公共文化服务平台

李金明: 作品数：12 被引量：38H指数：5; 供职机构：南方医科大学基础医学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目广州市科技计划项目更多>>; 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>

合作作者

基于胸阻抗的人体肺功能参数测量方法被引量：3: 2013年; 目的研制一种基于人体胸阻抗变化的测量,获取人体肺功能参数的新方法。方法基于生物阻抗法研究用力呼吸过程中胸阻抗的变化与肺功能参数值的关系,研制了胸阻抗测量仪实验样机,分别采用所研制的实验样机和基于传统流量计进行肺功能测量的MIR公司的spirolabⅢ肺功能仪,对10例健康人进行对比实验,所测肺功能参数包括:用力肺活量、一秒率和峰值流量。结果所测数据均落于其均值的正负两倍标准差范围之内因为两种方法具有较好的一致性。结论基于生物阻抗法研制的实验样机所测肺功能参数与市售肺功能仪(基于流量计测量方法)的测量结果有较好的一致性。; 杨建明钟胜河梁妃学郭劲松李伟龙李金明; 关键词：胸阻抗用力肺活量

PBL教学法在医学生物信息学实践教学中的应用被引量：11: 2011年; 实践教学是医学生物信息学课程的最重要的特点,改进实践教学方法是提高本课程教学质量的重要途径。探讨了在医学生物信息学实践课程中结合"基于问题的学习"(PBL)的教学思路与方法,为完善医学生物信息学教学提供参考。; 郭艳芳李金明; 关键词：生物信息学实践教学 PBL教学法

非负矩阵分解在微阵列数据分类和聚类发现中的应用被引量：5: 2014年; 基因芯片是微阵列技术的典型代表,它具有高通量的特性和同时检测全部基因组基因表达水平的能力。应用微阵列芯片的一个主要目的是基因表达模式的发现,即在基因组水平发现功能相似,生物学过程相关的基因簇;或者将样本分类,发现样本的各种亚型。例如根据基因表达水平对癌症样本进行分类,发现疾病的分子亚型。非负矩阵分解NMF方法是一种非监督的、非正交的、基于局部表示的矩阵分解方法。近年来这种方法被越来越多地应用在微阵列数据的分类分析和聚类发现中。系统地介绍了非负矩阵分解的原理、算法和应用,分解结果的生物学解释,分类结果的质量评估和基于NMF算法的分类软件。总结并评估了NMF方法在微阵列数据分类和聚类发现应用中的表现。; 任重鲁李金明; 关键词：非负矩阵分解微阵列数据

重度哮喘TH2细胞免疫治疗的定量研究被引量：1: 2011年; 目的探讨TH2细胞在重度哮喘中的作用和重度哮喘的可能免疫路径,为临床治疗重度哮喘提供理论依据.方法基于代理因子建模（ABM）的方法,在改变TH2细胞初始量条件下,仿真了3种效应（免疫胜利、免疫失败、免疫高反应）的图表,结合临床数据讨论TH2细胞与树突细胞（DC）相互之间的定量关系,对照基本免疫仿真器（BIS）中模型,定量探讨TH2细胞在重度哮喘中的作用.结果免疫高反应与TH2细胞初始数量无关.TH2细胞为70时,免疫胜利最大；TH2细胞为10到30间或大于80时,免疫失败占主导地位；当TH2细胞为20时免疫失败最大.当缺少DC细胞时,有100％免疫损失.DC初始值为80时免疫胜利比例为最大；超过80时,免疫胜利的比例都小于峰值.结论免疫高反应与TH2细胞初始数量无关,DC-TH2细胞-IL4-嗜中性炎性反应的免疫轴可能是导致重度哮喘的免疫路径.; 宋丽艳闫微郭云波邓亲恺李金明; 关键词：仿真重度哮喘比照靶标

重度哮喘的TH2细胞免疫机制的定量研究: 2012年; 目的为了探讨TH2在重度哮喘中的功能,指出重度哮喘可能的传播路径,以便为临床治疗重度哮喘提供理论基础。方法基于代理因子建模(ABM)的方法,研究在改变TH2初始量和增加某些免疫细胞的情况下,仿真了三种效应(免疫胜利,免疫失败,免疫高反应)的图表,结合临床数据讨论了TH2与DCs相互之间的定量关系,比照BIS中DCs模型,探讨TH2在重度哮喘中的功能。结果通过仿真模型与报道过的基本科学文献模型相比较,证实了初始先天响应的程度对获得性免疫响应是一个关键的决定。结论用BIS来定量地检查对病毒感染免疫响应的先天性和获得性免疫细胞对TH2相互作用,通过初始因子数目参数扫描来完成校准,得出免疫高反应与TH2初始数量基本没有关系的结论,指出DCs-TH2-炎症的免疫轴可能是导致重度哮喘的传播路径,建议以DCs和TH2作为治疗重度哮喘的靶子,可能为临床治疗提供了理论基础。; 宋丽艳郭云波邓亲恺李金明; 关键词：重度哮喘仿真比照靶标

整合卵巢癌染色体拷贝数变异与差异表达基因的生物信息学分析被引量：5: 2014年; 目的从分子的遗传变异和表达水平综合探讨卵巢癌的发病机制,为临床诊疗提供新思路。方法从TCGA数据门户上下载大样本的高浆液性卵巢癌DNA拷贝数数据和mRNA表达数据,使用GISTIC对拷贝数变异进行分析,利用SAM软件包samr筛选差异表达基因;并利用GSEA等工具进行生物信息学分析。结果 GISTIC发现45个拷贝数扩增区域;SAM和Fisher's exact test发现拷贝数扩增区域中有40个拷贝数变异的基因能引起表达差异;GSEA富集分析发现这些拷贝数变异基因主要富集在多个有关癌症基因集的研究报告中。结论利用生物信息学方法综合分析拷贝数变异数据和基因表达数据,能充分有效地获取信息,为确定卵巢癌的早期诊断和治疗靶点提供新的思路。; 邓祯祥王文辉李金明; 关键词：卵巢癌拷贝数变异基因差异表达

基于ABM,定量研究TH17在重度哮喘中的功能: 2012年; 为了探讨TH17在重度哮喘中的功能,定量研究随着TH17的初始量变化引起的免疫系统中重度哮喘的机制,找到重度哮喘可能的传播路径。本文以BIS为平台,参照BIS中DC初始量变化及相应的运行数量,仿真了TH17初始量变化的模型(ABM),并与BIS已仿真出来的DCs模型相比较,仿真模型符合临床数据,验证了模型的正确性,得出免疫高反应与TH17初始量无关的结论,指出了重度哮喘可能的传播路径,建议以TH17作为治疗重度哮喘的靶标,为临床治疗奠定了理论基础。; 宋丽艳郭云波邓亲恺李金明; 关键词：重度哮喘免疫系统仿真靶标

重度哮喘的TH2细胞功能的定量研究: 2012年; 目的:由于重度哮喘中包含TH2因子,我们要探讨TH2在重度哮喘中的功能,指出重度哮喘可能的传播路径,以便为临床治疗重度哮喘提供理论基础。方法:基于代理因子建模(ABM)的方法,研究在改变TH2初始量和减少某些先天性免疫细胞或获得性免疫细胞的情况下,仿真了三种效应(免疫胜利,免疫失败,免疫高反应)的图表,结合临床数据讨论了TH2与DCs相互之间的定量关系,比照BIS中DCs模型,探讨TH2在重度哮喘中的功能。结果:通过仿真模型与报道过的基本科学文献模型相比较,模型符合了临床数据,证实了初始先天响应的程度对获得性免疫响应是一个关键的决定。先天免疫缺少导致获得性免疫的极度增加。在先天性与获得性免疫系统中出现的任一免疫系统成分的缺陷均会减少对清除病毒感染成功的概率。结论:用BIS来定量地检查对病毒感染免疫响应的先天性和获得性免疫细胞对TH2相互作用,通过初始因子数目参数扫描来完成校准,得出免疫高反应与TH2初始数量基本没有关系的结论,指出DCs—TH2—IL4—-炎症的免疫轴可能是导致重度哮喘的传播路径,建议以DCs和TH2作为治疗重度哮喘的靶子,可能为临床治疗提供了理论基础。; 宋丽艳郭云波邓亲恺李金明; 关键词：BIS ABM 比照

癌症基因组图谱计划数据及分析被引量：5: 2014年; 人类癌症细胞中通常藏匿着多种引起恶性病变的染色体变异,核酸替换和表观遗传修饰。癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)计划的目标是获取、刻画并分析人类癌症中大规模、多种变异的分子特征,并且为癌症研究者迅速地提供数据。本文对TCGA数据的四个产生流程以及包含的癌症种类、数据类型、数据水平、分析流程和常用的几种分析工具等进行阐述,同时以卵巢癌(ovarian cancer)为例详细介绍了TCGA数据在突变分析、拷贝数分析、表达分析和通路分析等方面的应用,并对TCGA研究团队近几年有关胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)的研究方法和结果以及已经完成分析的癌症类型进行综述。; 邓祯祥李金明; 关键词：数据类型数据分析数据挖掘

基因的单核苷酸多态性与乳腺癌关系的研究进展被引量：1: 2014年; 乳腺癌是女性发病率最高的恶性肿瘤,具有家族聚集性,其发生发展是一个复杂的过程,涉及多种不同基因的相互作用和相互调控。随着基因技术和分子生物技术的飞速发展,许多基因被揭示在乳腺癌的发生发展中起关键作用,如BRCA、FGFR、ATM、ZNF365、Pokemon基因等。基于流行病学研究,这些易感基因可被分为高外显率易感基因和低外显率易感基因,其多态性对乳腺癌具有重要的影响。对乳腺癌易感基因的研究有助于阐明乳腺癌的发生机制、发展过程,对其早期诊断、预后判断和良恶性鉴别也有着重要的意义,可为乳腺癌的临床生物基因靶向治疗提供新的靶点和理论基础。本文主要对这些基因的单核苷酸多态性与乳腺癌关系的研究进展进行了综述。; 陈诗哲马天骏周文琪李金明郭艳芳; 关键词：单核苷酸多态性乳腺癌 BRCA FGFR ATM POKEMON

李金明

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

李金明

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈