公共文化服务平台

血浆SFMBT2基因甲基化在结直肠癌中转移预测及动态监测中的应用: 本发明提供了检测血浆中SFMBT2基因甲基化在预测结直肠癌转移及动态监测诊断中的应用，所述SFMBT2基因甲基化位点包括：chr10_7452763、chr10_7452778、chr10_7452791、chr10_7...; 梁莉王蔚范建兵蓝孝亮黄仲曦吴雪辉

原位杂交检测尸检组织中SARS-CoV RNA被引量：10: 2003年; 目的从分子水平检测急性重症呼吸综合征(SARS)患者的病变组织中SARS病毒(SARS-associated coronavirus, SARS-CoV)的存在和分布情况。方法应用原位杂交技术检测因SARS死亡患者的肺、脾脏、淋巴结、垂体、胰腺、甲状旁腺、肾上腺、胃肠道、皮肤、脑、肝、肾、血管、四肢横纹肌组织、骨髓、心脏、卵巢、子宫和睾丸等组织的SARS-CoV RNA的表达和定位。结果尸检组织多部位(包括肺泡上皮细胞、气管及支气管浆液腺上皮细胞、肺内单核/巨噬细胞、脾脏和淋巴结的单核/巨噬细胞、胰腺腺泡细胞、垂体嗜酸性细胞、肾上腺皮质细胞、甲状旁腺嗜酸性细胞、食道鳞状上皮、胃肠道上皮细胞及胃粘膜壁细胞、皮肤汗腺细胞、大脑神经元细胞、肝细胞、肾远曲小管上皮细胞、骨髓早幼粒细胞及小静脉内皮细胞)SARS-CoV RNA阳性。结论SARS-CoV可侵犯全身多种器官;SARS-CoV在机体的分布情况与冠状病毒受体CD13分布相似;皮肤汗腺、消化道上皮及肾远曲小管上皮细胞SARS-CoV RNA阳性对确定SARS传播途径具有重要意义。; 张庆玲丁彦青候金林贺莉黄仲曦王慧君蔡俊杰张进华张文丽耿舰李欣康伟杨磊申洪李祖国韩惠霞陆药丹; 关键词：原位杂交尸检组织 SARS

SARS冠状病毒N蛋白单克隆抗体在SARS尸检组织中的表达被引量：16: 2003年; 目的观察SARS死者的尸检组织中SARS冠状病毒(SARS-CoV)的存在与分布情况。方法应用免疫组化技术检测4例尸检标本肺、脾脏、淋巴结、脑、垂体、心、肝、肾、胰腺、气管、食道、胃肠道和骨髓等组织的SARS-CoV N蛋白。结果肺泡上皮、肺、脾、淋巴结内浸润的单核细胞/巨噬细胞、脑神经元、肝细胞、肾远曲小管上皮细胞、胰腺腺泡细胞、垂体嗜酸细胞、甲状旁腺嗜酸性细胞、肾上腺皮质细胞、气管及支气管浆液腺上皮细胞、食道粘膜鳞状上皮、胃肠道柱状上皮细胞及胃壁细胞、骨髓早幼粒细胞及小静脉内皮细胞等细胞质内SARS-CoV N蛋白单克隆抗体均为阳性。结论SARS-CoV可侵犯全身多种器官和组织。SARS-CoV N蛋白单克隆抗体在胃肠道、肾远曲小管及汗腺细胞内的阳性表达,对研究SARS-CoV传播途径具有重要意义。; 贺莉丁彦青车小燕张庆玲黄仲曦王慧君申洪李祖国蔡俊杰张进华耿舰李欣张文丽韩慧霞康伟杨磊陆药丹; 关键词：SARS冠状病毒尸检组织 SARS-COV

应用文献轮廓挖掘技术分析黑斑息肉综合征差异表达基因: 2008年; 目的探索黑斑息肉综合征(PJS)特异性相关基因。方法根据PJS基因谱表达系列,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Med-line文献数据库中提取基因的相关文献并分析词的频率,再基于重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后基于词的发生频率对基因进行功能聚类。结果从PJS患者的特异差异表达基因谱中得到270个已知基因名称的差异表达基因,从聚类结果看,是与"遗传"和"先天缺陷""肿瘤""肌肉""突变"关系密切的基因聚在一起,包括了COL6A2和COL6A3两个基因。结论COL6A2和COL6A3可能是PJS特异性相关基因。; 戴益琛黄仲曦宋于刚谢军培曾伟; 关键词：黑斑息肉综合征微阵列数据挖掘生物信息学

鼻咽癌淋巴结转移动物模型的建立及其转移相关标签基因的筛选被引量：9: 2008年; 目的建立稳定的鼻咽癌(NPC)淋巴结转移模型,筛选鼻咽癌淋巴结转移的候选标志基因。方法我们用鼻咽癌5-8F-EGFP细胞株建立了稳定淋巴结转移可视化裸鼠模型,筛选获得具有淋巴结转移潜能的5-8F-LN鼻咽癌细胞。通过文献数据挖掘获得乳腺癌,头颈部鳞癌等肿瘤的转移标签基因和淋巴结转移标签基因,结合鼻咽癌5-8F和6-10B细胞株约307个差异性表达基因得到21个重叠的基因,最终分析得到3个可能促进恶性肿瘤转移的高表达基因:ADM,IRF1和CAV1。通过荧光定量PCR验证在5-8F-EGFP,6-10B-EGFP,5-8F-LN和NP69细胞中的表达情况。结果IRF1在5-8F-EGFP、6-10B-EGFP和5-8F-LN中的表达远高于在NP69中的表达,且差别有统计学意义(P=0.008、0.022、0.006);CAV1在5-8F-EGFP中的表达高于其在6-10B-EGFP中的表达(P=0.014);ADM在4种细胞中的表达无明显差别。结论IRF1可能在鼻咽癌演进过程中起着重要作用,而CAV1在5-8F-EGFP中的相对高表达可能和其高转移特性有关。; 冷雷刘腾飞黄仲曦谢卫兵姚开泰; 关键词：鼻咽癌荧光定量PCR

基于差异性表达谱分析挖掘不同亚型鼻咽癌的保护性转录因子: 2013年; 目的探究41例鼻咽组织活检样本中差异基因表达谱所显示的失调基因及挖掘调控这些基因的转录因子。方法利用EXCEL及生物信息学方法分析Ⅰ、Ⅱ型鼻咽癌(NPC)患者鼻咽组织活检样本中差异表达基因谱,挖掘出同时符合以下条件的转录因子:(1)在两组差异表达基因的结合位点具有统计学意义;(2)鼻咽组织中转录因子与基因的表达存在相关性;(3)相关基因的表达至少有40%是受转录因子影响的。结果在Ⅰ型NPC较Ⅱ型NPC上调的差异表达基因谱("Ⅰ_Ⅱ_Up")中,找到对应的符合条件的转录因子有80个。其中RUNX3、GATA3、NR3C1、NRF1、RXRA、SMAD7、TBP、ZBTB6等8个正调节因子和HLF、MTF1等2个负调节因子,它们调控与T细胞受体信号通路相关的基因。然而在Ⅰ型NPC较Ⅱ型NPC下调的差异表达基因谱("Ⅰ_Ⅱ_Down")中,未找到符合条件的转录因子。结论通过分析Ⅰ、Ⅱ型NPC患者鼻咽组织活检样本的差异表达基因谱发现,Ⅰ型NPC(NPC_Ⅰ)患者的差异表达基因主要与机体免疫反应相关,利用EXCEL及生物信息学方法,挖掘出8个正调节因子和2个负调节因子,主要调控与T细胞受体信号通路相关的基因。预测到的这10个转录因子有可能成为药物研发的新靶点,通过增强机体免疫防御能力,有望提高NPC患者的生存率。但研究中未能发现与"Ⅰ_Ⅱ_Down"基因谱明显相关的转录因子,这可能与NPC_Ⅱ患者差异表达基因受转录因子、DNA修饰、磷酸化、染色体变异、环境等多因素影响有关。; 黄春月林沛汪佳宏黄仲曦; 关键词：鼻咽癌免疫防御生存率

构建大肠癌细胞相关基因Nrf3融合蛋白真核表达载体及其体外转染的初步功能分析被引量：2: 2007年; 目的:应用基因芯片生物信息学分析思路筛查大肠癌细胞相关基因Nrf3,构建融合蛋白真核表达载体,检测其对体外转染癌细胞周期与凋亡的影响。方法:实验于2004-01/2006-07在南方医科大学病理解剖教研室及肿瘤研究所与中国农业大学农业生物技术国家重点实验室完成。①实验材料:大肠癌细胞组织及其配对的正常大肠黏膜各3例,由解放军总医院病理科提供;大肠癌LoVo细胞系由南方医科大学肿瘤研究所提供;肝癌SMMC7721细胞系由解放军军事医学科学院放射医学研究所提供;真核表达载体pEGFP-N1(Clontech公司)。②实验方法:分别应用Excel表、Affymetrix Microarray Suite Software 5.0分析软件和STATA7.0分析软件,对基因芯片表达谱数据行交集补集分析、秩和检验及T检验,筛选"最重要的大肠癌细胞差异表达基因&ESTs",差异表达P<0.05,差异倍数>2。应用文献轮廓法进一步分析确定首选研究基因为Nrf3,提取组织样品总RNA,cDNA合成,PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳分离后回收纯化,插入T载体中,SalⅠ和BamHⅠ双酶切后连接到pEGFP-N1载体,获得重组pEGFP-N1-Nrf3质粒。LoVo细胞在体外加入含体积分数为0.1小牛血清、100u/mL青链霉素的RPMI-1640培养基,置于37℃、体积分数为0.05的CO2饱和湿度培养箱中,待转染质粒pEGFP-N1-Nrf3与阴性对照质粒pEGFP-N1转染36h后,荧光显微镜观察候选基因亚细胞定位,FCM分选术观察其在体外对LoVo细胞周期和凋亡的影响。同法观察重组pEGFP-N1-Nrf3质粒体外转染对SMMC7721细胞周期和凋亡的影响。结果:①首选研究大肠癌细胞相关基因的确认:多种统计学方法分析获得最重要的大肠癌细胞相关基因17个,文献轮廓法进一步确认Nrf3为首选研究基因。②Nrf3基因表达:RT-PCR法检测Nrf3在3例大肠癌细胞组织均有表达,而在与其相配对的正常黏膜中表达较弱或不表达,与芯片检测结果基本一致;Nrf3在LoVo细�; 王强李晓利白雪娟黄仲曦崔春平丁彦青张金萍姚开泰许红民; 关键词：基因表达谱质粒大肠癌流式细胞术

一种与特定功能相关的基因信息检索系统及用于该系统的检索词数据库的构建方法: 本发明公开一与特定功能相关的基因信息检索系统，该系统利用具有输入和显示终端的计算机和在机内构建的由基因名称数据库、词频基值数据库、字符串数据库和辅助检索词数据库组成的文献检索词数据库，通过网络服务器进入公共生物医学文献数...; 黄仲曦姚开泰; 文献传递

鼻咽癌EMT相关基因的筛选及生物信息学分析被引量：2: 2010年; 目的利用生物信息学方法挖掘鼻咽癌上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)发生的潜在分子机制。方法从公共基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)中寻找并下载鼻咽癌的相关基因芯片数据,并使用Genclip软件对下载的数据进行分析,寻找鼻咽癌公共基因芯片数据中与EMT相关的基因,并用生物信息学方法对筛选出来的基因作进一步分析。结果在公共的鼻咽癌芯片数据中找到35个与EMT相关的差异表达基因,这些基因功能大致与细胞组分、细胞粘附、通信、信号转导、分化、运动、迁移以及细胞表面受体相关的信号转导等有关,这些功能往往都被认为与肿瘤的侵袭和转移有关。结论利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息。鼻咽癌EMT是由于多种基因表达改变所致,这为确定鼻咽癌早期转移诊断标志与预后的预示开辟了新的思路。; 陈靖樊英李佳黄仲曦姚开泰; 关键词：鼻咽癌 EMT 生物信息学 GEO

鼻咽癌凋亡及增生相关基因筛选与分析被引量：3: 2009年; 目的筛选及分析鼻咽癌发生发展过程中的细胞凋亡相关基因及增生相关基因。方法结合GO分类从本实验室已有的鼻咽癌基因芯片数据中筛选异常表达的细胞凋亡相关基因及细胞增生相关基因;根据鼻咽癌发生发展的树模型提示的三个阶段,找出各阶段的鼻咽癌细胞凋亡相关基因及细胞增生相关基因;再结合文献进一步分析两种基因在鼻咽癌发生树模型中的分布特点及规律。结果鼻咽癌细胞凋亡相关基因19个,其中处于染色体丢失区段的下调鼻咽癌细胞凋亡相关基因9个(DNASE1L3等)、处于染色体扩增区段的上调鼻咽癌细胞凋亡相关基因10个(DEDD等)。鼻咽癌细胞增生相关基因21个,其中处于染色体丢失区段的下调鼻咽癌细胞增生相关基因8个(TUSC2等)、处于染色体扩增区段的上调鼻咽癌细胞增生相关基因13个(EMP1等)。处于染色体丢失区段的下调鼻咽癌细胞凋亡相关基因多参与诱导或调控细胞凋亡;而处于染色体扩增区段的上调鼻咽癌细胞增生相关基因多参与正调控细胞增生。结论鼻咽癌可能存在两种发生方式:一种以凋亡受抑为主要原因;另一种以增生过度为主要原因。; 周毅波黄仲曦任彩萍祝斌姚开泰; 关键词：鼻咽癌树模型细胞增生

渝B2-20050021-1　渝公网安备 50019002500403号　违法和不良信息举报中心　互联网出版许可证　新出网证(渝)字10号

黄仲曦

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

黄仲曦

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈