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胡静

作品数:3 被引量:32H指数:3
供职机构:安徽师范大学生命科学学院更多>>
发文基金:安徽省优秀青年科技基金国家自然科学基金北京市自然科学基金更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学

主题

  • 2篇线粒体基因
  • 2篇线粒体基因组
  • 2篇鳞翅目
  • 2篇基因
  • 2篇基因组
  • 1篇全序列
  • 1篇线粒体基因组...
  • 1篇粉蝶
  • 1篇粉蝶科
  • 1篇RNA二级结...
  • 1篇菜粉蝶
  • 1篇串联重复序列
  • 1篇NYMPHA...
  • 1篇LEPIDO...

机构

  • 3篇安徽师范大学
  • 2篇中国科学院
  • 1篇中国科学院南...

作者

  • 3篇郝家胜
  • 3篇胡静
  • 2篇朱朝东
  • 2篇朱国萍
  • 1篇孙倩倩
  • 1篇杨群
  • 1篇张大秀
  • 1篇孙晓燕
  • 1篇王晓灿
  • 1篇毛增辉
  • 1篇司曼曼
  • 1篇夏靖

传媒

  • 2篇昆虫学报
  • 1篇Zoolog...

年份

  • 2篇2011
  • 1篇2010
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
菜粉蝶线粒体基因组的全序列测定和分析被引量:21
2010年
目前关于蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究还不多见。本研究通过长PCR和引物步移法对菜粉蝶Pieris rapae Linnaeus线粒体基因组全序列进行了测定和初步分析。结果表明:菜粉蝶线粒体基因组全长15157bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA和2个rRNA基因以及1个非编码的控制区域,它们的长度分别是11196bp,1474bp,2093bp和393bp。37个基因的位置与已报道的其他蝶类基本一致,共有10对基因间存在总共59bp的重叠,重叠碱基数在1~35bp之间;基因间隔序列共计13处120bp,间隔长度1~46bp不等,最大的基因间隔46bp,位于tRNAIle和tRNAGln基因之间。另外,基于13个蛋白质编码基因的氨基酸序列,重建了基于蛋白质编码基因序列数据的11种代表性蝶类的NJ和MP系统树。结果表明:凤蝶类(包括凤蝶和绢蝶)为一大支系,粉蝶类、灰蝶类与蛱蝶类(包括蛱蝶、珍蝶)构成另一大支系。结果不支持粉蝶科与凤蝶科(包括凤蝶类和绢蝶类)构成单系群,却显示粉蝶科、灰蝶科和蛱蝶科的组合为单系群。
毛增辉郝家胜朱国萍胡静司曼曼朱朝东
关键词:鳞翅目粉蝶科菜粉蝶线粒体基因组RNA二级结构
大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析被引量:16
2011年
目前有关蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究报道还不多见。本文利用long PCR和引物步移法得到大卫绢蛱蝶Calinaga davidis的线粒体基因组全序列,同时就其基因组成和结构特点作了初步分析。结果显示:其基因组全长为15 267 bp(GenBank登录号为HQ658143),包括13个蛋白质编码基因(ATP6,ATP8,COI-III,ND1-6,ND4L,Cytb)、22个tRNA基因、2个rRNA基因(16S和12S)以及非编码的控制区。与其他鳞翅目昆虫相一致,其基因组未出现基因重排现象。基因组共包含11个基因间隔区,总长度为130 bp,间隔长度1~46 bp,最大间隔在tRNAGln与ND2基因之间;基因间共存在13处重叠,总长度为66 bp,重叠碱基数1~35 bp,最长的重叠区位于COII与tRNALys基因。lrRNA和srRNA基因长度分别为1 337 bp和773 bp;除tRNASer(AGN)缺少二氢尿嘧啶臂(DHUstem),在相应的位置上只形成一个简单环外,其余的tRNA基因都能形成典型的三叶草结构。13个蛋白编码基因总长度为11 247 bp,共有3 737个密码子,它们的碱基组成和密码子的使用具有明显的偏倚性;除COI外(起始密码子TTG),其余的12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子;COI基因终止密码子为不完全T,ND4基因终止密码子为不完全TA,其余基因都以TAA为终止密码子。A+T丰富区全长为389 bp,A+T含量高达92.0%,其中存在2段类似微卫星的重复序列(TA)6和(AAT)4。本文的研究结果为探讨绢蛱蝶亚科在蛱蝶科中的系统学地位及其与其他亚科间的系统发生关系等问题提供了重要的分子生物学数据。
夏靖胡静朱国萍朱朝东郝家胜
关键词:鳞翅目线粒体基因组串联重复序列
Complete mitochondrial genome of the laced fritillary Argyreus hyperbius(Lepidoptera:Nymphalidae)被引量:12
2011年
We investigated the complete mitochondrial genome(mitogenome) of Argyreus hyperbius.The 151 56 bp long genome harbored the gene content(13 protein coding genes,22 tRNA genes,2 rRNA genes and an A+T-rich region) and the gene arrangement was identical to all known lepidopteran mitogenomes.Mitogenome sequence nucleotide organization and codon usage analyses showed that the genome had a strong A+T bias,accounting for A+T content of 80.8%,with a small negative AT skew(?0.019).Eleven intergenic spacers totaling 96 bp,and 14 overlapping regions totaling 34 bp were scattered throughout the whole genome.As has been observed in other lepidopteran species,12 of the 13 protein-coding genes(PCGs) were initiated by ATN codons,while the COI gene was tentatively designated by the CGA codon.A total of 11 PCGs harbored the complete termination codon TAA,while the COI and COII genes ended at a single T residue.All of the 22 tRNA genes showed typical clover structures except that the tRNASer(AGN) lacks the dihydrouridine(DHU) stem which is replaced by a simple loop.The intergenic spacer sequence between the tRNASer(AGN) and ND1 also contained the ATACTAA motif,which is conserved in all other lepidopterans as well.Additionally,the 349 bp A+T-rich region was not comprised of large tandem repetitive sequences,but harbored a few structures common to other lepidopteran insects,such as the motif ATAGA followed by a 20 bp poly-T stretch,a microsatellite-like(AT)9 element preceded by the ATTTA motif,and a 5 bp poly-A site present immediately upstream of tRNAMet.The mitochondrial genomic sequence features found in this study not only contribute to genetic diversity information of the group,but also are useful in future studies of the endangered nymphalid butterfly in population genetic dynamics,species conservation,phylogeography and evolution.
王晓灿孙晓燕孙倩倩张大秀胡静杨群郝家胜
关键词:NYMPHALIDAELEPIDOPTERA
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