郑娟娟
- 作品数：7 被引量：9H指数：2
- 供职机构：哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金哈尔滨市科技攻关计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术理学更多>>
- Excel工作表函数在四格表资料统计分析中的应用被引量：2
- 2011年
- 目的利用Excel工作表函数实现四格表资料的统计分析过程，以提高广大科研工作者对Excel统计功能的认知。方法用《中国地方病学杂志》中的实际研究结果做数据源，对比Excel和SAS两种软件对四格表资料的统计分析结果。结果Excel工作表函数可实现四格表资料的χ^2检验过程，且并非只是P〉0．05或P〈0．05的结果，而是得到P值的准确数值。两种软件χ^2检验的分析结果一致，但Excel不能获得SAS中的fisher确切概率法结果。结论作为依附型的统计分析软件，Excel是一个易学、易用、高效的好帮手，在没有专业统计分析软件的情况下，Excel可实现资料的统计学分析过程。
- 张镏琢秦平李昂郑娟娟孙远洁袁重胜刘艳
- 关键词：SAS软件四格表统计学
- 探讨χ~2检验结合FDR筛选致病SNPs位点的适用条件被引量：1
- 2012年
- 目的在单核苷酸多态性(SNPs)数据中探讨不同模拟条件χ2检验结合错误发现率(FDR)筛选SNPs位点的适用条件。方法依据2009年2月发布HapMapⅢ期美国犹他州北欧和西欧后裔人群22号染色体前5 000个SNPs数据,采用HAPGEN2模拟病例对照数据,运用Haploview4.2筛选标签SNPs(TagSNPs),比较不同模拟条件筛选致病SNPs的正确率。结果相对危险度(RR)获取方式无显著差异;3种遗传模型均表现正确率随RR值增大而增高,RR相同时,加性模型正确率最高,显性模型次之,隐性模型最低;加性模型RR>2.2、显性模型RR>4和隐性模型RR>5时,正确率超过60%。结论χ2检验结合FDR在加性模型效果最佳,实际科研工作需依据目标疾病具体情况考虑是否适合χ2检验结合FDR方法。
- 郑娟娟孙远洁李昂温琪佟海龙刘艳赵晓雯
- 关键词：单核苷酸多态性相对危险度
- 基于MAX的生物学通路分析实现
- 2014年
- 目的以WTCCCⅠ期公开发表的高血压SNPs数据作为实际数据,展开基于MAX的生物学通路分析,完成该方法的实现过程,并探讨其优势。方法运用Python语言和PLINK软件对数据进行格式转换,应用MAX方法进行单个SNP位点的关联分析,通过i-GSEA4GWAS网络分析平台进行通路分析,寻找疾病的差异表达生物学通路。结果共筛选出6条差异表达通路,查阅文献发现2条差异表达通路与高血压有直接关系,2条差异表达通路与高血压有间接关系。结论在疾病的遗传模型未知的情况下,基于MAX的生物学通路分析综合考虑了多个遗传模型的信息,是一种高效且稳健的分析方法。
- 温琪李昂佟海龙郑娟娟孙远洁顾星博焦辛妮刘艳
- 关键词：单核苷酸多态性通路
- 基于生物学通路方法的全基因组关联分析
- 郑娟娟
- CIS患者OCSP分型及颅内血管狭窄危险因素分析被引量：3
- 2013年
- 目的探讨缺血性脑卒中(CIS)患者分型及颅内血管狭窄的危险因素,为预防脑卒中的再发提供参考依据。方法于2006年3月—2007年2月在哈尔滨医科大学附属第二医院神经内科对首次住院治疗的135例CIS患者进行经颅多普勒超声(TCD)检测,并进行牛津郡社区脑卒中项目(OCSP)分型,运用logistic回归模型分析颅内血管狭窄的危险因素。结果 135例CIS患者OCSP分型比例由大至小依次为后循环梗塞(31.85%)、腔隙性梗塞(31.11%)、部分前循环梗塞(25.93%)、完全前循环梗塞(11.11%);CIS患者颅内血管狭窄率为23.70%(32/135);多因素logistic回归分析结果表明,高血压病史、糖尿病病史、OCSP分型为完全前循环梗塞是CIS患者颅内血管狭窄的危险因素。结论 CIS患者应预防高血压、糖尿病等疾病的发生和发展,并及时给予OCSP分型,以便有针对性地防止颅内血管狭窄的发生及脑卒中的再发。
- 秦平张镏琢李昂郑娟娟孙远洁袁重胜刘艳赵晓雯
- 关键词：缺血性脑卒中OCSP分型颅内血管狭窄经颅多普勒超声
- 不同人群的SNPs基因型数据中r^2值对TagSNP数量的影响被引量：2
- 2012年
- 目的探索不同人群的单核苷酸多态性(SNPs)数据中,连锁不平衡相关程度(用r2值来表示)对标签SNP(TagSNP)数量的影响。方法依据HapMap2009年Ⅲ期所发布的三个人群的22号染色体的SNPs基因型数据,运用Haploview4.2软件筛选tagSNP,对比北京汉族人群、东京日本人群与来自欧洲北部和西部的犹他州人群的r2值与tagSNP数量的关系。结果三个人群均表现出随着所设定的r2值的增大tagSNP数量呈现出逐渐增多的趋势,但r2值相同时三个人群的tagSNP数量却存在着一定的差异,相对说来北京汉族人群和东京日本人群的结果较为接近。结论运用Haplo-view软件筛选tagSNP的方法有效,但要依据目标人群、研究经费等方面的具体情况设置合理的r2值。
- 张镏琢秦平李昂郑娟娟孙远洁袁重胜刘艳
- 关键词：单核苷酸多态性
- 复杂性疾病SNPs数据模拟的实现与效果评价被引量：2
- 2013年
- 目的探讨有效的复杂性疾病单核苷酸多态性(SNPs)数据模拟方法,为疾病发病机理的研究提供帮助。方法运用HAPGEN2软件实现复杂性疾病SNPs数据的模拟,利用GTOOL软件和R语言实现SNPs数据格式的转换,采用LD图以及χ2检验对模拟效果进行评价。结果利用HAPGEN2以JPT+CHB人群的22号染色体的500、1 000、5 000个SNPs位点为参照,分别生成了致病位点个数为3、5、8的模拟数据。模拟数据与相对应的参照数据的LD模式基本相似,致病位点的差异显著性较为明显。结论 HAPGEN2是一种简单有效的SNPs数据模拟软件。
- 孙远洁郑娟娟李昂温琪佟海龙刘艳赵晓雯
- 关键词：复杂性疾病单核苷酸多态性
