缸体托架、活塞缸和肥料桶;动力装置、肥量调节装置、缸体托架、活塞缸设置在底座上;肥量调节装置包括刻度曲柄、行程调节螺钉、连杆螺栓、连杆和连...
- 严海军马开王志鹏
- 文献传递
- 一种用于圆形喷灌机喷灌施肥的注射喷嘴
- 本发明涉及一种用于圆形喷灌机喷灌施肥的注射喷嘴,其特征在于:它包括一长条状的喷嘴主体,喷嘴主体内部设置一条由宽逐渐变窄的收缩型流道;喷嘴主体的流道较宽的一端连接一喷嘴帽,喷嘴主体的另一端插入圆形喷灌机进水管内,且该端部一...
- 严海军王志鹏马开
- 文献传递
- 畜禽血液资源的开发利用进展被引量:17
- 2007年
- 本文阐述了国内外近年来畜禽血液资源在食品和饲料工业领域的开发利用情况,其中重点介绍了微生物发酵法在畜禽血液资源开发中应用研究进展,以及生物技术在开发高附加值血粉饲料中的应用前景。
- 朱森阳汪国和王志鹏
- 关键词:血粉喷雾干燥微生物发酵
- 一种泵注式施肥装置
- 本发明涉及一种泵注式施肥装置,其特征在于:它包括底座、动力装置、肥量调节装置、缸体托架、活塞缸和肥料桶;动力装置、肥量调节装置、缸体托架、活塞缸设置在底座上;肥量调节装置包括刻度曲柄、行程调节螺钉、连杆螺栓、连杆和连杆器...
- 严海军马开王志鹏
- 文献传递