李春晓 作品数:31 被引量:49 H指数:4 供职机构: 中国医学科学院肿瘤医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 北京市自然科学基金 北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 环境科学与工程 更多>>
预测癌症患者预后的标志物及其应用 本发明公开了预测癌症患者预后的标志物及其应用,所述癌症包括子宫内膜癌、肺腺癌。所述标志物是FAM65B。本发明还公开了预测癌症患者预后的产品,该产品可以通过检测FAM65B表达量来实现预测癌症患者预后的目的。 钱海利 张颖 王婷 马飞 林晨 李春晓 赵振国 郭建宾文献传递 MTA1和SOX2协同促进食管癌细胞EMT进展 背景:上皮间质转化(Epithelial-Mesenchymal Transition,EMT)是上皮细胞失去极性,经细胞骨架重塑转变为具有迁移能力的间质表型细胞的过程。EMT能使上皮细胞获得迁移能力,这在动物胚胎发育和... 李春晓 刘欢 刘健 林锋 南楠 王海娟 钱海利文献传递 肺鳞癌PD-L1共表达基因及转录调控网络分析 被引量:1 2017年 目的绘制肺鳞癌中细胞程序性死亡配体1(PD-L1)共表达基因关系网络,筛选潜在的PD-L1协同检测生物标志物,寻找可能参与PD-L1调控肿瘤免疫状态的基因及通路。方法采用TCGA肺鳞癌数据集,利用c Bio Portal数据分析平台进行共表达基因集检索,从全基因转录组水平对PD-L1的共表达基因进行Venny分析,筛选目标基因,进行多种类型的聚类和分子关系网络分析,并建立PD-L1调控网络。结果共获得PD-L1中等程度表达相关基因126个,主要为质膜定位型基因,功能集中在免疫调节过程,其中IRF2/NFKB1/IRF1三个转录因子参与了对PD-L1基因集30%以上基因的转录调控。经过PD-L1共表达基因集的核心分子筛选,分析网络节点连接度,得到具有最高连接度的前6个节点基因,依次为IFNG、JAK2、STAT1、CTLA4、CD80和CCR5,对这些基因不同表达水平的肺癌患者的生存情况进行分析,结果显示CCR5是一个有意义的预后指标分子。进一步对PD-L1和CCR5的表达谱数据进行相关性分析,结果显示CCR5与PD-L1表达谱水平的Pearson相关系数为0.47(P<0.05);GO-BP聚类分析显示,CCR5的功能主要聚集在免疫调控、T细胞调控、细胞信号转导等领域,与PD-L1调控网络的功能相符。结论 PD-L1共表达基因集内的主要节点均为免疫相关分子,其中IFNG、CCR5、NFKB1分子对PD-L1共表达基因网络具有最广泛的调控作用,该发现为肺鳞癌免疫治疗的研究和应用奠定了一定基础。 冯飞跃 邱斌 李春晓 钱海利 高树庚关键词:免疫调控 基于多数据库分析代谢相关基因DLAT在结直肠癌中的表达及其临床意义 目的 筛选与结直肠癌患者生存相关的代谢相关基因,探讨二氢硫辛酰胺转乙酰基酶(DLAT)在结直肠癌组织中的表达情况及其与临床病理特征和预后的关系,建立DLAT 共表达分子调控网络.方法 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库... 王婷 李春晓 南鹏 王劲松 张竞尧 周彦彤 董德操 王海娟 钱海利关键词:结直肠癌 代谢相关基因 抗PD-1治疗敏感性相关基因及其应用 本发明公开了抗PD‑1治疗敏感性相关基因及其应用,同时还公开了用于预测抗PD‑1治疗敏感性的试剂、试剂盒。另外,本发明还公开了用于提高癌症患者对PD‑1治疗敏感性的方法和药物,上述研究成果为临床治疗癌症提供了新的策略和思... 钱海利 张颖 王婷 马飞 林晨 李春晓 赵振国 郭建宾文献传递 SERINC4基因的新用途 本发明涉及SERINC4基因的新用途,具体涉及SERINC4基因在预测子宫内膜癌患者预后中的新用途。本发明首次发现了分子标志物SERINC4与子宫内膜癌预后相关,通过检测受试者SERINC4的变化,可用于子宫内膜癌预后预... 钱海利 张颖 王婷 马飞 林晨 李春晓 赵振国 郭建宾文献传递 食管癌淋巴结转移相关基因的转录水平筛选及网络分析 被引量:4 2017年 目的从转录组水平筛选食管癌淋巴结转移相关基因,为深入研究食管癌淋巴结转移提供线索。方法利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据资源,采用随机森林分类方法从转录水平分析、筛选食管癌淋巴结转移相关基因,并对其进行功能聚类。结果获得了与食管癌淋巴结转移相关基因的相关显著性排序,分析获得的重要相关基因集的功能主要集中在细胞代谢及DNA修复、转录等的调控上,并在其中获得了与食管癌淋巴结转移密切相关的代谢及DNA调控领域中的重要节点基因。结论 Heatmap图显示获得一簇明显的淋巴结转移相关基因,聚类分析显示这些基因主要集中在代谢和DNA调控等功能上,网络分析获得了KRAS、PPM1B、PPP3CA、ATR、WRN、TOP2B等与食管癌淋巴结转移相关的重要节点基因。 冯飞跃 邱斌 李春晓 钱海利 高树庚关键词:食管癌 淋巴结转移 转录水平 BLK基因在预测癌症患者预后的工具中的应用 本发明公开了BLK基因在预测癌症患者预后的工具中的应用,所述癌症包括子宫内膜癌、肺腺癌、黑色素瘤。本发明实验证明BLK基因表达量高的患者比BLK基因表达量低的患者预后好,因此可以根据BLK表达量高低来预测癌症患者的预后。 钱海利 张颖 王婷 马飞 林晨 李春晓 赵振国 郭建宾文献传递 循环肿瘤DNA预测激素受体阳性晚期乳腺癌患者内分泌治疗耐药的临床分析 被引量:8 2017年 目的探讨多基因联合检测预测激素受体阳性晚期乳腺癌患者内分泌治疗耐药的临床应用价值。方法采用回顾性病例分析方法,收集2015年1月至2016年8月中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院收治的30例激素受体阳性晚期乳腺癌患者的临床资料。于患者治疗前采集其外周血10 ml,利用目标区域捕获测序技术检测循环肿瘤DNA(ct DNA)突变情况。根据患者是否存在耐药相关基因(TP53、PIK3CA、m TOR、ERBB2、ESR1、FGFR1)突变,将其分为基因突变组和非基因突变组。分析内分泌治疗耐药与基因突变的关系。采用Kaplan-Meier法绘制2组患者的无进展生存(PFS)曲线,用Log-rank检验比较两者之间的差异。并用χ~2检验比较基因突变组与非基因突变组患者发生原发耐药的差异。结果在30例患者中,基因突变组与非基因突变组患者分别有20例和10例。随访1~19个月,中位随访时间为3个月,2组患者中位PFS分别为3个月和5个月,并且,基因突变组患者6个月PFS率明显低于非基因突变组(10%比50%,χ~2=8.328,P=0.004)。20例基因突变组患者中,原发耐药者18例,继发耐药者2例,而10例非基因突变组患者中原发耐药者5例,继发耐药者5例;基因突变组原发耐药者比非基因突变组多(χ~2=5.963,P=0.026)。结论联合检测多个耐药相关基因的ct DNA,能够预测晚期乳腺癌患者内分泌治疗耐药。 易宗毕 马飞 远丽芳 李春晓 管彦芳 管秀雯 黎立喜 王佳玉 徐兵河关键词:乳腺肿瘤 受体 雌激素 药物疗效 预测乳腺癌患者对抗HER2治疗药物反应性的基因突变位点及其应用 本发明公开了预测乳腺癌患者对抗HER2治疗药物反应性的基因突变位点及其应用。具体的,经过发明人的大规模筛选,首次发现HER2基因编码序列第3020位点基因型与乳腺癌患者对曲妥珠单抗、拉帕替尼或吡咯替尼的药物反应性相关。基... 马飞 徐兵河 易宗毕 管秀雯 刘斌亮 李春晓文献传递