徐阳
- 作品数：7 被引量：74H指数：6
- 供职机构：南京林业大学森林资源与环境学院林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家林业公益性行业科研专项江苏高校优势学科建设工程资助项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 鹅掌楸属SRAP分子标记体系优化及遗传多样性分析被引量：10
- 2014年
- 采用L16(45)正交设计,对鹅掌楸属SRAP-PCR反应的5个因素(Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和模板DNA浓度)在4个水平上进行优化试验,同时对SRAP反应影响较大的Mg2+、Taq酶、模板DNA浓度进行单因素分析。建立鹅掌楸属植物SRAP-PCR最适反应体系(20μL),反应条件为:Mg2+3.0 mmol·L-1,dNTPs0.3 mmol·L-1,引物浓度0.9μmol·L-1,Taq酶2.0μmol·min-1,模板DNA 90 ng,10×PCR buffer 2μL,不足部分以ddH2O补足。利用优化的SRAP体系对鹅掌楸属10个不同地理种源进行遗传多样性分析。筛选出15对条带清晰、多态性高的引物共扩增出182个位点,其中149个为多态性位点,多态性比例为81.87%。应用POPGEN 32软件通过UPGMA法进行聚类分析,从聚类图可以看出10个地理种源间的遗传距离及亲缘关系,表明SRAP分子标记可以运用于鹅掌楸属的遗传多样性研究。
- 赵亚琦成铁龙施季森王新民徐阳刘伟东陈金慧
- 关键词：鹅掌楸属SRAP
- 鹅掌楸Genomic-SSR反应体系优化被引量：6
- 2013年
- 鹅掌楸属（Liriodendron L）,是木兰科（Magnoliaceae）植物,属古老属种之一。由于第三纪晚期气候剧变和更新世冰川作用,到目前为止仅剩中国马褂木（L.chinense（Hemsl.）Sarg.）和北美鹅掌楸（L.tulipifera L.）两个残遗种[1]。鹅掌楸属植物在植物系统学中有特殊地位,以及具有原始的花结构等,这使得它们成为研究植物进化、开花植物历史进程、群体结构以及交配系统等的理想材料[2-4]。此外,鹅掌楸植物具有重要的经济价值和生态价值[5]。除为生产提供优质木材外,还具较强抗性[6-7],内含丰富的医用化合物[8-9]以及生物质燃料的生[10-12]
- 贾波徐海滨徐阳龙晓飞陈金慧施季森
- 关键词：GENOMIC-SSR鹅掌楸正交试验
- 杉木SSR-PCR体系优化被引量：6
- 2014年
- SSR—PCR反应体系优化是杉木SSR标记研究的基础。利用正交L16（4^5）设计实验对杉木SSR-PCR反应体系的Mg2＋、dNTPs、引物、Taq酶和DNA浓度5个因素的4个水平进行优化试验。并在正交直观分析和方差分析的基础上，分别对Mg2＋、dNTPs进行单因素确定。获得的最佳反应体系为：在20灿反应体系中，Mg2＋浓度为1．0mmol／L，引物浓度为0．25μmol／L，dNTPs浓度为0．15mmol／L，Taq酶为0．05U／μL，DNA为30ng，10×PCRBuffer2μL，不足部分用双蒸水补齐至20μL。在最佳反应体系的基础上，采用单因素实验确定了引物的最佳退火范围为63～53℃。利用此反应体系对10个F1代杉木材料及其亲本，进行4对SSR标记进行PCR扩增并电泳检测，其结果清晰、稳定。说明此体系适合进一步的杉木SSR研究工作。
- 徐阳陈金慧王颖赵亚琦王新民郑仁华施季森
- 关键词：杉木分子标记正交试验
