张争锋 作品数:18 被引量:65 H指数:7 供职机构: 山东省计算中心 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 河南省杰出人才创新基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 自动化与计算机技术 更多>>
陕西地区中国荷斯坦牛4个微卫星的遗传多态性分析(英文) 用4个微卫星BM1824,BM2113,CSSM66和ETH152对陕西地区中国荷斯坦牛的遗传结构和遗传变异进行分析。结果表明,4个微卫星座位在中国荷斯坦牛中均处于哈代—温伯格不平衡状态。这4个微卫星座位的多态信息含量(... 张润锋 陈宏 张争锋 张永德 蓝贤勇关键词:中国荷斯坦牛 微卫星 文献传递 基于高性能服务器及网格技术的生物科研服务平台研究 2008年 为了解决生物科学方面的研究人员在使用生物研究软件工具中存在的"不知道、选不出、难学习和用不起"等问题,同时也为了能为生物类院校的师生提供教学辅助,利用网格技术在高性能服务器上,建立了一款服务于生物研究和教学的网上生物科研服务平台(Biological study service platform,BSP)。该平台包含"工具大全、工具论坛和web工作台"等三部分,拟分别从"找,学,用"三个方面彻底解决生物研究人员在使用生物研究软件工具中存在的问题,同时也为生物类的教师和学生提供了教与学平台。访问地址如下:http://218.57.145.30:9999/biosp/。此外,该研究小组还将不断地更新和改进该平台,开发更多的自主应用软件,更好地服务生物科研工作。 张争锋 李秋玲 杨英 赵志刚 李良 陈丽娟关键词:教学辅助 南阳牛IGF2基因第2外显子多态性及其与生长发育相关性研究 被引量:12 2007年 以126头纯种南阳黄牛为研究材料,利用PCR-RFLPs技术对胰岛素样生长因子2(IGF2)第2外显子的多态性及其与生长发育的相关性进行了分析。结果表明:南阳牛在该位点的遗传多态性丰富。检测到2种等位基因A和B,频率分别为0.686 5和0.313 5,A等位基因在群体中是优势等位基因;BB型个体的6、12、18、24月龄体斜长和胸围,12、18和24月龄的坐骨端宽,初生、6月龄和24月龄体重等体征性状显著地优于AA型;6月龄体斜长、12月龄的胸围、18月龄和24月龄坐骨端宽也显著优于杂合型。初步推断IGF2基因是非常有价值的辅助选择标记,可为南阳牛肉用型方向选择提供理论依据。 张争锋 陈宏 李秋玲 雷初朝 薛恺 王新庄 王轶敏 牛晖关键词:IGF2 南阳牛 PCR-RFLP 生长发育 中国荷斯坦牛红毛基因变异及其编码蛋白结构预测 被引量:3 2008年 【目的】通过对中国荷斯坦牛MC1R基因的核苷酸序列分析和蛋白结构预测,探讨中国荷斯坦牛红白花毛色形成的分子机制。【方法】采用PCR-RFLP技术对MC1R基因进行分型,利用生物信息学方法对其蛋白结构特征进行模拟分析。【结果】检测出与毛色表型相关的三种基因型,EE基因型在中国荷斯坦黑白花牛中占优势,ee基因型在中国荷斯坦红白花牛中占优势。蛋白预测结果显示,ee基因型个体的缺失突变使蛋白质翻译提前终止,引发二级结构改变,导致中国荷斯坦牛红白花个体的出现。【结论】E等位基因主要与黑色毛色形成有关,e等位基因主要与红色毛色形成有关。 李秋玲 李建斌 张争锋 王洪梅 高运东 侯明海 仲跻峰关键词:MC1R 蛋白结构 生物信息服务平台 杨英 赵志刚 陈丽娟 李良 张争锋 项目基于网格架构、采用Globus Toolkit4、门户等技术,设计实现了一个生物信息服务平台,在平台上安装部署了多种生物信息数据处理软件,通过门户界面帮助生物专业人员查找、选择和使用相关计算工具。平台解决的主要技术问...关键词:关键词:生物信息 网格 秦川牛及其杂种牛生长性能及杂种优势研究? 通过对4月龄纯种秦川牛(QQ)67头,秦安杂种牛(秦川牛♀×红安格斯牛♂,AQ)36头、秦德杂种牛(秦川牛♀×德国黄牛♂,DQ)14头和秦利杂种牛(秦川牛♀×利木赞牛♂,LQ)47头,共计164头杂交一代牛生长发育性状特... 刘波 陈宏 蓝贤勇 张志清 张争锋 胡沈荣 张润峰关键词:杂种优势 文献传递 南阳牛IGFⅡ基因第二外显子多态性研究 本实验以南阳黄牛研究所保种场的85头纯种南阳牛为研究材料,利用PCR-RFLPs对类胰岛素样因子Ⅱ(IGFⅡ)的第二外显子的多态性进行了分析.结果表明:南阳牛在该位点的遗传多态性丰富.检测到两种等位基因A和B,频率分别为... 张争锋 陈宏 薛恺 王珊 王新庄 王居强关键词:南阳牛 PCR-RFLP 多态性 第二外显子 文献传递 郏县红牛IGF2基因多态性与生长性状关系研究 被引量:8 2008年 本研究利用PCR-SSCP技术首次对郏县红牛母牛IGF2基因多态性及其与生长性状关系进行了研究。结果表明:IGF2基因第2外显子表现多态性,存在AA、AB、BB三种不同基因型。其频率分别为0.235/0.480/0.285;A/B等位基因频率分别为0.474/0.526;该位点纯合度为0.501,杂合度为0.499,位点间有效等位基因数为1.996。该基因位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。通过对郏县红牛IGF2基因第2外显子位点不同基因型与样本体重及其它体尺指标的关联分析表明:不同基因型对胸围(P<0.01)和体重(P<0.05)有显著影响,AB基因型个体的胸围和体重明显大于AA和BB型个体。说明IGF2基因可以作为标记用于郏县红牛的肉用选育。 毛海霞 陈宏 张春雷 张争锋 雷初朝 蓝贤勇 王居强关键词:郏县红牛 IGF2基因 Leptin基因的PCR-SSCP与牛体重、体尺指标的相关性(英文) 被引量:8 2007年 利用PCR-SSCP技术研究了南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和荷斯坦奶牛6个牛品种539个个体leptin基因的遗传多态性。结果表明,PCR扩增产物大小为330bp,PCR-SSCP分析表现出多态。南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和荷斯坦奶牛的A等位基因频率分别为0.558,0.492,0.571,0.658,0.591,0.615;B等位基因频率分别为0.442,0.508,0.429,0.342,0.409,0.385。不同基因型与体重、体尺等生长性状指标相关性分析的结果表明:南阳牛群体内除12月龄的体高和日增重、18月龄的坐骨端宽和日增重外,BB型个体的六月龄、十二月龄、十八月龄、二十四月龄体斜长、胸围、体重、坐骨端宽、体高和日增重均显著的大于AB和AA型个体(P<0.05);秦川牛群体内BB基因型个体十字部高上显著高于群体AA、AB型个体(P<0.05),即BB>AA、AB,可作为秦川牛体尺指标(十字部高)候选基因之一,但在体重、胸围、体长指标上均无显著差异(P>0.05),所以不宜作为体重、胸围、体长指标候选基因;郏县红牛群体内AB与BB基因型个体在十字部高和坐骨端宽上显著高于群体AA型个体(P<0.05),而群体内不同基因型在体重和体尺指标(体高、体斜长、胸围)上无显著差异(P>0.05)。序列分析表明,leptin基因多态是第66位发生G→T、第67位发生A→C及299位发生新的单核苷酸突变C→T所造成。 杨东英 陈宏 王新庄 田志环 唐立刚 张争锋 雷初朝 张良志 王轶敏关键词:LEPTIN 生长发育性状 南阳牛IGF-2基因PCR-RFLP分析 被引量:1 2005年 利用PCR-RFLP技术和限制性内切酶Bsr I对85头南阳牛类胰岛素样因子2(IGF-2)进行了分析。结果表明:南阳牛在该位点检测到两种等位基因A和B,其基因频率分别为0.5471和0.4529。A等位基因包括185bp和32bp两个片段,B等位基因包括118bp、67bp、32bp三个片段。南阳牛在该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。 张争锋 王居强 薛恺 雷初朝 蔡欣 王新庄 陈宏关键词:南阳牛 IGF-2 PCR-RFLP 多态性