鲍卫华
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
- 供职机构：内蒙古大学理工学院物理系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 预测线虫和酵母基因组中内含子、外显子及基因间序列的离散增量方法被引量：5
- 2004年
- 把基因组中的内含子、外显子和基因间序列分为三类序列,从这些序列中取64种三核苷的重复出现次数作为离散源的状态参数,计算三类序列的标准离散量,比较待测序列的离散量与三个标准离散量之间的离散增量值,由离散增量的最小值决定待测序列属于哪一类.本文用离散增量方法对线虫和酵母序列进行预测,结果表明,对酵母内含子预测的敏感性为81.5%,对外显子预测的敏感性为88.5%、特异性为99.6%,对基因间序列预测的敏感性为65.4%、特异性为87.5%;若以在相同长度区间的序列为标准离散源,预测相应长度区间的序列,对线虫内含子的预测的敏感性为82.2%、特异性为94.2%,对外显子预测的敏感性为91.1%、特异性为97.5%,对基因间序列预测的敏感性为78.8%.
- 鲍卫华李前忠
- 关键词：离散量
- 线虫和酵母基因组中简单串联重复序列的统计分析
- 2003年
- 本文分析了线虫和酵母基因组中1-3核苷酸的串联重复序列,对比这样的序列在内含子、外显子和基因间区域的分布情况,发现不同的重复模式在不同区域的重复特点各不相同,尤其是三核苷的重复在编码区和非编码区中的分布有显著的差异,在外显子中AAG模式的重复占优势,在内含子和基因间序列中AAT模式的重复占优势,CCG模式的重复在任何序列中均罕见.
- 鲍卫华王纯燕
- 关键词：三核苷酸外显子
