白丽军
- 作品数:7 被引量:96H指数:4
- 供职机构:四川农业大学更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 五叶草莓(Fragaria pentaphylla Lozinsk)果色变化的转录调控机理研究
- 五叶草莓(Fragaria pentaphylla Lozinsk)是蔷薇科蔷薇亚科草莓属的植物,也是中国特有的植物。本研究旨在筛选、鉴定草莓果色变化相关基因并初步探明其调控机理,为草莓果色领域的理论研究及增加果实商品性...
- 白丽军
- 关键词:五叶草莓
- 文献传递
- 荔枝EST-SSR分子标记开发与种质资源遗传多样性分析
- 本研究利用先期获得的荔枝果皮cDNA文库EST序列,通过SSRIT在线检索,从3391条EST序列中,发现305条含有SSR,占整个文库EST的8.99%。利用SSR-ESTS序列共设计100对EST-SSR引物,从96...
- 向旭白丽军赵俊生欧良喜孙清明陈洁珍蔡长河
- 关键词:荔枝栽培技术种质资源
- 文献传递
- 中国96个荔枝种质资源的EST-SSR遗传多样性分析被引量:38
- 2010年
- 根据本实验室已获得的荔枝果皮cDNA文库EST序列,通过SSRIT在线检索,从3391条EST序列中,发现305条含有SSR,占整个文库EST的8.99%。利用SSR-ESTs序列共设计100对EST-SSR引物,其中62对在荔枝上有扩增产物,50对有扩增多态性,即具有一定的通用性。接着从96份荔枝种质中选取12个品种的基因组DNA,开展核心引物筛选,共筛选出多态性较好的EST-SSR分子标记30个;这30个EST-SSR分子标记在96份资源共扩出284条带,不同引物的扩增条带在3~18条之间,平均9.47条,其中有282条为多态性带,多态率高达99.30%,每对引物的Nei's基因多样度范围为0.186~0.396,香农信息指数范围为0.318~0.558;此外,系统聚类分析结果表明,在相似系数0.5525处,可将96份荔枝种质资源分成了8大类群,该8大类群基本与其生态类型和植物学性状特征相符。在此基础上,还对荔枝的主栽品种和特殊种质进行鉴别,结果表明,该30个EST-SSR分子标记在不同品种间可产生较清晰可辨的多态性差异,为荔枝品种以及种质资源鉴别和鉴定的分子指纹的构建奠定了良好基础。
- 向旭欧良喜陈厚彬孙清明陈洁珍蔡长河白丽军赵俊生
- 关键词:荔枝EST-SSR种质资源
- 荔枝EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发被引量:55
- 2011年
- 【目的】明确荔枝EST序列中SSR的总体特点,开发荔枝EST-SSR引物,为利用EST-SSR分子标记进行荔枝种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础。【方法】应用SSRIT软件,按照设定标准从自行构建的一个荔枝果皮发育关键期的cDNA文库中的1 331条Unigene(惟一序列)中搜索SSR位点。利用软件Primer primer5.0设计EST-SSR引物。选用16份表型差异较大的荔枝种质资源检测引物的有效性及多态性,利用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)进行片段分离。【结果】荔枝的1 331条EST序列中共搜索出220个SSR位点,分布于189条EST中,出现频率是16.53%。这些EST-SSR的平均长度为18.43 bp,平均分布频率1/4.42 kb。在1—6 bp的重复基元中,二核苷酸和三核苷酸重复类型占主导地位,共占总SSR的69.09%,二者出现的频率分别为37.27%和31.82%。共观察到72种重复基元,出现频率最高的是GA/TC(16.82%);其次是AG/CT、A/T、AT/TA及GAA/TTC,频率分别为14.55%、11.82%、5.00%和3.64%。不同核苷酸数目的重复基元的重复次数差异很大。设计、合成150对EST-SSR引物,122对(81.33%)引物在荔枝中获得有效扩增,100对引物具有多态性。【结论】荔枝EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高。本研究为利用EST-SSR标记开展荔枝遗传研究提供了100对EST-SSR引物,并为进一步开发荔枝EST-SSR标记提供了含SSR位点的候选序列。
- 孙清明马文朝马帅鹏赵俊生白丽军陈洁珍蔡长河向旭欧良喜
- 关键词:荔枝ESTSSR
- 荔枝EST-SSR分子标记开发应用及核心种质构建
- 我国是世界荔枝原产地,其栽培史悠久,生态环境多样,拥有世界上最富有的荔枝种质资源和适应不同环境条件的荔枝品种和类型,包括单性结实、胚败育、特大型果、特晚熟、纯甜风味和果皮鲜红等。目前,大多荔枝优稀种质未能商品化栽培,主要...
- 白丽军
- 文献传递
- 利用EST-SSR分子标记鉴别荔枝新品种红灯笼被引量:7
- 2010年
- 利用自主开发的30个EST-SSR分子标记,对红灯笼与95份荔枝种质(主栽品种和特殊种质)进行UPGMA聚类(遗传相似系数)、特异谱带、多态性类型和分子指纹的差异鉴别分析。研究结果表明,红灯笼应是一个与其他95个荔枝种质资源完全不同的新种质,基本排除了红灯笼母株来源于疑似来源荔枝种质间杂交而产生的后代的可能,其母株极有可能是来源于广东省东莞的怀枝品种,并属其自交产生的实生变异。
- 向旭欧良喜白丽军赵俊生孙清明陈洁珍蔡长河
- 关键词:荔枝EST-SSR分子指纹
- SSR分子标记在荔枝上的研究进展被引量:10
- 2009年
- SSR作为第二代基于PCR的一种新型DNA分子遗传标记,数量丰富、多态性高、重复性好、分布于整个基因组、特异位点扩增、发生频率高、共显性遗传等,在果树育种中具有极大的应用价值和开发潜力。本文主要简述了SSR标记的原理和特点,并从分子指纹图谱构建、种质资源的遗传多样性分析、核心种质的发掘、品种鉴定、分子标记辅助育种、遗传图谱构建与基因定位等多方面介绍了近年来SSR技术在荔枝上的应用现状及前景。
- 欧良喜向旭狄凤香白丽军陈洁珍孙清明
- 关键词:SSR分子标记荔枝