袁运生 作品数:13 被引量:36 H指数:3 供职机构: 上海交通大学 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 农业科学 更多>>
骨桥蛋白及其护肝用途 一种生物医药技术领域的骨桥蛋白及其护肝用途,所述的蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNO:1所示;所述的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。所述的蛋白在制备用于治疗病毒性的、代谢性的或毒性病原学的急性、亚急性、爆发... 俞雁 袁运生 韩伟文献传递 小鼠肝再生过程中脂质代谢相关通路中基因的表达谱变化(英文) 被引量:1 2009年 1材料与方法
1.1材料 试验动物:9周龄的雄性C57BIV6小鼠,自由采食和饮水,每天光照12h,黑暗12h。试剂:TRIzol试剂(Invitrogen);RNeasy Total RNA Mini Kit(Qiagen);基因芯片Genechip mouse genome 43020(Affymetrix);17启动子引物序列(Affymetrix)。 袁运生 张夕原 严德珺 杨婷旭 郜尽 俞雁关键词:脂质代谢 再生过程 小鼠 表达谱 通路 TRIZOL 小鼠肝再生过程中脂质代谢相关通路中基因的表达谱变化 被引量:1 2009年 [目的]研究肝再生过程中肝脏内脂质代谢通路相关基因的表达谱变化。[方法]建立CC l4诱导肝再生小鼠模型,从小鼠肝组织中提取总RNA,通过微阵列基因芯片技术检测在不同肝再生期间脂质代谢通路相关基因的表达变化,并进行具体功能分析。[结果]肝再生过程中,有98个脂质代谢相关基因的表达水平发生了变化,根据这些基因表达的变化趋势可以分为8组。整体上看,基因表达前期表现为抑制,后期表现为上调。其中,脂肪酸的合成通路基因表达以上调为主,分解代谢通路变化并不明显;大多数胆汁酸合成通路基因在4.5天之前表现为抑制,在4.5天和7天时表现为上调。[结论]肝再生过程中,脂质代谢相关通路间的基因表达变化并不一致,这些数据为进一步研究脂质代谢相关通路对肝再生的调控作用提供了明确的基因范围。 袁运生 张夕原 严德珺 杨婷旭 郜尽 俞雁关键词:脂质代谢 基因表达谱 肝再生 微阵列芯片 过氧化作用与肝脏疾病 被引量:21 2010年 肝脏疾病中,过氧化通常被定义为强氧化复合物和抗氧化防御之间的不平衡,过量的过氧化产物是肝脏疾病的重要标志物.活性氧是一种机体代谢反应的活性产物,他可以造成很多细胞内分子如膜脂、蛋白和DNA损伤.氧化作用在肝脏疾病发病机制中有着重要意义.本文总结氧化作用自由基的特点以及部分抗氧化剂的特性,并且讨论了氧化作用产物在肝脏疾病中的重要意义. 朱润芝 李京敬 谢超 郜尽 胡建军 袁运生 韩伟 俞雁关键词:活性氧 活性氮 肝脏疾病 蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析 被引量:5 2009年 后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究。关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础。目前,用生物信息学的手段来研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,主要包括蛋白质相互作用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究及网络的比对等。文章试图从生物信息学的角度认识蛋白质相互作用,并总结蛋白质相互作用网络的生物信息学分析方法。 谢超 郜尽 袁运生 俞雁关键词:蛋白质相互作用 蛋白质相互作用网络 生物信息学 一种抗人骨桥蛋白的抗体及其应用 本发明公开了一种抗人骨桥蛋白的抗体及其应用,所述抗体包括轻链可变区、重链可变区;所述轻链可变区的CRD区序列包括轻链CDR1、轻链CDR2、轻链CDR3;所述重链可变区的CRD区序列包括重链CDR1、重链CDR2、重链C... 袁运生 周美琪 邓晴 朱建伟文献传递 酵母双杂交研究小鼠肝脏再生TGF-β调控通路中相关转录因子的相互作用 2011年 目的采用酵母双杂交系统研究肝脏再生调控途径转化生长因子β(TGF-β)信号通路中4种转录因子的相互作用。方法经CCl4腹腔注射诱导建立小鼠肝损伤再生模型,提取模型小鼠肝脏组织总RNA作为模板,经RT-PCR获得cDNA。经肝脏再生基因芯片检测显示差异表达且与TGF-β信号通路相关的激活转录因子3(ATF3)、DNA结合抑制因子3(ID3)、DNA损伤诱导的转录因子3(DDIT3)和LIM蛋白家族成员FHL2(FHL2)作为候选基因,进行基因克隆和载体构建,PCR及DNA测序鉴定。采用酵母双杂交系统进行自激活检测实验和酵母双杂交实验,观察ATF3、FHL2、DDIT3和ID3之间的相互作用。结果 PCR及DNA测序鉴定表明,ATF3、FHL2、DDIT3、ID3基因克隆与载体构建成功。自激活检测显示ATF3、FHL2、DDIT3和ID3不存在自激活现象;酵母双杂交实验发现7对蛋白互作,分别为ID3/ATF3、FHL2/ATF3、ATF3/ATF3、FHL2/FHL2、ID3/FHL2、ID3/ID3和ID3/DDIT3。结论 ATF3、FHL2和ID3间的蛋白互作可能对TGF-β信号通路具有调控作用;蛋白互作网络可作为肝损伤再生机制研究的途径之一。 谢超 王方圆 袁运生 郜尽 朱润芝 韩伟 俞雁关键词:肝脏再生 转录因子 酵母双杂交系统 骨桥蛋白:肝脏疾病中的一个重要分子 被引量:1 2011年 骨桥蛋白(osteopontin,OPN)是一种多功能的糖蛋白,在体内参与多种生理和病理活动.众多的研究已经表明OPN表达在多种肝脏疾病和肝病动物模型中发生异常变化,这种变化具有重要的病理意义.深入研究OPN在不同肝脏疾病中的作用机制和其调控的通路,对寻找治疗肝脏疾病的新靶点和开发新药物都有非常重要意义. 袁运生 谢旻旗 钱正昊 张夕原 严德珺 俞雁关键词:骨桥蛋白 肝脏疾病 受体 生物标记 一种抗终末糖基化蛋白受体的抗体及其应用 本发明公开了一种抗终末糖基化蛋白受体的抗体及其应用,所述抗体包括轻链可变区、重链可变区;所述轻链可变区的CRD区序列包括轻链CDR1、轻链CDR2、轻链CDR3;所述重链可变区的CRD区序列包括重链CDR1、重链CDR2... 袁运生 陈会 肖欣怡 朱建伟文献传递 S100A4原核表达载体的构建以及蛋白的表达和纯化 被引量:2 2013年 S100A4是S100蛋白家族的成员,在细胞的增殖、分化、损伤修复以及肿瘤细胞转移等方面发挥重要的调控作用。本研究将S100A4全长基因构建到pET28a原核表达载体上,利用大肠杆菌表达系统表达和纯化出高纯度的重组人S100A4。通过试验证明,重组人S100A4蛋白在体外可以有效地增强黑色素瘤细胞A375-S2的增殖。重组人S100A4原核表达与纯化方法的建立将促进其结构和生物学功能研究,并且对于S100蛋白家族其它蛋白的表达与纯化具有重要的参考意义。 韩雷 何虹霖 关文 李京敬 袁运生 俞雁关键词:S100A4 原核表达 蛋白纯化 蛋白活性