焦文静
- 作品数：6 被引量：40H指数：3
- 供职机构：北京化工大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 基于SNP位点鉴定砂仁药材物种被引量：14
- 2014年
- 目的:为建立基于单核苷酸多态性(SNP)技术鉴别砂仁3个基原(阳春砂Amomum villosum、海南砂Amomum longiligulare、绿壳砂Amomum villosum var.xanthioides)的方法,对这3个种共计60份材料ITS2序列进行分析比较。方法:将实验所得砂仁ITS2序列,应用CodonCode Aligner软件进行序列拼接比对。用MEGA 5.0导出各序列变异位点,并对变异位点进行分析。为验证结果准确性,下载砂仁3个基原GenBank的所有ITS2序列,共计34条,对结果进行验证。结果:砂仁ITS2序列比对后长度为230 bp,3个不同基原在135 bp和199 bp处存在稳定SNP(s)变异位点。结论:本研究开发的两个稳定的SNP(s)位点可以快速准确地鉴定砂仁药材3个基原。
- 焦文静张鹏廖保生王丽丽韩建萍
- 关键词：砂仁ITS2SNP位点
- 基于ITS2序列鉴定金樱子及其伪品被引量：3
- 2013年
- 目的：本文选用金樱子作为研究对象验证DNA条形码鉴定中药材的稳定性及准确性。方法：通过改良的CTAB法提取10份样品的基因组DNA,扩增得到ITS2片段。将得到的片段进行双向测序,运用软件CodonCode Aligner进行拼接,其它6份样品来源于GenBank。将金樱子与混伪品ITS2序列应用MEGA 5.0软件进行序列比对,计算种内、种间距离,构建邻接树（neighbor-joining tree,NJTree）。结果：金樱子药材ITS2序列长度为219~221 bp,存在两个Poly C结构。金樱子种内平均Kimura 2-parameter（K-2-P）遗传距离为0.005,远小于与混伪品的种间平均K-2-P遗传距离0.574。NJ树结果表明金樱子与混伪品分为两枝,Bootstrap支持率为99%,表现出良好的单系性。结论：ITS2序列作为DNA条形码能准确稳定的鉴别金樱子药材,本研究为保证金樱子临床用药安全提供了技术保障。
- 焦文静张鹏陈晓辰廖保生王丽丽韩建萍
- 关键词：金樱子DNA条形码ITS2物种鉴定
- 基于ITS2序列鉴定金樱子及其伪品
- 金樱子(Rosae Laevigatae Fructus)为蔷薇科植物金樱子(Rosa laevigata Michx.)的干燥成熟果实,是我国常用的中药材,含有多种营养成分,富含胡萝卜素,维生素C、Bl、B2,多种氨基...
- 焦文静张鹏陈晓辰廖保生王丽丽韩建萍
- 关键词：金樱子DNA条形码ITS2物种鉴定
- 基于ITS2和psbA-trnH序列对细小种子类药材车前子的鉴定比较被引量：22
- 2014年
- 为考察ITS2序列和psbA-trnH序列对车前子药材及其常见混伪品的鉴定能力,该研究对车前子2个基原物种及7种混伪品共71份样本进行了研究。采用MEGA 5.1对获得的ITS2和psbA-trnH进行序列比对,计算种内和种间kimura2-parameter(K2P)遗传距离,并构建系统发育树。结果显示,车前和平车前的ITS2序列长度分别为199,200 bp;两者的ITS2序列种内最大K2P遗传距离均小于与混伪品的最小种间K2P遗传距离;基于ITS2序列构建的NJ树中,车前、平车前及其混伪品都表现出良好单系性,都能相互明显区分。表明ITS2序列能将车前子药材与混伪品进行很好的区分。车前和平车前的psbA-trnH序列长度均为340 bp,两者的psbA-trnH序列种内最大K2P遗传距离小于与混伪品的最小种间K2P遗传距离;基于psbA-trnH序列构建的NJ树结果显示,除大车前外,车前子药材与其余混伪品可以明显区分。因此,ITS2序列作为DNA条形码,车前子及其混伪品具有良好的鉴别能力,对保障车前子用药安全具有重要意义。
- 宋明张雅琴林韵涵凃媛马孝熙孙伟向丽焦文静刘霞
- 关键词：混伪品DNA条形码ITS2
- 基于ITS2序列鉴定金樱子及其伪品
- 金樱子(Rosae Laevigatae Fructus)为蔷薇科植物金樱子(Rosa laevigata Michx.)的干燥成熟果实,是我国常用的中药材,含有多种营养成分,富含胡萝卜素,维生素C、Bl、B2,多种氨基...
- 焦文静张鹏陈晓辰廖保生王丽丽韩建萍
- 关键词：金樱子DNA条形码ITS2物种鉴定
