徐士林
- 作品数：33 被引量：153H指数：8
- 供职机构：盐城市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：盐城市医学科技发展计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- ARIMA模型在盐城市肺结核发病率预测中的应用被引量：4
- 2017年
- 目的:探讨差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型在盐城肺结核发病率预测中的应用。方法:利用盐城市2011年1月—2016年12月的肺结核月发病率建立乘积季节ARIMA模型,并评价模型的预测效能。结果:盐城市肺结核预测模型为ARIMA(1,1,0)(2,1,0)12,该模型的参数估计具有统计学意义,拟合优度检验统计量最小标准化贝叶斯信息准则(Normalized BIC)=-0.144,残差序列检验统计量Ljung-Box=0.247(P>0.05),残差为白噪声,模型能够拟合出肺结核的发病趋势。结论:ARIMA模型可以应用于盐城市肺结核发病趋势的预测,对肺结核的预防控制有积极的意义。
- 杨长庆嵇冬静李峰徐士林
- 关键词：肺结核发病率
- 江苏省儿童家长肠道病毒71型灭活疫苗接种意愿和影响因素被引量：10
- 2020年
- 目的掌握江苏省家长为儿童接种肠道病毒71型(EV71)灭活疫苗的意愿和影响因素。方法采样分层随机抽样方法,抽取江苏省三个市6月龄-5岁儿童家长进行面对面在线问卷调查,采用多因素Logistic回归分析EV71疫苗接种意愿的影响因素。结果65.9%(593/900)的家长愿意为孩子接种EV71疫苗。多因素Logistic回归分析显示,居住在苏州市或盐城市、愿意为孩子接种水痘疫苗、手足口病认知高、认为疫苗价格能接受的儿童家长为孩子接种EV71疫苗的意愿率高;而家庭有医学背景者接种意愿率低。结论江苏省儿童家长为孩子接种EV71疫苗的意愿率较高,需进一步加强对儿童家长的EV71疫苗相关知识宣传。
- 嵇红嵇红霍翔张雪峰崔佳佳徐士林徐士林陈立凌许阳婷
- 关键词：手足口病影响因素
- 2013—2017年盐城市流感流行病学特征分析被引量：8
- 2019年
- 目的了解2013-2017年盐城市流感样病例(ILI)流行病学及病原学特征,为流感预防提供理论依据。方法通过中国流感监测信息系统,收集2013—2017年盐城市ILI及实验室检测信息,采用描述性研究方法对监测数据进行分析。结果 2013—2017年共报告ILI 62 999例,各年ILI%差异有统计学意义(P<0.05)。2015-2017年每年均存在冬春季(第1～10周)和夏秋季(第30～36周)两个流行高峰,2013年和2015年秋季流行高峰较为明显。ILI发病人群以<15岁婴幼儿及儿童为主(占88.8%),各年度年龄组构成差异有统计学意义(P<0.05)。流行毒株以甲H1N1型、乙型和甲H3型中的两型交替出现为主。ILI标本阳性率为8.14%,其中甲H1N1占29.85%,季H3占38.20%,B型占30.69%,病毒阳性率峰值与ILI%高峰存在正相关(r=0.562,P <0.001)。≥60岁龄组阳性率(11.62%)高于5～岁组(7.75%)、15～岁组(5.92%),差异有统计学意义(P<0.05);不同年龄组感染流感核酸型别差异有统计学意义(P<0.05)。流感/ILI暴发疫情共报告25起,主要集中在2017年(14起)、2016年(7起),其中2017年以乙型为主,2016年以季H3型为主。结论 ILI流行时间分布与病毒阳性率趋势一致,流感病毒流行毒株存在年度变异,建议发病高峰期对中小学及托幼机构、老年人群接种流感疫苗。
- 李长城徐士林姜仁杰陈国清王瑶倪慧明
- 关键词：流感样病例流行性感冒流感病毒流行病学特征病原监测
- 盐城市2015-2017年一类疫苗疑似预防接种异常反应监测分析
- 2022年
- 综合分析盐城市2015-2017年一类疫苗疑似预防接种异常反应(AEFI)监测数据。方法:通过收集中国免疫规划信息系统个案数据和流调信息,采用描述性流行病学方法进行分析数据资料。结果:盐城市2015-2017年累计报告3709例AEFI,平均报告发生率91.26/10万剂;男女性别比1.27:1,主要报告年龄组为12月龄以下婴幼儿;AEFI报告地区发生率前三位是大丰区、东台市和阜宁县;AEFI报告以一般反应为主,多数在接种疫苗后0-3天内发生;AEFI报告症状主要为发热、红肿、硬结和哭闹,其中接种麻风疫苗引起发热和皮疹症状、接种百白破疫苗引起哭闹、红肿、硬结、嗜睡、食欲不振、乏力和出汗等症状、接种脊灰疫苗后引起腹泻症状、接种白破疫苗后引起瘙痒症状、接种A群流脑后引起呕吐症状报告发生率均高于其它种类一类疫苗,差异均具有统计学意义。结论:AEFI监测数据分析有利于我市免疫规划工作开展,确保预防接种安全性。
- 于进姚学君管书慧徐士林
- 关键词：疑似预防接种异常反应描述性流行病学
- 2018年盐城市CVA6型肠道病毒全基因组分子特征分析
- 2024年
- 目的掌握盐城市肠道病毒CVA6型基因进化特征。方法对盐城市鉴定为CVA6型的肠道病毒,通过反转录聚合酶链式反应的方法扩增全基因组序列,扩增产物经纯化测序,采用相应的生物信息软件进行核苷酸及氨基酸序列比对、分子进化树构建以及重组分析。结果盐城市2018年共检测疑似疱疹性咽峡炎病例107例,肠道病毒核酸阳性率73.83%,其中CVA6、CVA16、其他肠道病毒分别占50.63%、5.06%、44.30%,未检出EV71。选取3株2018年疱疹性咽峡炎、3株2018年手足口病(流行月峰前、峰中、峰后)、1株2017年手足口病CVA6型代表株进行全基因组测序,遗传进化树显示:7株盐城株位于B进化分支B2基因亚群分支,3株疱疹性咽峡炎CVA6型代表株与2株2018年手足口病CVA6型毒株聚集成簇构成一进化小分支,2株手足口病毒株(2017年、2018年各1株)形成独立的进化小分支,形成2条传播链。选取2个进化小分支中疱疹性咽峡炎、手足口病CVA6型各1株,进行分子进化重组分析,均未发现明显的重组来源。结论2018年盐城市疱疹性咽峡炎的病原谱呈现遗传多样性,CVA6型肠道病毒为优势流行株,与手足口病的CVA6型肠道病毒可能有着共同的来源,盐城株未发现基因重组。
- 王瑶陈国清薛宇铭安然李长城徐士林李春香
- 关键词：疱疹性咽峡炎全基因组序列基因重组
- 盐城市1起病毒性脑炎疫情的肠道病毒Echovirus18VP1基因分子特征
- 2021年
- 目的对盐城市1起病毒性脑炎聚集性疫情分离的Echovirus18(E-18)型肠道病毒进行VP1基因分子进化特征分析。方法通过实时荧光RT-PCR方法,对2019年盐城市病毒性脑炎聚集性疫情标本进行肠道病毒的检测,对非EV71或CVA16其他肠道病毒进行分子分型,采用RT-PCR扩增E-18型肠道病毒VP1基因并测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸和分子进化3个层面进行分子特征分析。结果该起病毒性脑炎聚集性疫情是由E-18型肠道病毒感染引起,其6例病例;肛拭子肠道病毒核酸通用阳性4例,阳性率66.67%;均为轻症,全部治愈。4株E-18型肠道病毒株VP1基因片段均未见核苷酸的插入或者缺失,长度均为861bp、编码287个氨基酸,其核苷酸、氨基酸同源性分别为99.9%~100.0%和100.0%;与2019年E-18型手足口病盐城株(151/HFMD/JSYC/2019)VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为99.5%~99.7%和100.0%;与原型株Metcalf VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为79.0%~79.1%和93.4%。遗传进化树显示,2019年盐城市4株病毒性脑炎代表株与1株手足口病代表株聚集成簇,构成1个独立进化分支,属于C2基因亚群分支毒株。与原型株Metcalf相比,盐城市4株病毒性脑炎代表株涉及19个氨基酸位点的变异,变异率为6.62%,与1株手足口病代表株在VP1基因B-C loop区域发生了R84N氨基酸位点的变异。结论该起病毒性脑炎聚集疫情由E-18型肠道病毒引起,该病毒属于C2基因亚群优势进化分支,与本地手足口病代表株可能有共同的来源。
- 李春香陈国清王瑶李峰徐士林李长城
- 关键词：病毒性脑炎基因型VP1基因
- 盐城市2010年手足口病流行病学分析被引量：2
- 2011年
- 目的:通过对2010年盐城市手足口病流行病学和病原学特征的分析,为科学防治手足口病提供依据。方法:对全部重症病例和部分普通病例用咽拭子、肛拭子等方法采集标本行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)核酸测定,对疫情监测数据进行流行病学分析。结果:手足口病4 280例中,发病率为50.41/10万,死亡1例(0.02%),手足口病四季均可发病,以春夏季多见,4～7月为发病高峰季节,以托幼机构和散居儿童发病较多,发病率最高年龄段为1～5岁,占87.99%,男性多于女性。病原学监测结果:采样480份,肠道病毒阴性155例,肠道病毒阳性325例,其中EV71型178例(37.08%),其他肠道病毒103例(21.46%)。结论:盐城市手足口病的发生有明显年龄、性别、季节差异,应针对性加强监测,发现疫情尽快采取有效防控措施,避免疫情蔓延。
- 徐士林杨长庆姜仁杰张红军倪慧明
- 关键词：手足口病逆转录-聚合酶链反应儿童流行病学
- 2015年盐城市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因分子进化特征分析被引量：4
- 2017年
- 目的了解盐城市2015年甲型H3N2流感病毒分离株表面血凝素HA1基因分子进化特征。方法对哨点医院流感样病例标本进行核酸检测、病毒分离;选取甲型H3N2毒株,采用一步法RT-PCR扩增其HA1区,并进行序列分析,采用DNAStar软件包中MegAlign进行核苷酸及氨基酸同源性分析,以MEGA6.0软件进行序列比对及基因种系进化特征分析。结果 2015年盐城市流感样病例(ILI)监测样本中流感病毒核酸阳性率为8.36%,乙型、甲型H3N2、新甲H1N1型交替流行。抽取的7株甲型H3N2分离株,其HA1基因核苷酸同源性为98.7%~100.0%,氨基酸同源性为97.9%~100.0%;其HA1区氨基酸位点变异呈散在性分布,均未发生氨基酸的丢失和插入,氨基酸突变主要位于抗原决定簇的A、B和C区。除A/JSYC/11025/2015外,其余6株新增2个糖基化位点,其中158aa位点位于抗原决定簇B区。结论 2015年盐城市流感流行以甲型H3N2和乙型Yamagata系为主,具有典型的冬、夏双高峰特点。病毒HA1区基因特性逐渐发生变异,可能导致抗原变化,应进一步加强流感病原学监测。
- 陈国清李春香邵荣标王瑶徐士林李长城
- 关键词：流感RT-PCRHA1基因
- 三甲医院突发公共卫生事件应急管理的探讨被引量：8
- 2017年
- 目的探讨三甲医院预防保健科突发公共卫生事件的应急管理机制。方法 2015年1月—2017年9月,我院实施了建立传染病管理应急机制、构建医院HIS系统传染病模块等措施加强传染病管理,观察管理期间我院传染病上报情况。结果管理期间,传染病均于24 h内完成报卡,无漏报或延迟上报,上报率100%。结论建立传染病管理应急机制、加强传染病相关培训能提高传染病上报及时率、准确率,对提高医院突发公共卫生事件应急处置能力具有积极作用。
- 陈坚徐士林顾淼阚琳
- 关键词：突发公共卫生事件传染病应急管理
- 2016年盐城市手足口病病原学特征及EV71和CVA16型肠道病毒VP1基因特征被引量：11
- 2017年
- 目的了解2016年盐城市手足口病肠道病毒病原谱分布特征,并对鉴定为EV71、CVA16型肠道病毒VP1基因进行分子进化特征分析。方法收集疑似手足口病咽肛拭子标本,采用实时荧光RT-PCR方法检测通用、EV71和CVA16型肠道病毒核酸,以RT-PCR法扩增其VP1基因全长编码区并进行序列分析,采用MegAlign、mafft、MEGA等软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果 2016年盐城市共收集疑似手足口病标本504份,检出肠道病毒核酸阳性165份,阳性率32.74%,EV71型、CVA16型、其他型别分别占4.37%、6.94%、21.43%。对EV71、CVA16型肠道病毒遗传进化树分析显示,盐城地区EV71和CVA16代表株分别属于C4a、B1b基因亚群进化分支,未发生基因亚群的转换,在各自进化分支中形成3条传播主链,远离各自原型株。结论 2016年盐城市手足病病原谱为多种基因型的肠道病毒共同流行。其他肠道病毒为优势病原体,EV71和CVA16仍占有一定比例。
- 陈国清李春香王瑶李峰徐士林李长城邵荣标
- 关键词：手足口病EV71VP1基因
