李庆阁
- 作品数:186 被引量:397H指数:11
- 供职机构:厦门大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广东省卫生厅资助课题福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学农业科学理学更多>>
- 探针熔解分析法检测结核分枝杆菌异烟肼耐药突变的应用和评价被引量:9
- 2011年
- 目的 评价PMA技术检测MTB对INH耐药突变的价值,调查INH耐药突变发生特征.方法 MTB标准株H37Rv来自国家结核病参比实验室,1株INH敏感株和1株katG S315TACC突变株来自厦门市疾病预防控制中心,7株含有已知INH耐药突变的结核耐药株来自深圳慢性病防治中心、河南省疾病预防控制中心、中国人民解放军第309医院和厦门市疾病预防控制中心.707份MTB临床分离株来自厦门市疾病预防控制中心、厦门市第一医院和漳州市疾病预防控制中心,126份MTB涂阳痰标本来自厦门市同安区疾病预防控制中心.MTB标准株H37Rv、7株MTB INH耐药株和833份临床标本均采用厦门致善结核分枝杆菌异烟肼耐药突变检测试剂盒热裂解法提取基因组DNA,1株INH敏感株和1株katG S315T ACC突变株采用AxyPrepTM细菌基因组DNA提取试剂盒提取基因组DNA.熔解曲线分析所检标本与野生型对照在katG315位密码子、inhA启动子区(- 17~-8位点)、ahpC启动子区(-44~-30以及-15 ~3位点)及inhA94位密码子的熔解温度(Tm值)差异判断标本是否发生INH耐药突变.3×105拷贝/反应的野生株和katG S315T ACC突变株以10倍梯度稀释至300拷贝/反应,分析PMA技术的灵敏度.用PMA技术检测7株含有已知INH耐药突变的结核耐药株,评价特异性,并就其中5种耐药突变进行重复性检验.测序验证PMA技术对833份标本INH耐药性的临床检测效能.结果 PMA技术从核酸提取到结果判断可在3小时内完成,在标准96孔实时PCR仪器上可同时检测46份标本.对野生株和katG S315T ACC突变株的灵敏度均为300拷贝/反应,能够同时区分9种INH耐药相关点突变或缺失,5种耐药突变的Tm值标准偏差均在0.5℃之内.检出的162份突变标本与测序验证结果均一致.临床标本验证突变率为19.4%( 162/833),在所检出的14种INH耐药突变katGS315T( AGC →ACC)、inhA启动子区- 15C→T和katG S315N (AGC→AAC)这3种突变�
- 胡思玉牛建军权胜卯黄建炜李庆阁
- 关键词:异烟肼突变聚合酶链反应
- 一种结核分枝杆菌链霉素耐药突变的检测方法及试剂盒
- 一种结核分枝杆菌链霉素耐药突变的检测方法及试剂盒。涉及耐药突变的检测技术,提供一种有效提高灵敏度及特异性、操作简便、周期短结核分枝杆菌链霉素耐药突变的检测方法。根据结核分枝杆菌全序列和结核分枝杆菌基因组rpsL和rrs基...
- 李庆阁张婷胡思玉
- 文献传递
- PCR熔解曲线法筛查结核分枝杆菌链霉素和乙胺丁醇耐药性被引量:4
- 2012年
- 目的利用PCR熔解曲线法快速筛查结核分枝杆菌(MTB)对链霉素、乙胺丁醇耐药性,并与药敏试验结果比较,评价其应用价值。方法收集深圳市2007-2009年331株MTB临床分离株,应用PCR熔解曲线法检测embB基因306、378-380、406和497、rpsL基因43、88及r阳基因513-517、905-908位点耐药突变,并与药敏试验结果比较。结果以药敏试验结果为标准,PCR熔解曲线法检测MTB链霉素耐药突变的敏感性为78.6%、特异性为90.1%、准确性为86.7%;检测MTB乙胺丁醇耐药突变的敏感性为83.0%、特异性为93.3%、准确性为91.8%。PCR熔解曲线法与药敏试验检测结果具有很好的一致性。结论PCR熔解曲线法能够快速、特异地检测MTB对链霉素、乙胺丁醇耐药突变,可用于临床筛查。
- 王峰胡思玉桂静崔运勇刘小立李庆阁
- 关键词:结核分枝杆菌耐药性链霉素乙胺丁醇
- 一种检测核苷酸大片段缺失的方法和试剂盒
- 本申请提供了一种检测核苷酸片段缺失(特别是大片段缺失)的方法,所述方法通过同时不对称扩增样品中存在的多种靶核酸,能够同时检测一种或多种(例如1、2、5、10、15、19、20、25、30、35、40或更多种)核苷酸片段缺...
- 黄秋英李庆阁刘雪铖
- 用于核酸检测装置的温度控制方法及装置
- 本发明提供了一种用于核酸检测装置的温度控制方法及检测装置,所述温度控制方法包括如下步骤:S1,获取预先设置的多段温度设定值;S2,获取核酸检测装置采集的多点实时温度,计算得到温度平均值;S3,计算所述多段温度设定值与所述...
- 谢瑜谢路生王任鹏陈晓玉凌伟松周伟李庆阁
- 文献传递
- 伤寒、副伤寒沙门菌多重荧光PCR检测试剂盒
- 本发明公开了一种伤寒、副伤寒沙门菌多重荧光PCR检测试剂盒,所述检测方法和试剂盒包括:分别特异性扩增伤寒沙门菌和丙型、甲型、乙型副伤寒沙门菌ViaB基因序列、fliC-a基因序列、fliC-b基因序列和ssaR基因序列的...
- 扈庆华石晓路朱玉梅李庆阁汪再兴李迎慧邱亚群林一曼刘涛
- 文献传递
- 实时聚合酶链反应熔解曲线法快速检测耐多药结核分枝杆菌被引量:9
- 2011年
- 目的应用实时PCR熔解曲线法快速检测MTB对利福平和异烟肼的耐药性,并与比例法检测结果进行比较。方法收集深圳市2007--2009年耐药监测项目、全国耐药基线调查项目和深圳市慢性病防治中心门诊患者临床分离株311株,采用实时PCR熔解曲线法检On,0rpoB基因耐药突变热点区、ahpC启动子区(硝~30及-15~-3位点)、inhA启动子区(-7~-8位点)、inhA94和katG315位耐药突变,并与耐药基因测序及表型药敏试验结果进行比较。以比例法药敏试验结果作为MTB药敏试验的金标准,评价实时PCR熔解曲线法的敏感度、特异度与金标准的符合率。结果实时PCR熔解曲线法2~3h即可完成检测,扩增和结果判定在1个反应管内完成。检测利福平耐药的敏感度为97.8%,特异度为97.1%,准确性为97.4%;检测异烟肼耐药的敏感度为86.6%,特异度为98.7%,准确性为92.6%。对耐多药MTB的检测敏感度为88.6%,特异度为100.O%,重复性为100.0%。结论实时PCR熔解曲线法检测MTB对利福平和异烟肼耐药性,与比例法检测结果比较具有很好的一致性,且具有快速、准确的优点,有较好的临床应用价值。
- 王峰崔运勇胡思玉桂静杨慧李庆阁刘小立
- 关键词:利福平异烟肼聚合酶链反应
- 一种检测核酸序列变异的方法
- 本发明提供了用于熔解曲线分析的核酸探针特别是自淬灭探针,利用所述核酸探针进行熔解曲线分析来检测核酸序列变异的方法,以及包含所述核酸探针的试剂盒。
- 李庆阁黄秋英
- 一种检测败血症病原体的方法
- 本申请提供了一种检测败血症病原体的方法,所述方法能够同时检测多种败血症病原体在样品中的存在或水平。此外,本申请还提供了一种探针组和包含一种或多种所述探针组的试剂盒,所述探针组和试剂盒可用于实施本发明的方法。此外,本申请还...
- 牛建军李庆阁廖逸群许晔林素
- 一种结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药突变的检测方法及试剂盒
- 一种结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药突变的检测方法及试剂盒。涉及结核分枝杆菌耐药突变的检测技术,提供一种设计简单,可简化操作、提高分析灵敏度、成本低廉的结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药突变的检测方法及试剂盒。提取结核分枝杆菌样本的DNA...
- 李庆阁胡思玉陈晓云付军那巴古·耶罕姆