曹建平
- 作品数:3 被引量:12H指数:2
- 供职机构:电子科技大学生物医学工程系更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学化学工程医药卫生更多>>
- 计算方法在蛋白质相互作用研究中的应用被引量:8
- 2005年
- 计算方法在蛋白质相互作用研究的各个阶段扮演了一个重要的角色。对此,作者将从以下几个方面对计算方法在蛋白质相互作用及相互作用网络研究中的应用做一个概述:蛋白质相互作用数据库及其发展;数据挖掘方法在蛋白质相互作用数据收集和整合中的应用;高通量方法实验结果的验证;根据蛋白质相互作用网络预测和推断未知蛋白质的功能;蛋白质相互作用的预测。
- 曹建平马义才李亦学石铁流
- 关键词:蛋白质功能预测蛋白质相互作用网络蛋白质间相互作用
- 钩端螺旋体蛋白质相互作用网络预测与系统分析被引量:4
- 2006年
- 问号钩端螺旋体是一种致病菌,能够引起人畜共患病.该细菌全基因组序列测序的完成,为从全蛋白质组学的角度分析蛋白质相互作用网络提供了基础.本研究通过整合4种计算方法(基因融合法、基因邻居法、系统发生谱法和操纵子法)来预测钩端螺旋体赖株蛋白质相互作用网络.对运动和趋化系统、信号传导系统、脂多糖生物合成以及黏附、侵袭等有关蛋白质之间的相互作用进行了详细分析.除此以外,根据蛋白质的相互作用网络以及功能分类,预测了203个未知蛋白质可能的功能.这不仅为进一步研究钩端螺旋体赖株的致病机制提供了一个资料,也为在基因组范围内应用生物信息学方法研究微生物提供了一个实例.
- 孙景春徐晋麟曹建平刘琪郭晓奎石铁流李亦学
- 关键词:问号钩端螺旋体
- 生物信息学方法研究蛋白质相互作用
- 随着人类基因组测序工作的完成,功能基因组的全面展开,后基因组的时代已经到来。而阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物功能,即蛋白质组的研究,成为我们研究的重要目标,因为蛋白质才是生命活动的真正执行...
- 曹建平
- 关键词:生物信息学蛋白质相互作用支撑向量机
- 文献传递