为研究椒江化工园区邻近海域沉积物中细菌结构,选取四个典型站点,通过分离纯化、鉴定和建立克隆文库的方法,对其进行多样性及系统发育分析。可培养细菌的形态学及API鉴定结果显示洋葱假单胞菌及杀鲑气单胞菌杀鲑亚种是优势种,典型细菌16S r DNA分子鉴定结果表明厚壁菌门及γ-变形菌纲为主要类群。非培养细菌克隆文库的序列分析结果表明:细菌主要包括变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、硝化螺旋菌门、CFB群、放线菌门、厚壁菌门、浮霉菌门等9个类群;其中C3站点克隆子主要属于γ-变形菌纲及δ-变形菌纲;C4站点克隆子以γ-变形菌纲及酸杆菌门为主;C5站点克隆子主要属于δ-变形菌纲及γ-变形菌纲;C6站点克隆子主要属于γ-变形菌纲及放线菌门。综合可培养及非培养结果,可发现椒江口化工园区邻近海域沉积物中γ-变形菌纲为典型优势类群,除相当数量的克隆子相似序列来自石油烃污染的沉积环境外,还有大量克隆子相似序列来自养殖污染环境。
本研究通过构建16S r DNA克隆文库,对东海陆架五个站点的沉积物样品进行群落结构及地理分布研究。结果表明:东海陆架沉积物细菌分属于13个类群,包括变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteria)、硝化螺旋菌门(Nitrospira)、WS3、拟杆菌门(Bacteroidetes)、螺旋体门(Spirochaetes)、OP8、浮霉菌门(Planctomycetacia)、疣微菌门(Verrucomicrobiae)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),其中变形菌门(γ-变形菌纲、δ-变形菌纲)和绿弯菌门为优势菌群,Latescibacteria(WS3)、疣微菌门和芽单胞菌门分别是站点DH6、DH21和DH9的特有类群。五个站点细菌多样性从高到低排序依次为DH9>DH21>DH17>DH6>DH16,其群落结构和丰度与各站点不同沉积环境类型有关。
通过常规分离纯化、鉴定和构建细菌克隆文库的方法,研究椒江口三个站点沉积物中细菌的多样性,并对其进行系统发育分析。可培养细菌的形态学及API鉴定结果显示杀鲑气单胞菌是优势种,典型细菌16S r DNA分子鉴定结果表明γ-变形菌纲和厚壁菌门为主要类群。未培养细菌克隆文库的序列分析结果表明:细菌主要包括变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、硝化螺旋菌门、CFB群、放线菌门、厚壁菌门等8个类群;其中C0站点克隆子主要属于γ-变形菌纲及绿弯菌门;C1站点克隆子以α-变形菌纲及γ-变形菌纲为主;C2站点克隆子主要属于放线菌门及α-变形菌纲。综合可培养及未培养结果,可发现椒江口沉积物中γ-变形菌纲为典型优势类群,且相当数量的克隆子其且相当数量克隆子的相似序列来自重金属或石油烃污染的沉积环境。
