顾文超
- 作品数：16 被引量：77H指数：6
- 供职机构：上海市普陀区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：上海市公共卫生体系建设三年行动计划更多>>
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- 2015-2018年上海市普陀区手足口病病原谱及柯萨奇病毒基因特征分析被引量：7
- 2020年
- 目的研究2015—2018年上海市普陀区手足口病病原谱,并对鉴定为柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)的VP1基因特征进行分析,以掌握本地区CVA6的分子流行病学特征。方法采用实时荧光定量PCR法对收集的标本进行肠道病毒通用基因和分型基因检测,对鉴定为CVA6型病毒进行VP1基因测序并分析。结果2015—2018年共检测943份手足口标本,肠道病毒通用基因阳性522份(55.36%),其中CVA6阳性332份(63.60%),柯萨奇病毒A16型(coxsackievirus A16,CVA16)阳性110份(21.07%),肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)阳性56份(10.73%),柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CVA10)阳性11份(2.11%),其他肠道病毒13份(2.49%)。20株CVA6型病毒的VP1基因之间核苷酸同源性为92.9%~100.0%,氨基酸同源性为98.4%~100.0%,都属于D3亚型。结论2015—2018年上海市普陀地区引起手足口病的病原体主要有CVA6、CVA16、EV71和CVA10,CVA6已成为上海市普陀地区手足口病的主要病原体,其中优势基因型为D3亚型。
- 李晓君唐海丰何鑫胡焰顾文超
- 关键词：手足口病病原谱VP1基因
- 上海市普陀区急性呼吸道感染病原监测及腺病毒基因特征分析被引量：3
- 2021年
- 目的了解2015—2019年上海市普陀区急性呼吸道感染主要呼吸道病毒病原特征,并研究腺病毒的基因特征,为呼吸道病毒的防控特别是腺病毒的防控提供实验室依据。方法收集2015—2019年普陀区监测医院内急性呼吸道感染病例的咽拭子标本,使用多重PCR方法进行呼吸道病原体的检测,并对腺病毒阳性标本扩增Hexon基因测序分析。结果共检测775例标本,检出阳性525例,阳性率为64.74%。甲型流感病毒检出率最高,占66.48%(349/525);其次为乙型流感病毒,占12%(63/525);腺病毒占5.14%(27/525);鼻病毒占3.81%(20/525);肠道病毒占3.24%(17/525);冠状病毒占3.05%(16/525);副流感病毒占2.67%(14/525);人偏肺病毒占2.48%(13/525);人博卡病毒占0.38%(2/525),呼吸道合胞病毒未检出。27例腺病毒Hexon基因测序分析显示腺病毒3型17例,7型7例,4型2例,5型1例。结论上海市普陀地区急性呼吸道感染以流感病毒为主,腺病毒次之,腺病毒感染以3型和7型为主。
- 李晓君唐海丰胡焰顾文超
- 关键词：急性呼吸道感染腺病毒基因型别
- 2016年上海市普陀区手足口病病原谱及EV71和Cox A16病毒分离株VP1基因特征分析
- [目的]了解上海市普陀区手足口病病原学特点,分析肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)VP1基因的特征,为手足口病的防治提供科学依据.[方法]收集2016年上海市普陀区手足口病患者的咽拭子标本,...
- 李晓君唐海丰何鑫胡焰顾文超
- 关键词：手足口病EV71COXA16
- 上海市普陀区儿童感染性腹泻病例病原谱及分子特征
- 2024年
- 【目的】了解2018—2023年上海市普陀区儿童感染性腹泻病的病原谱和分子特征,为儿童感染性腹泻防控提供科学依据。【方法】收集2018年1月—2023年12月上海市普陀区儿童腹泻病监测哨点医院就诊病例的粪便标本,通过分离培养11种细菌和实时荧光聚合酶链反应(PCR)检测5种病毒。使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)标准分型法分析部分阳性菌株的分子分型;采用逆转录PCR方法扩增部分诺如病毒阳性标本的聚合酶-衣壳蛋白连接区,基因测序后使用生物信息软件进行分析。采用χ^(2)检验或Fisher精确概率法比较2018—2019年和2020—2023年病原体阳性率。【结果】707例病例中,总阳性率为47.67%,单一细菌阳性率为16.27%,单一病毒阳性率为22.63%,混合阳性率为8.77%。优势病原体为轮状病毒(10.75%)、诺如病毒(10.33%)、肠致病性大肠杆菌(8.06%)、沙门菌(6.36%)、肠集聚性黏附大肠杆菌(5.52%)、弯曲菌(5.23%)。夏秋季以细菌感染为主,冬春季以病毒感染为主。2020—2023年的总阳性率较2018—2019年下降(χ^(2)=5.753,P<0.05)。对37株沙门菌、81株肠致泻性大肠杆菌、19株弯曲菌完成PFGE分子分型分析,分别分为28种、80种和18种带型,带型相似度范围较广。19份诺如病毒经GⅡ组基因序列分析分为5种基因型,主要为GⅡ.Pe-GⅡ.4型和GⅡ.P16-GⅡ.2型。【结论】轮状病毒、诺如病毒、肠致泻性大肠埃希菌、沙门菌、弯曲菌为上海市普陀区儿童感染性腹泻的优势病原体,病原谱呈现季节性流行特征,部分病原体的分子特征存在多样性。应在不同季节加强儿童感染性腹泻病原体的分子特征监测,为防控提供实验室依据。
- 顾文超张焕生唐海丰闫浩吴婷婷桂依琳李强李勇
- 关键词：儿童感染性腹泻病原谱脉冲场凝胶电泳基因型
- 2012年上海市普陀区食源性致病菌监测结果分析被引量：3
- 2014年
- 目的了解2012年上海市普陀区生鲜食品中食源性致病菌的污染情况,提高对食源性疾病的有效控制及其早期预警能力。方法按照《食品微生物学检验》(GB4789-2010)和GFN项目的相关检验要求对5种食源性致病菌进行检测。结果 2012年采集的5类共210份生鲜食品中生禽肉、生猪肉、生牛肉为主要受污染食品,检出率分别为71.43%、64.29%和61.90%;水产品和新鲜鸡蛋中检出率分别为46.43%和21.43%。5种食源性致病菌的总检出率为61.43%,其中沙门菌检出率为29.52%,副溶血性弧菌检出率为3.81%,金黄色葡萄球菌检出率为10.95%,单核细胞增生李斯特菌检出率为33.81%,小肠结肠炎耶尔森菌检出率为9.52%。结论上海市普陀区超市生鲜食品中存在较为严重的食源性致病菌污染,主要来源于生禽、猪、牛肉,提示应加强对生鲜食品卫生的监管力度,防止食源性疾病的暴发。
- 顾文超李勇唐海丰熊鹿言李芳
- 关键词：食品安全生鲜食品食源性致病菌检出率
- 2018-2019年上海市普陀区16起聚集性呕吐腹泻疫情中诺如病毒的流行与分析
- 2024年
- 目的了解上海市普陀区16起聚集性呕吐腹泻疫情中诺如病毒的基因分型和流行特征,为辖区和全市诺如病毒引起的聚集性呕吐腹泻疫情的处置与防控提供技术支撑和数据参考。方法收集2018-2019年上海市普陀区16起聚集性呕吐腹泻疫情所涉及人群的肛拭标本136份。采用实时荧光聚合酶链反应方法检测诺如病毒核酸,典型病例阳性标本采用实时荧光聚合酶链反应扩增聚合酶-衣壳蛋白连接区并进行测序,通过生物信息工具进行基因分型和构建进化树。结果136份标本中诺如病毒GⅡ组核酸阳性62份(45.59%),GⅠ组核酸阳性0份。42份诺如病毒测序成功,通过序列比对分析获得4种基因型别。16起聚集性呕吐腹泻疫情中9起疫情是GⅡ.P16-GⅡ.2型(56.25%),2起疫情是GⅡ.P7-GⅡ.6型(12.50%),2起疫情是GⅡ.P12-GⅡ.3型(12.50%),3起疫情是GⅡ.Pe-GⅡ.4型(18.75%)。结论诺如病毒是引起2018-2019年上海市普陀区聚集性呕吐腹泻疫情的重要病原体,以GⅡ组为主,有多种基因型别,其中GⅡ.P16-GⅡ.2型为主要流行株。
- 闫浩顾文超吴婷婷李勇张玉唐海丰
- 关键词：诺如病毒基因分型
- 2016年上海市普陀区手足口病病原谱及EV71和Cox A16病毒分离株VP1基因特征分析被引量：6
- 2018年
- 目的了解上海市普陀区手足口病病原学特点,分析肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16) VP1基因的特征,为手足口病的防治提供科学依据。方法收集2016年上海市普陀区手足口病患者的咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR法(Real-time PCR)进行核酸检测,并用RD细胞对核酸检测结果为EV71和Cox A16的标本进行病毒分离,收获的阳性分离株利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法扩增病毒VP1区核苷酸序列,测序后分析其同源性并构建系统进化树。结果 2016年上海市普陀区共检测234份手足口病标本,阳性标本138份,阳性率为58.97%(138/234)。其中EV71阳性率为11.54%(27/234)、Cox A16阳性率为18.80%(44/234)、Cox A6阳性率为27.78%(65/234)和其他肠道病毒阳性率0.85%(2/234)。病毒分离培养阳性株包括10株EV71和20株Cox A16,10株EV71分离株均为C4a型,VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.6%～99.9%和98.7%～100.0%;20株Cox A16分离株均为B1b亚型,VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.4%～100.0%和98.2%～100.0%。结论 2016年上海市普陀区手足口病呈现Cox A6、EV71和Cox A16共同流行,而EV71流行株属于C4a亚型,Cox A16流行株属于B1b亚型,均与国内大部分地方的流行株基因亚型基本一致。
- 李晓君唐海丰何鑫胡焰顾文超
- 关键词：手足口病病原谱柯萨奇病毒A组16型VP1基因
- 上海市普陀区监测点医院697例急性上呼吸道感染病例监测结果研究被引量：2
- 2020年
- 目的了解上海市普陀区急性呼吸道感染病原谱构成和流行病学特征,为制定和完善呼吸道传染病防控策略提供科学依据。方法依托上海市急性呼吸道感染监测网络,对普陀区哨点监测医院发热门诊的急性呼吸道感染病例,按5∶1抽样间隔进行调查,并采集鼻咽拭子进行病原学检测。结果共登记3431例病例,采集697例病例样本,其中阳性病例519例,阳性率为74.46%。病毒阳性率为45.05%,主要为甲型流感病毒(阳性率为30.42%)、乙型流感病毒(阳性率为6.89%)、鼻病毒/肠道病毒(阳性率为3.30%);细菌阳性率为10.62%,主要为肺炎克雷伯菌(阳性率为5.74%)、金黄色葡萄球菌(阳性率为3.59%);混合感染阳性率为18.79%。每年的冬春季和夏秋季出现阳性检出率的双流行峰。不同年龄阳性检出率比较差异无统计学意义(P>0.05),男女性别阳性检出率比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论上海市普陀区急性呼吸道感染病原谱较为广泛,流感病毒和肺炎克雷伯菌是感染的主因,应进一步加强病原监测和系统研究。
- 唐海丰李晓君胡焰何鑫顾文超张宇艳
- 关键词：呼吸道感染病原谱
- 2015-2018年上海市儿童腹泻流行特征及致泻性大肠埃希菌耐药分析被引量：14
- 2019年
- 目的了解上海市儿童腹泻流行特征、病原谱及致泻性大肠埃希菌(DEC)的耐药情况。方法收集2015年4月至2018年3月在监测点医院就诊的初诊儿童腹泻病例临床及流行病学资料,同时采集粪便标本进行细菌培养及病毒核酸检测,对分离的DEC进行耐药分析。结果共收集儿童腹泻病例880例,以<5岁幼儿为主(92.95%)。儿童腹泻病例病原检出率为47.50%,且男女性之间差异无统计学意义(χ^2=1.778,P=0.182);0~1岁组病原检出率显著低于其他各年龄组(χ^2=90.929,P<0.001);非母乳喂养儿、混合喂养儿的病原检出率均高于纯母乳喂养儿(χ^2=31.384、14.746,均P<0.001);托幼儿童病原检出率高于散居儿童(χ^2=11.158,P=0.001)。单一病原体的检出,细菌以沙门菌(5.11%)、肠致病性大肠埃希菌(4.55%)、空肠弯曲菌(4.43%)、肠集聚性黏附大肠埃希菌(3.07%)为主;病毒以诺如病毒GⅡ型(7.95%)和轮状病毒A组(4.66%)为主。单纯细菌在≥5岁组检出率最高(35.48%);单纯病毒在3~4岁组检出率最高(28.30%);细菌混合病毒在≥5岁组检出率最高(9.68%)。夏季以细菌为优势病原菌;秋季呈现细菌向病毒过渡状态,细菌混合病毒感染检出率处于全年高峰;冬季以病毒为优势病原。DEC对二、三代头孢菌素头孢噻肟、头孢呋辛、头孢西丁的耐药率分别为15.44%、20.59%、5.88%;对喹诺酮类药物左氧氟沙星、环丙沙星的耐药率均为5.15%。结论托幼儿童病原检出率较高,需引起重视。细菌性腹泻及病毒性腹泻呈现一定的年龄特征及季节性变化。头孢菌素类药物耐药率低于全国水平,但仍需注意合理使用抗生素。
- 桑灏崔燕顾文超孔令娜王瑞蒋潇丽王庆荟
- 关键词：腹泻病哨点监测耐药儿童
- 上海市普陀区2012年-2016年4种致泻性大肠埃希菌的监测分析被引量：15
- 2017年
- 目的分析上海市普陀区2012年-2016年腹泻人群中4种致泻性大肠埃希菌(EPEC、ETEC、EIEC、EHEC)感染及分布情况,为致泻性大肠埃希菌病的监测、暴发预警提供基线与参考数据。方法设立哨点医院,以标准化方法筛选和鉴定DEC的毒力因子、菌型和耐药特征;构建DEC流行特征基线。结果 2012年-2016年,2家哨点医院检测2 988份腹泻标本确认DEC病例共334例,阳性率为11.2%,其中EPEC 169例(5.7%)、ETEC 148例(5.0%)、EIEC 3例(0.1%)、STEC/EHEC 3例(0.1%)、MDEC 11例(0.4%)。成人腹泻监测点优势病例为ETEC感染,流行呈明显的季节特征,峰值多在每年8月;儿童腹泻监测点优势病例为EPEC感染,感染峰值每年均在6月,男、女性别比为37∶20,男性明显高于女性。DEC药敏试验中耐药率最高的药物为萘啶酸(NA)(39.6%),其次为四环素(TE)(38.0%)和复方新诺明(SXT)(25.5%)。结论上海市普陀区DEC型谱特征已发生变化。ETEC夏季食源性感染风险大,需要加强公共卫生实验室主动监测能力。
- 李勇顾文超唐海丰黄文静赖淼菊张玉
- 关键词：致泻性大肠埃希菌肠致病性大肠埃希菌肠产毒性大肠埃希菌
