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多肽穿过纳米孔道的力谱和电流谱特征: 蛋白快速测序问题,依然是技术上的挑战。近期,人们力图发展基于纳米孔道传感器的检测生物分子结构的全新方法,而拉伸分子动力学模拟(SMD)技术,被用于指导纳米孔道传感器的工艺设计与信号检测方案的制定。本工作,我们利用SMD技...; 黄庆生吴洪明吴建华; 文献传递

整合素αvβ3与纤连蛋白FN复合物的解离动力学模拟: <正>整合素αvβ3(integrinαvβ3)与纤连蛋白FN(fibronectin)之间的相互作用,在多种肿瘤细胞的恶性转移过程中起到至关重要的作用。αvβ3和FN的键合和解离,受到血流剪应力环境的调制。揭示其中的力...; 李趣欢方颖刘广建刘文平吴建华; 关键词：复合物动力学模拟纤连蛋白整合素; 文献传递

TSP8结构域参与ADAMTS13自抑制关键残基的预测: 2021年; 目的ADAMTS13自身结构域的相互作用抑制其酶切VWF,以及脱靶酶切。寻找TSP8结构域上结合Spacer的关键残基。方法同源模建TSP8后,将其与Spacer柔性对接,进行平衡与自由分子动力学模拟,寻找潜在的Spacer结合位点。突变TSP8上可能的关键位点,构建Mut TSP8/Spacer复合物。; 吴芝伟杨俊贤谢旭斌方颖吴建华林蒋国; 关键词：ADAMTS13 同源模建 TSP 结构域分子动力学模拟

Kindlin与β整合素的相互作用的分子动力学模拟: 2024年; 目的Kindlin是激活整合素的重要胞内适配蛋白,是黏附斑的主要成分。Kindlin-2与β整合素胞质尾部远端的特异性结合通过Kindlin-2的特定口袋与β整合素的TTV基序结合,该口袋的相关突变会引起kindlin-2黏附斑定位的缺失,并影响整合素的激活,因此探索kindlin-2与β整合素突变后的结合机制,可为靶向Kindlin-2蛋白治疗的相关药物设计提供理论基础。方法通过选取kindlin-2与β1整合素的共晶体以及对接结构,借助分子动力学模拟手段,在原子水平上揭示野生型与TTV突变及疾病相关突变对kindlin与β整合素结合机制的影响。结果与野生型体系相比,突变体系存在不稳定性。关键的氢键相互作用减少,使kindlin与β整合素的相互作用减弱,解离概率增加。在受到力的拉伸下,突变体复合物解离的时间变短,解离力变小,复合物机械强度降低。结论Kindlin相关突变后会影响复合物的稳定性,增加复合物的解离概率,影响kindlin与整合素的结合,从而导致整合素激活受损、黏附斑定位缺失以及相关疾病的产生。; 罗仙雯方颖吴建华李趣欢; 关键词：Β1整合素氢键相互作用共晶体分子动力学模拟

流体剪应力作用下E-选择素介导的中性粒细胞钙响应被引量：2: 2018年; 目的探讨流场下E-选择素介导的中性粒细胞钙响应过程。方法采用平行平板流动腔结合荧光显微镜,在0~600 m Pa流体剪应力（fluid shear stress,FSS）下,实时观察中性粒细胞在不同浓度E-选择素上的黏附及随后产生的钙响应。结果在流场环境下E-选择素可特异性介导中性粒细胞的稳定黏附和钙响应,细胞的黏附数和激活比率随浓度的提高而逐渐增加。只有固定的E-选择素才能传递力信号来有效触发细胞的钙响应,FSS的增加不仅提高了细胞的激活比率（从23%增至70%）,增加了钙响应的强度（从0.92增至1.45）,而且大大缩短了细胞自黏附到钙响应启动的时间（从70 s减为27 s）。结论 FSS和E-选择素协同调控中性粒细胞的钙响应,FSS对钙响应的速度和水平实行正向调节。研究结果可深化血流环境下白细胞免疫响应过程的理解。; 张力吴建华方颖; 关键词：中性粒细胞 E-选择素流体剪应力

P选择素诱导白细胞表面整合素LFA-1的活化: 研究背景:在炎症反应过程中,P-选择素与其配体PSGL-1结合导致白细胞在血管内皮的滚动黏附,随后,选择素LFA-1受到趋化因子的诱导而激活,从而识别并结合表达在内皮细胞上的配体ICAM-1,实现白细胞的稳定粘附,进而迁...; 凌颖琛方颖吴建华; 关键词：P-选择素 LFA-1; 文献传递

整合素家族的系统进化分析: <正>整合素是由α和β两种亚基经非共价键连接所形成的一类细胞粘附分子。整合素作为免疫粘附分子的重要家族之一,其主要介导了细胞与细胞,细胞与细胞外基质,及细胞与病原体之间的相互作用。整合素参与了白细胞的游走迁移,免疫突触的...; 李趣欢李娜王菁方颖吴建华; 关键词：整合素家族系统进化分析; 文献传递

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吴建华