严立成
- 作品数：4 被引量：6H指数：1
- 供职机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 不同类型氨基酸网络参量与蛋白质折叠的关系被引量：6
- 2010年
- 理论和实验研究表明,蛋白质天然拓扑结构对其折叠过程具有重要的影响.采用复杂网络的方法分析蛋白质天然结构的拓扑特征,并探索蛋白质结构特征与折叠速率之间的内在联系.分别构建了蛋白质氨基酸网络、疏水网、亲水网、亲水-疏水网以及相应的长程网络,研究了这些网络的匹配系数(assortativity coefficient)和聚集系数(clustering coefficient)的统计特性.结果表明,除了亲水-疏水网,上述各网络的匹配系数均为正值,并且氨基酸网和疏水网的匹配系数与折叠速率表现出明显的线性正相关,揭示了疏水残基间相互作用的协同性有助于蛋白质的快速折叠.同时,研究发现疏水网的聚集系数与折叠速率有明显的线性负相关关系,这表明疏水残基间三角结构(triangle construction)的形成不利于蛋白质快速折叠.还进一步构建了相应的长程网络,发现序列上间距较远的残基接触对的形成将使蛋白质折叠进程变慢.
- 严立成苏计国陈慰祖王存新
- 关键词：疏水作用
- 不同类型氨基酸网络参量与蛋白质折叠的关系研究
- 蛋白质是生命系统中重要的生物大分子,它在生物体的繁衍、新陈代谢、生长发育等一切生命活动中发挥着重要的生物学功能。研究蛋白质结构的形成机制具有重要的理论和现实意义。自由能曲面理论为蛋白质折叠机理的研究提供了很好的理论框架,...
- 严立成
- 关键词：蛋白质折叠拓扑性质
- 文献传递
- 不同类型氨基酸网络参量及其与蛋白质折叠的关系研究
- 蛋白质是生命系统中重要的生物大分子，它在生物体的繁衍、新陈代谢、生长发育等一切生命活动中发挥着重要的生物学功能。研究蛋白质结构的形成机制具有重要的理论和现实意义。自由能曲面理论为蛋白质折叠机理的研究提供了很好的理论框架，...
- 严立成
- 文献传递
- Study on relationship between structure and function of protein based on the amino acid network model
- The different amino-acid networks of proteins were constructed according to their different physicochemical pr...
- 王存新陈慰祖焦雄苏计国常珊严立成
- 文献传递
