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金杰军
金杰军
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
供职机构:
安徽农业大学生命科学学院
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发文基金:
国家自然科学基金
博士科研启动基金
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相关领域:
文化科学
生物学
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合作作者
文汉
安徽农业大学生命科学学院
芮斌
安徽农业大学生命科学学院
申铁
贵州师范大学生命科学学院
乙引
贵州师范大学生命科学学院
范亚东
安徽农业大学生命科学学院
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安徽农业大学
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芮斌
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文汉
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金杰军
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范亚东
1篇
乙引
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申铁
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1篇
华中师范大学...
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计算生物学
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2014
1篇
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大肠杆菌基因缺失菌株中碳中心代谢系统的通量平衡分析和通量变异分析
被引量:1
2013年
大肠杆菌(E. coli)因其遗传信息简单且容易培养而被广泛用作各种生物化学、生物技术研究等的模式微生物。本文首先通过COBRA工具包构建了大肠杆菌碳中心代谢系统的小规模网络,然后分别模拟敲除了其中的25种酶,并利用代谢通量平衡分析和代谢通量变异分析研究了基因敲除后的代谢网络。通过这些结果的综合分析,我们可以推断大肠杆菌碳中心代谢系统的不同的酶对整个体系的作用。
申铁
金杰军
金杰军
乙引
芮斌
关键词:
大肠杆菌
代谢通量
大肠杆菌酶基因缺失菌株碳中心代谢系统的代谢通量分析
2014年
大肠杆菌(E.coli)因其遗传信息简单且容易培养而被广泛用作各种生物化学、生物技术研究的模式微生物.为了认识重要模式生物大肠杆菌的代谢系统中各种酶的作用,以软件分析的模式,对已经构建好的小型大肠杆菌代谢系统在cobra中进行代谢通量平衡分析FBA(Flux-Balance Analysis)和代谢通量变化性分析FVA(Flux Variability Analysis),分别单独敲除代谢系统中的25个酶基因,分析敲除各个酶基因后的FBA和FVA的计算结果,通过作图显示出在大肠杆菌代谢系统中不同酶基因被敲除后每个反应的两项结果变化和不同酶基因被敲除后全部反应的两项结果的变化,以此来推测大肠杆菌代谢系统中各种酶所起的作用.
芮斌
金杰军
范亚东
文汉
关键词:
代谢通量
酶基因
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