耿佳宁
- 作品数：7 被引量：39H指数：3
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生更多>>
- 中国地鼠微卫星遗传标记及其筛选方法
- 本发明涉及一种动物DNA分子遗传标记技术，具体为一种中国地鼠微卫星遗传标记及其筛选方法，解决未见有关于中国地鼠微卫星标记的报道，以及筛选微卫星标记的方法中采用酶切法将DNA基因组打碎，存在很多问题，本发明提取中国地鼠基因...
- 宋国华胡松年刘田福耿佳宁岳文斌高莉
- 文献传递
- 副血链球菌基因组测序分析和微卫星富集文库构建及多态性验证
- 第一部分副血链球菌全基因组测序及分析
副血链球菌FW213(Streptococcusp arasanguinis FW213)是一株革兰氏阳性的口腔病原菌，它是口腔牙菌斑最早的定殖菌，可以使其他口腔细菌粘附，从而...
- 耿佳宁
- 复杂基因组测序技术研究进展被引量：21
- 2018年
- 复杂基因组指的是无法使用常规测序和组装手段直接解析的一类基因组,通常指包含高比例重复序列、高杂合度、极端GC含量、存在难消除异源DNA污染的基因组。为了解决复杂基因组的测序和组装问题,需要分别从基因组测序实验方法、测序技术平台、组装算法与策略3个方面进行深入研究。本文详细介绍了复杂基因组测序组装相关的现有技术与方法,并结合复杂基因组经典实例介绍了复杂基因组测序的技术解决途径和发展历程,可为制订合适的复杂基因组测序策略提供参考。
- 高胜寒禹海英吴双阳王森耿佳宁骆迎峰胡松年
- 茶薪菇国内外研究进展及展望被引量：4
- 2012年
- 综述了茶薪菇及相近物种的国内外研究现状,讨论了茶薪菇产业发展存在的问题和发展前景。通过与相近物种比较,为探索茶薪菇菌种退化机制提供研究方向,促进茶薪菇产业可持续发展。
- 刘万飞路等学赵宇慧宋述慧耿佳宁胡松年
- 关键词：茶薪菇
- 中国地鼠微卫星DNA引物的设计及筛选
- 2012年
- 本研究旨在筛选中国地鼠微卫星位点,为中国地鼠遗传分析提供遗传标记。根据建立的中国地鼠微卫星富集文库,对筛选的含微卫星DNA序列的克隆应用引物设计软件Primer 3.0设计引物135对,选择合成11对理论上易出现影子带的引物,用20个中国地鼠个体对这些引物进行了评估。结果显示,11对引物均能扩增出谱带,这11条带的平均多态信息含量(PIC)为0.4195,平均观察杂合度(Ho)为0.3895,平均期望杂合度(He)为0.4565,每个位点的平均等位基因数为5.818。筛选出的微卫星位点均可用于中国地鼠种群遗传结构分析,这将为中国地鼠品种选育、种系评估提供更多的微卫星遗传标记信息。
- 宋国华耿佳宁贾若愚岳文斌刘田福胡松年
- 关键词：中国地鼠微卫星基因组文库
- 基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究策略简介被引量：11
- 2011年
- 随着基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究越来越广泛,选择合适的研究策略变得越来越重要。就基于第二代测序技术的细菌基因组和转录组研究策略进行综述,并简要介绍细菌基因组和转录组研究中的机遇和挑战。综述细菌基因组与转录组研究的常规方法及步骤,并简要地介绍存在的问题。细菌基因组和转录组研究策略为大多数细菌的研究提供了一个相对完整的研究路线,同时也会促进其它领域的研究,如生命形成、生物进化、基础代谢、疾病、药物等。
- 刘万飞王西亮赵宇慧曾瀞瑶耿佳宁胡松年
- 关键词：细菌基因组转录组
- 中国地鼠基因组微卫星富集文库的构建与分析被引量：3
- 2011年
- 目的筛选中国地鼠微卫星位点,为中国地鼠种质资源的分类、进化等遗传研究奠定基础。方法中国地鼠基因组DNA经超声打碎,用2%琼脂糖凝胶电泳回收500～1000 bp的DNA片段,与SNX连接头连接,连接产物与生物素标记的14种微卫星探针变性及退火,再通过链亲和素偶联磁珠亲和捕捉,经吸附、洗涤及洗脱,然后以洗脱产物为模板,通过PCR扩增,与pGEM-T载体连接,转化大肠杆菌DH10B,构建中国地鼠微卫星DNA富集文库。结果测序结果发现,微卫星DNA序列的阳性克隆占70.3%。结论中国地鼠微卫星文库的建立和微卫星的筛选将为下一步进行中国地鼠遗传连锁图谱的构建、分子进化和系统发育研究提供大量的微卫星标记。
- 宋国华耿佳宁贾若愚岳文斌刘田福胡松年
- 关键词：中国地鼠微卫星富集文库
