吴群英
- 作品数:38 被引量:91H指数:6
- 供职机构:桂林医学院更多>>
- 发文基金:新世纪广东省高等教育教学改革工程项目广西教育厅科研项目广西壮族自治区科技攻关计划更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学文化科学生物学更多>>
- 肝细胞癌预后、诊断和免疫细胞浸润相关关键基因及其潜在治疗药物的生物信息学分析
- 2024年
- 目的:利用生物信息学分析方法筛选与肝细胞癌(HCC)患者预后、诊断和免疫细胞浸润相关的关键基因,并分析其潜在治疗药物。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC基因表达谱数据及相应的HCC患者临床信息。采用R软件limma包筛选HCC差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,使用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化并筛选关键基因。通过Kaplan-Meier生存曲线和LASSO回归算法鉴定HCC预后相关关键基因,并利用外部数据集对其表达进行验证和诊断效能分析。采用CIBERSORT算法评估预后相关的关键基因表达与HCC免疫细胞浸润的关系。利用MiRNet和Network Analyst数据库分别构建微小RNA(miRNA)-关键基因mRNA和转录因子(TFs)-关键基因mRNA分子调控网络。利用CMap数据库筛选潜在治疗HCC的小分子药物。结果:共筛选出146个DEGs,其中表达上调基因30个,表达下调基因116个。GO功能和KEGG信号通路富集分析,DEGs明显富集在类固醇、烯化合物和激素代谢等生物过程(BP)及视黄醇代谢、药物代谢-细胞色素P450(CYP450)、补体和凝血级联反应等信号通路。PPI网络分析筛选得到14个关键基因,其中甲酰氨基转移酶环化脱氨酶(FTCD)、分泌型磷蛋白2(SPP2)、凝血酶-抗凝血酶复合物(TAT)、补体C6(C6)和CYP450家族成员2C9(CYP2C9)与HCC患者预后、临床病理分期和组织学分级有明显相关性,在HCC诊断中具有较高的诊断效能,与HCC的免疫细胞浸润有密切关联。Hsa-mir-182-5p、同源框CUT样蛋白1(CUX1)、早期生长反应1(EGR1)、SMAD家族成员4(SMAD4)和肿瘤蛋白P53(TP53)是靶向上述预后相关关键基因的重要调控因子。DL-硫沙芬(DL-thiorphan)、异丙嗪(promethazine)和芹菜素(apigenin)可能对HCC有治疗作用。结论:FTCD、SPP2
- 黎金连黄岚珍黄希仕李康智蒋佳丽张苗苗吴群英
- 关键词:肝细胞癌小分子药物生物信息学
- 八角莲不定芽的快速培育被引量:1
- 2015年
- 目的探讨八角莲根状茎不定芽快速培育的方法。方法采用L9(33)正交法,对根状茎结节进行浸泡之后,将根状茎栽入培养土中,再用对应的激素水溶液代替自来水进行培养。结果八角莲不定芽快速培育的最佳处理为:选取根状茎第一节结节,BA1.0mg/L+TDZ0.2mg/L激素水溶液中浸泡24h,不定芽诱导效果最好,每个根状茎诱导的不定芽数可达5~7个。结论用激素水溶液对八角莲根状茎进行浸泡预处理和浇灌,能显著提高八角莲不定芽的产量。
- 徐铭泽陆艳芝朱应红刘燕飞黄碧霞赵雪艳吴群英
- 关键词:八角莲根状茎不定芽植物激素
- 白头叶猴食叶适应相关的特定基因和通路的多组学研究
- 2023年
- 探究基因组及转录机制在白头叶猴(T. leucocephalus)食叶适应中的潜在作用,为后续保护工作提供理论依据。方法 我们对广西地区2只白头叶猴的12份样本进行了高通量测序并构建系统发育分析。结果 与14种灵长类动物基因组相比,有35个基因组显著扩增的基因家族与基础代谢、能量产生和外源性生物降解相关。这些扩增的基因家族在多种组织中表达。并且,我们也发现了一些与味觉、嗅觉和食物选择相关的收缩基因家族。结论 这些显著扩增的基因家族,主要参与基础代谢和能量代谢,增强了白头叶猴对叶片的消耗,促进了能量的产生,以适应叶片缺乏时的低每日能量生产。同时,为了适应食叶的需求,白头叶猴的收缩基因家族也出现了相应的进化。
- 韦惜华陈盘余李兰香吴群英胡艳玲
- 关键词:白头叶猴
- 罗汉果组培苗脱毒方法研究被引量:7
- 2012年
- 采用热处理结合茎尖技术对罗汉果组培苗进行脱毒培养,并用间接酶联免疫法和电镜观察法对脱毒效果进行检测.结果表明.组培苗经38.5℃热处理10d后,剥取0.2~0.5mm微茎尖培养或切取1.0~1.5mm茎尖进行二次茎尖脱毒培养,茎尖苗的脱毒率均为100%,建立了两种有效的罗汉果组培苗脱毒方法。
- 吴群英李伯林李景云
- 关键词:茎尖培养酶联免疫法脱毒
- 医学院校生物技术大实验课程教学改革探讨被引量:3
- 2015年
- 本文针对我校目前在生物技术专业开设的生物技术大实验课程教学过程中所采用的方法进行探讨,总结存在的不足及取得的成绩。在不继改革的基础上结合专业及课程特点,尝试开展了"两步法"(必做模块和选作模块的实验)教学模式,采取创新型和研究型实验教学体系,培养学生的综合技能,提高实验操作水平。
- 韦日明蒋林彬吴群英刘健翔肖福英
- 关键词:生物技术大实验两步法教学改革
- 漱口水对大蒜根尖细胞遗传损伤作用的研究
- 2019年
- 用不同浓度的漱口水溶液分别处理大蒜根尖8、12和24h,利用微核技术,研究漱口水对大蒜根尖细胞遗传损伤作用。结果表明,与对照组相比,漱口水处理组细胞微核率增加(P<0.05),分裂细胞数减少,分裂指数下降(P<0.05),表明漱口水对大蒜根尖细胞有遗传损伤作用。
- 李俊辰刘忠湫蔡得阳黎金连钟海凤林军吴群英
- 关键词:漱口水微核率有丝分裂指数
- 先天性外胚层发育不良一家系
- 2005年
- 肖福英韦日明蒋林彬刘健翔吴群英
- 关键词:先天性外胚层发育不良家系疾病染色体
- 遗传性多发性骨软骨瘤一家系11例被引量:6
- 2005年
- 肖福英蒋林彬刘健翔韦日明吴群英
- 关键词:遗传性多发性骨软骨瘤X线检查骨骼发育障碍常染色体显性遗传
- 青钱柳不同外植体组织培养及褐变防止的研究被引量:23
- 2008年
- 目的探索青钱柳快速繁殖途径和褐变的防止方法。方法分别在不同季节采取青钱柳的嫩芽、带节茎段和嫩叶作为外植体,对外植体进行4种不同方式的处理后,接种到不同激素种类和激素组合的培养基中进行培养。结果春季取材更易诱导出愈伤组织和新芽;诱导茎段出芽的最佳培养基为B5+BA3.0 mg/L+NAA0.1 mg/L+IBA0.01 mg/L;适宜于嫩叶、嫩芽愈伤组织诱导的培养基分别为:B5+BA5.0 mg/L+NAA0.1 mg/L+IBA0.1 mg/L和B5+2,4-D1.0mg/L+BA0.1mg/L;外植体先于4℃低温预处理5 d和直接用烧红的手术刀快速切割外植体后再进行接种可有效减少外植体的褐变。结论青钱柳组织培养可诱导芽的产生和愈伤组织的形成。
- 吴群英徐庆李丽亚梁荣感龚受基
- 关键词:青钱柳褐变
- 罗汉果脱毒苗大田性状研究被引量:1
- 2013年
- 对罗汉果组培苗进行了大田种植,探讨了罗汉果脱毒苗和常规苗的生产性能。结果表明:除大田移栽存活率偏低外,罗汉果脱毒苗表现出较好的生产性状,当年单株挂果最高可达100个,在生产上具有很好的推广前景。
- 吴群英李伯林李景云
- 关键词:脱毒苗