周启明
- 作品数：22 被引量：15H指数：2
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学轻工技术与工程更多>>
- 地衣型真菌的Ⅰ型内含子及其在系统发育中的应用
- 以地衣样品为材料,结合GenBank中相关数据,对地衣型真菌ITS rDNA,核糖体小亚基rDNA及核糖体小亚基DNA上的内含子的序列变异程度进行了比较分析。同时,对地衣型真菌核糖体小亚基DNA上的Ⅰ型内含子分布模式进行...
- 曹叔楠刘萌周启明郭守玉
- 关键词：SSURDNAITS
- 一株耐旱地衣共生菌及其应用
- 本发明公开了一株耐旱地衣共生菌及其应用。该地衣共生菌为Endocarpon pusillum F07020，在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心的保藏登记号为CGMCC No.3893。Endocarpon pu...
- 魏江春张涛周启明曹叔楠
- 文献传递
- 石果衣真菌(Endocarpon pusillum)比较转录组分析揭示其抗旱特性被引量：1
- 2015年
- 从沙漠地区地衣石果衣中分离得到的地衣型真菌(Endocarpon pusillum)具有极强的抗旱能力.为了研究石果衣真菌的抗旱机制,本研究利用转录组测序和荧光定量的方法分别对纯培养和共生状态的真菌进行分析和比较.比较转录组分析是针对纯培养的石果衣真菌,比较其在正常培养和胁迫培养条件下的2个样品,得到1781个差异表达基因.以抗旱植物和非地衣型真菌的抗旱机制作为参照,一些普遍存在机制中所涉及的基因在石果衣真菌中也是差异表达的.然而不同的是,石果衣真菌的抗旱机制中不涉及有关渗透压调节基因的差异表达,这一特点为揭示石果衣真菌为干旱适应物种提供了证据.此外,石果衣真菌不同于其他生物,还有一系列差异基因被归类于其特有的干旱适应机制.为了确定共生与纯培养状态下的石果衣真菌的抗旱机制是否一致,本研究挑选了23个候选基因,利用荧光定量的方法在脱水地衣体中进行验证.本研究为下一步地衣型真菌的研究提供有价值的数据支持,同时也会有助于抗旱基因的功能研究.
- 王延延张新宇周启明张晓灵魏江春
- 关键词：地衣共生菌脱水
- 红脐鳞地衣基因组文库的构建(英文)被引量：3
- 2004年
- 地衣是真菌和一种或多种光合微生物形成的稳定的共生联合体 ,既是先锋生物 ,又是敏感生物。环境的变化及生境的片断化 ,使得许多地衣种类处于濒危状态。保护珍稀濒危地衣物种的方法包括地衣体的移植 ,地衣中菌藻的分离培养及基因组文库的构建等。本研究用改进的CTAB方法提取基因组总DNA ,以Lamb daGEM 11为载体 ,构建了红脐鳞 (Rhizoplacachrysoleuca)的基因组文库 ,文库中同时含有该地衣共生菌与共生藻的DNA。该文库包含 8.5× 10 5个重组子 ,插入片段的平均大小为 19kb。文库的容量约为红脐鳞单倍体基因组的 10 0倍。该基因组文库的构建为保护稀有与濒危地衣物种提供了一个新的途径 ,并可进一步开展有关地衣的分子操作研究 ,如地衣冰核蛋白的异源表达等。
- 周启明郭守玉
- 关键词：基因组文库LAMBDA
- 脐叶型地衣及相关类群的分子系统生物学分析
- 本文通过分子系统学方法对脐叶型地衣中部分分类单元以及相关类群的系统地位进行研究。在对新种Rhizoplacopsis weichingii进行系统发育研究中，分子数据与形态分析的结果均表明将该种置于新属Rhizoplac...
- 周启明
- 关键词：地衣型真菌物种形成
- 地衣型真菌的Ⅰ型内含子及其在系统发育中的应用被引量：1
- 2011年
- 以蜈蚣衣属、黑蜈蚣衣属地衣样品为材料,结合GenBank中相关数据,对地衣型真菌核糖体小亚基DNA上的Ⅰ型内含子分布模式进行归纳,并探讨了其在地衣型真菌系统发育研究中的应用。结果表明在地衣型真菌核糖体小亚基DNA上存在多个Ⅰ型内含子插入位点,通过二级结构分析给出了天然状态下Ⅰ型内含子发生转座的证据。分析显示,Ⅰ型内含子作为分子标记,只适合用于种下单位的系统发育研究中。
- 曹叔楠刘萌周启明郭守玉
- 关键词：ITS序列
- 石耳属ITS条形码物种的快速鉴定被引量：4
- 2011年
- 生物DNA条码是利用一个短的DNA标记进行生物的快速鉴定。以真菌界的石耳目、石耳科中的石耳属地衣的部分种类为材料,应用地衣共生菌的rDNA-ITS序列,对29种石耳属地衣进行鉴定,并初步探究其中部分种类特异的微型条码,为石耳属地衣的快速鉴定提供依据。
- 郑方圆曹叔楠张涛刘川鹏周启明魏江春
- 关键词：地衣地衣型真菌ITS
- 一株耐旱地衣共生藻及其应用
- 本发明公开了一株耐旱地衣共生藻及其应用。该耐旱地衣共生藻为石果衣共生藻Diplosphaera chodatii A07020，在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心的保藏登记号为CGMCC No.3892。本发明...
- 魏江春张涛周启明曹叔楠
- 文献传递
- 一种人工生物结皮治理荒漠的方法及专用地衣
- 本发明公开了一种人工生物结皮治理荒漠的方法及专用地衣。本发明提供了一种用于制备地衣的成套产品，由独立包装的菌和藻组成，所述菌为Endocarpon pusillum F07020 CGMCC No.3893，所述藻为Di...
- 魏江春杨军张涛周启明曹叔楠
- 蜈蚣衣科SSU rDNA中I型内含子的初步研究被引量：2
- 2004年
- 本文结合来自GenBank中的地衣型真菌SSU rDNA中I型内含子的相关信息,对取自蜈蚣衣属(Physcia)两个种——斑面蜈蚣衣(Physcia aipolia)、蜈蚣衣(Physcia stellaris),和黑蜈蚣衣属(Phaeophyscia)一个种——毛边黑蜈蚣衣(Phaeophyscia hispidula)共10个样品的SSU rDNA中I型内含子的分布模式进行了研究。结果表明,在这些地衣型真菌的SSU rDNA中具有多个I型内含子;而内含子插入位点的分布并不具有种的特异性和地理特异性。这种分布模式暗示这些I型内含子仍然处于“插入-删除”的平衡状态,而且在此过程中,有性生殖可能比基因的水平转移发挥了更重要的作用。
- 周启明黄满荣魏江春
- 关键词：蜈蚣衣科地衣型真菌基因水平转移有性生殖进化
