李亚栋
- 作品数：29 被引量：52H指数：5
- 供职机构：河北省农林科学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金河北省科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 番茄褪绿病毒河北株系基因组、克隆引物、侵染性cDNA及应用
- 本发明提供了番茄褪绿病毒河北株系基因组、克隆引物、侵染性cDNA及应用。属于基因工程技术领域。本发明针对石家庄地区流行的番茄褪绿病毒样本，采用分段PCR引物分别扩增并整合番茄褪绿病毒基因组RNA1和RNA2，构建了番茄褪...
- 吴志明康忱田哲娟李亚栋高亢王鹏
- 甘薯近缘种Ipomoea trifida (Kunth) G.Don基因组Fosmid文库构建及PCR筛选体系建立被引量：2
- 2014年
- 为挖掘有价值的基因资源,对甘薯近缘种I.trifida的基因组文库进行了研究。通过流式细胞法测定I.trifida（2x,编号DLP4597）基因组大小为531.699 Mb。以叶片为材料采用包埋法提取基因组DNA,通过物理剪切进行基因组DNA片段化并进行末端平滑化和磷酸化处理,脉冲场电泳回收33-48 kb的DNA片段,然后连接到Fosmid载体pCC1FOS（Epicentre）上,包装转化大肠杆菌EPI300,构建了I.trifida的基因组Fosmid文库,该文库包含101 952个单克隆,保存于1 062个96孔培养板中,平均插入片段35 kb,覆盖基因组约6.7倍,理论上任意片段筛出率达到99.88%。以20个96孔板为一组构建三维PCR筛选体系,共分为53个组（第53组包含22个96孔板）,每组包含1个超级池,20个板池,12个列池,8个行池,理论上最多通过93个PCR反应即可筛选到1个阳性单克隆。随机选择来自I.trifida的10个基因进行文库克隆筛选,平均阳性克隆数为8.2个,最少阳性克隆数为3个,最多为16个。
- 李昂吴志明周志林赵冬兰张安马代夫李亚栋唐君曹清河
- 关键词：基因组FOSMID文库
- 检测黄瓜白粉病抗病基因mlo的KASP引物及其应用
- 本发明涉及分子生物学和黄瓜育种技术领域，特别是指检测黄瓜白粉病抗病基因mlo的KASP引物及其应用。本发明设计了可用于检测mlo基因该插入/缺失片段不同基因型的KASP引物和包含KASP引物的试剂盒。本发明提供的KASP...
- 康忱王鹏李亚栋田哲娟赵雪芳吴志明
- 黄瓜CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在霜霉病和白粉病胁迫下的表达分析
- 2022年
- 【目的】对黄瓜全基因组的CC-NBS-LRR(CNL)基因家族进行生物信息学和表达模式分析,为深入研究CNL基因家族在黄瓜生长、发育和病害胁迫响应中的功能提供参考。【方法】以拟南芥CNL为参考序列,利用本地Perl语言和Pfam等软件检索黄瓜‘9930’基因组并确定黄瓜CNL基因家族成员。通过ExPASy、GSDS2.0、MEGA、MEME、Tbtools、Mev等工具对黄瓜CNL家族基因进行生物信息学分析。根据转录组数据库、霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensis)、白粉病菌(Podosphaera xanthii)接种处理和实时荧光定量PCR技术分析该类基因的表达模式。【结果】从黄瓜全基因组中鉴定得到17个CsCNL,这些基因分布在除1号染色体外的6条染色体上,其编码蛋白与其他植物CNL结构相似,均含有CC、NBS和LRR保守结构域,蛋白质大小介于197—1148 aa,分子量在22.6—131.3 kD,等电点在5.71—8.38。共线性分析表明其中不存在片段重复和串联重复基因,多物种系统进化关系表明,CsCNL基因家族成员在葫芦科植物之间具有较高的结构和功能相似性。CsCNL启动子中存在多种与抗病相关的顺式作用元件。CsCNL表达具有组织特异性。在接种霜霉病菌2 d和5 d后,Csa3G815400、Csa3G822360和Csa7G420890在抗性品种中均显著上调表达,Csa4G015850在抗性品种中下调表达,在敏感品种中显著性表现不一;在接种白粉病菌2 d和5 d后,Csa2G008000和Csa3G684170在敏感品种中显著上调表达,在抗性品种中显著下调表达;Csa4G016360、Csa7G420890和Csa7G425940在抗性品种中显著上调表达,在敏感品种中表达量无变化或显著下调。【结论】CsCNL家族成员具有组织表达特异性并且多数基因能够响应霜霉病菌和白粉病菌的胁迫。推测Csa3G815400、Csa3G822360和Csa7G420890表达量增加,Csa4G015850表达量减少可诱发抗病黄瓜品种的霜霉病抗病反应;Csa4G016360、Csa7G420890和Csa7G425940表达量增加,Csa2G008000和Csa3G684170�
- 康忱赵雪芳李亚栋田哲娟王鹏吴志明
- 关键词：黄瓜霜霉病白粉病
- 检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物及其应用
- 本发明涉及分子生物学和番茄育种技术领域，特别是指检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty‑3和Ty‑3a基因分型的KASP引物及其应用。基因Ty‑3在其第3723位碱基的位置存在一处SNP位点，该SNP位点碱基的突变导致Ty‑...
- 康忱吴志明王鹏李亚栋田哲娟王美娥
- 一种掌叶半夏胰蛋白酶抑制剂基因、其编码的蛋白及抗虫应用
- 本发明公开了一种掌叶半夏胰蛋白酶抑制剂基因、其编码的蛋白及抗虫应用。基因的核苷酸序列表如SEQ ID NO：1所示。在培育耐抗虫转基因植物时，首先构建含有SEQ ID NO：1所示基因的重组表达载体，然后利用所得重组表达...
- 董文琦吴志明高俊平田哲娟蒲娜娜党红凯李亚栋
- 文献传递
- 检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-1的KASP引物及其应用
- 本发明涉及分子生物学及作物育种技术领域，特别是指检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty‑1基因分型的KASP引物及其应用。番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty‑1在第3461碱基的位置存在一处SNP位点，该SNP位点碱基的突变导致...
- 吴志明王鹏李亚栋康忱田哲娟王洪乐邙光伟杨超沙王美娥
- 一种掌叶半夏胰蛋白酶抑制剂基因、其编码的蛋白及抗虫应用
- 本发明公开了一种掌叶半夏胰蛋白酶抑制剂基因、其编码的蛋白及抗虫应用。基因的核苷酸序列表如SEQ ID NO：1所示。在培育耐抗虫转基因植物时，首先构建含有SEQ ID NO：1所示基因的重组表达载体，然后利用所得重组表达...
- 董文琦吴志明高俊平田哲娟蒲娜娜党红凯李亚栋
- 文献传递
- 植物多胺代谢与胁迫响应研究进展被引量：10
- 2012年
- 多胺是一类广泛存在于生物体内的低分子量脂肪族聚合物。植物体内多胺的平衡与植物体包括胁迫响应等诸多生理功能密切相关。综述了植物多胺的合成与分解代谢进程研究进展,并对其在植物抵御包括盐、干旱与低温等非生物胁迫以及抗病与抗虫等生物胁迫方面功能的研究进行概述。指出多胺代谢途径的调节是提高植物抗逆性的有效途径,利用基因工程技术影响多胺平衡在植物抗性育种中具有广阔的应用前景。
- 李亚栋何近刚
- 关键词：多胺多胺代谢非生物胁迫生物胁迫胁迫响应
- 检测黄瓜细菌性角斑病基因的KASP引物及其应用
- 本发明涉及分子生物学及作物育种技术领域，特别是指检测黄瓜细菌性角斑病基因的KASP引物及其应用。黄瓜细菌性角斑病抗性基因CsPSL在323的位置存在一处SNP位点，本发明基于该SNP位点开发了KASP引物、包含该KASP...
- 吴志明康忱李亚栋朱金城田哲娟高振华齐连芬
- 文献传递
