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猪传染性胃肠炎病毒结构蛋白基因克隆及特征分析: 参照TGEV的已知基因序列针对S基因设计3对特异引物、针对sM、M和N基因各设计1对特异引物,以RT—PCR扩增TGEV TS株的S、sM、M和N 4种结构蛋白基因,测序后进行各基因序列及其特征分析.结果如下:1.S基因...; 程杰; 关键词：S基因 M基因 N基因基因特征分析; 文献传递

猪源冠状病毒ORF3和ORF7的克隆及特性分析被引量：3: 2007年; 参照GenBank中Purdue株全序列对TGEV(猪传染性胃肠炎病毒)TS株的ORF3和ORF7各设计1对特异性引物,经RT-PCR扩增分别获得了1 487 bp和516 bp大小的两个片段,与预期结果大小相符.TS株与CHV株、Puedue株、BW021898B株和KT2株的ORF3a核苷酸序列同源性分别为99.1%、93.0%、95.9%、94.4%,相应的氨基酸同源性分别为97.3%、87.8%、93.2%、91.8%,TS株与CHV株、Puedue株、BW021898B株和KT2株的ORF3b核苷酸序列同源性分别为99.5%、98.5%、97.0%、97.8%,相应氨基酸的同源性分别为98.4%、96.3%、94.3%、95.8%,而TS株与PRCVIA1894株的ORF3b核苷酸和氨基酸同源性分别为96.6%和93.9%.TS株ORF7没有发生缺失且和其他毒株有很高的同源性.结果表明:TGEV非结构蛋白高变区在ORF3a第192个碱基至终止密码子之间,TGEV和PRCV在编码ORF3b氨基酸的数量和RNA酶结合位点上有一定的差异.; 李建强柳纪省程杰兰喜胡永浩吴润殷相平李宝玉; 关键词：传染性胃肠炎病毒 ORF3 ORF7 克隆

猪传染性胃肠炎病毒分子生物学研究进展被引量：19: 2006年; 猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)基因组为不分段的单股正链RNA,其编码4种结构蛋白和3种非结构蛋白。TGEV S蛋白是基因工程研究的重点,近年来,S蛋白在大肠埃希菌、沙门菌、腺病毒等中得到了高效表达。将传染性胃肠炎病毒的基因组人工改造成为感染性cDNA的表达载体,此载体可在ORF3处插入外源基因,异源基因绿荧光蛋白可稳定、高效地表达。TGEV基因1和其他冠状病毒相比保守性很强,所以对TGEV聚合酶的研究,特别是其中保守酶的研究,对于抗TGEV及其他冠状病毒药物的研究有着重要的意义。; 李建强柳纪省胡永浩程杰兰喜殷相平李宝玉李志勇杨彬马友记; 关键词：猪传染性胃肠炎病毒分子生物学特性

猪源冠状病毒TGEV中国分离株纤突蛋白生物信息学分析被引量：4: 2009年; 以猪源冠状病毒(Porcine coronavirus)TGEV纤突蛋白基因序列为基础,利用生物软件对TGEV中国分离株纤突蛋白进行N-糖基化位点、跨膜螺旋、进化树、二级结构及抗原位点的预测和分析。结果显示所有TGEV毒株可分为3个基因型,4株中国分离株分别归属于以上3个基因型,属于Ⅰ型的中国株TSX在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上与其他中国株有明显的差异,而同属于Ⅲ型中国毒株SC-Y和TH-98在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上非常接近,而所有中国分离株抗原表位没有明显差别,表明TGEV在中国没有显著的变异。; 李建强柳纪省程杰兰喜殷相平李宝玉李学瑞杨彬娄忠子吴润; 关键词：猪传染性胃肠炎纤突蛋白生物信息学分析

猪源冠状病毒聚合酶基因的克隆及特性分析: 2006年; 参照GenBank中Purdue株序列对TGEVTS株聚合酶基因(ORF1)设计特异性引物,经RT-PCR扩增获得了20054bp的片段,与预期大小相符。TS株与Pur46-MAD株的ORF1核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.8%和99.0%,与FIPV、PEDV、HCV299E及SARS氨基酸同源性分别为88%、57%、57%和45%。不同冠状病毒比较结果显示RdRp有很高的保守性而且有重要的作用,序列分析标明TS株在ORF1a和ORF1b重叠区有核糖体剪切位点UUUAAAC,且相应区域RNA二级结构形成3个茎环结构。; 李建强柳纪省程杰兰喜胡永浩吴润; 关键词：克隆

TGEV的sM、M和N基因克隆及特征分析被引量：9: 2005年; 参照GenBank中收录的TGEVsM、M和N基因序列各设计1对特异引物,经RTPCR扩增获得了TS株的相应基因片段,分别约为346、932和1217bp,其大小与预计的目的片段相符。与其他毒株的相应基因相比较,并经剪接后,TS株的sM、M和N基因全长分别为248、789和1149bp,各编码82个、262个和382个氨基酸;TS株与Purdue株、TFI株和961933株的sM基因核苷酸序列同源性分别为95.2%、92.7%和90.2%;推导氨基酸的同源性分别为95.9%、97.2%、98.8%;与Purdue株、TFI株、TGEVH株和961933株的M基因核苷酸序列同源性分别为95.2%、98.0%、99.6%和95.0%;推导氨基酸的同源性分别为97.0%、97.3%、98.5%、93.5%;与Purdue株、TFI株、FS722/70株、Korea株、TO14株、TGEVH株和961933株的N基因核苷酸序列同源性分别为98.1%、97.7%、99.0%、98.3%、99.2%、99.0%和95.9%,推导氨基酸的同源性分别为97.9%、98.4%、99.0%、97.7%、99.5%、96.2%、96.6%。并对TS株基因间的保守序列和sM、M和N基因及其编码的相应氨基酸的结构特征进行了分析,发现sM和N基因在TGEV中保守;并提示在我国不仅存在有2个不同亚基因型的TGEV,而且我国的TGEV可能是输入性的。; 程杰柳纪省吴润殷相平李宝玉兰喜王辉; 关键词：猪传染性胃肠炎病毒 TGEV M基因 N基因克隆

猪传染性胃肠炎病毒S基因的克隆及其结构特征被引量：5: 2004年; 参照GenBank中登录的TGEVS基因序列设计了 3对特异引物 ,经RT PCR扩增获得了TS株S基因的SⅠ、SⅡ和SⅢ 3个片段 ,其大小分别约为 12 6 2、2 36 8和 12 6 6bp。SⅠ、SⅡ和SⅢ片段经剪接后 ,可知TS株的S基因全长为 4 347nt ,共编码 14 4 9个氨基酸。对TS株与其他毒株的S基因序列进行比较发现 ,TS株与Miller株、FS72 2 / 70株、TGEVH株、96 1933株、TFI株均在 112 4～112 9位有 5′ ATGATA 3′六个碱基 ,而在Purdue株、TH 98株、NEB72 RT株和PRCV HOL87株中缺失 ;TS株与Miller株、FS72 2 / 70株、TFI株、Purdue株、96 1933株、TGEVH株、TH 98株、NEB72 RT株和PRCV HOL87株的核苷酸序列同源性分别为 99.6 %、98.9%、98.0 %、98.3%、95 .7%、99.3%、97.7%、98.3%和 97.5 % ,推导氨基酸序列的同源性分别为 99.2 %、98.4 %、97.7%、97.8%、94 .8%、98.6 %、97.2 %、97.7%和 97.0 % ;TS株S蛋白的推导氨基酸序列较Purdue株、TH 98株和NEB72 RT株多出 2个潜在的糖基化位点 ,共 34个。与不同毒株比较后 ,推测在TGEV的S蛋白中第 71位的Asp(D)与呼吸道嗜性有关 ,第 2 19位的Ala(A); 程杰柳纪省吴润殷相平李宝玉王辉兰喜; 关键词：S基因分子克隆结构特征

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程杰