FST基因多态性与槟榔江水牛和德宏水牛繁殖性能的相关性研究 被引量:4 2015年 [目的]为了解水牛繁殖性能的分子基础及建立检测分子标记,本研究分析卵泡抑素(FST)基因在槟榔江、德宏水牛中的多态性,并与繁殖性能进行关联分析。[方法]研究采用PCR扩增及DNA测序方法,检测水牛FST基因多态性,并分析该基因变异位点与繁殖性能的关系。[结果]在槟榔江、德宏水牛的FST基因序列共检测到7个SNP位点,未发现插入/缺失变异。经χ2检验,除德宏水牛中SNP6偏离Hardy-Weinberg遗传平衡状态,其他SNP位点均处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态。FST基因与槟榔、德宏水牛产犊和产犊率性状相关不显著,而当两个群体合并后,FST基因有两个变异位点与产犊率呈极显著相关。[结论]FST基因在槟榔江、德宏水牛中存在较高基因变异性,FST基因与水牛繁殖性状的关系还需进一步研究。 李素霞 张秀 李杨 张斌 史宪伟 余选富 刘学洪关键词:水牛 FST 繁殖性状 瓢鸡3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)的Bi-PASA分子标记与沙门菌易感性的相关性研究 被引量:1 2019年 研究以3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)为鸡沙门菌易感性候选基因,以瓢鸡成年鸡沙门菌阳性群体与阴性对照群体为研究对象,采用序列测定和双向PCR扩增特异等位基因标记(Bi-PASA)技术,分析了3个防御素基因变异与沙门菌易感性的相关性。结果显示:在瓢鸡每个防御素基因编码区均检测到一个引起氨基酸变异的多态位点,分别建立了3个防御素基因的Bi-PASA分子标记;AvBD5基因A799G位点与瓢鸡沙门菌易感性的相关性达到极显著水平(P=0.0039),AvBD14基因的A2096T位点达到显著水平(P=0.017),而AvBD4相关性不显著(P=0.599);根据比值比(OR)与95%CI确定了每个防御素基因的保护基因型与易感基因型。研究结果对阐明防御素基因与沙门菌易感性的关系以及建立沙门菌抵抗力鸡群具有重要意义。 黄梦阳 李杨 张林云 陈多珍 富国文 富国文 罗袁山 史宪伟关键词:沙门菌 防御素基因 线粒体DNA COX3基因多态性与瓢鸡生长和屠体性状的相关性分析 被引量:4 2015年 采用DNA测序和PCR-RFLP方法,分析了瓢鸡线粒体DNA COX3基因(mt DNA COX3)变异,并与生长和屠体性状进行了关联分析。在瓢鸡线粒体DNA COX3基因发现C10669T多态位点,建立了Eco RV PCR-RFLP分子标记,利用该标记对300日龄具有生长和屠体性状记录的82只瓢鸡进行了基因分型。结果表明,线粒体DNA COX3基因C10669T多态位点在瓢鸡群体中C基因为优势基因,基因频率为69.5%,多态信息含量和杂合度分别为0.3341与0.4240。C10669T位点基因型在体重、龙骨长、跖长、屠体重与胸肌率5个性状差异显著,C基因型个体普遍高于T基因型。线粒体DNA COX3基因对瓢鸡生长和屠体性状的作用机理有待进一步深入分析。 李杨 杨向东 王静 张斌 黄英 史宪伟关键词:线粒体DNA 多态性 屠宰性能 鸡防御素基因及其与沙门菌抗性关系的研究进展 被引量:2 2017年 沙门菌病是一种常见的人畜共患传染病,严重危害畜禽和人类健康。先天免疫研究发现鸡防御素在抵抗沙门菌的侵害中发挥重要的作用。文章对鸡防御素基因的结构、表达分布、克隆研究及其与沙门菌抗性关系的研究进展作一综述,并对未来研究进行了展望。 谭仕旦 李杨 曾璐瑶 史宪伟关键词:防御素 沙门菌 抗性 瓢鸡无尾基因及检测瓢鸡无尾性状的方法、引物、试剂盒 本发明属于突变或遗传工程;遗传工程涉及的DNA或RNA,载体技术领域,公开了一种瓢鸡无尾基因及检测瓢鸡无尾性状的方法、引物、试剂盒,提供了瓢鸡IRX1基因Mbo II和Ava II的2个检测标记。本发明首次采用位置克隆技... 史宪伟 王欣 陈多珍 李杨 杨向东 罗袁山文献传递 拉伯高脚鸡线粒体DNA D-loop序列变异与起源分化研究 被引量:7 2016年 为从母系遗传角度探明云南拉伯高脚鸡的遗传多样性与起源分化,采用PCR产物直接测序技术对30只拉伯高脚鸡的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第一高变区序列进行了分析。结果表明:在所分析的mtDNA D-loop 527 bp序列中,共检测到17个变异位点,归结为5个单倍型。单倍型L1和L2属G世系,单倍型L3和L4属A世系,单倍型L5属B世系。G世系占整个群体的63.3%,A世系占33.3%。单倍型多样度为(0.763±0.049),群体内序列间核苷酸差异的平均数为7.205,核苷酸多样度为0.01315,平均遗传距离为0.016。由最大似然法构建的NJ系统进化树将拉伯高脚鸡聚为3大枝,分别与G、A、B 3个世系对应。与红原鸡及国内外鸡种聚类比较,拉伯高脚鸡在起源上具有其独特性。结果表明,拉伯高脚鸡存在较高的遗传多样性,起源上具有云南本地鸡特有的遗传特征。 王欣 罗成峰 陶清海 孙利民 李庆华 李杨 史宪伟关键词:线粒体DNA D-LOOP 单倍型 起源分化 槟榔江水牛ACTA1基因多态性与生长性状的相关性研究 被引量:3 2014年 [目的]揭示α-肌动蛋白1(actin alpha 1,ACTA1)基因多态性与槟榔江水牛生长性状的相关性。[方法]采用PCR扩增及基因测序技术研究了槟榔江水牛ACTA1基因多态性,并分析了该基因变异与水牛生长性状的关联关系。[结果]检测到槟榔江水牛ACTA1基因存在2个SNP位点,分别位于第5内含子与第6外显子,水牛ACTA1基因变异与体重、管围等性状存在显著相关。[结论]本研究首次检测了槟榔江水牛ACTA1基因多态性与生长发育性状的关联关系,为槟榔江水牛遗传资源保护利用及标记辅助选择提供了理论依据。 张斌 王静 宋敏艳 刘学洪 李杨 史宪伟关键词:槟榔江水牛 多态性 生长性状 瓢鸡SLC24A5基因多态性与肤色性状的关联分析 被引量:3 2015年 利用DNA测序与PCR-RFLP方法,分析瓢鸡溶质载体24家族A5成员(SLC24A5)基因多态性,并与肤色性状进行了关联分析。结果表明,在SLC24A5基因第4外显子发现G482C多态位点,引起161位苏氨酸变为丝氨酸(T161S),建立了引入酶切位点的错配Nhe I PCR-RFLP分子标记,利用该标记对52只白肤色与44只黑肤色瓢鸡个体进行了基因分型。试验结果提示,SLC24A5 NheI PCR-RFLP标记与肤色性状具有显著的相关性(P<0.05),G等位基因在白肤色群体和黑肤色群体均为优势基因,黑肤色群体的C等位基因频率显著高于白肤色群体。 李杨 杨向东 谷合勇 王静 张斌 史宪伟关键词:SNP RFLP 肤色 利用防御素基因标记提高鸡群沙门氏菌抵抗力的方法 本发明属于突变或遗传工程技术领域,公开了一种利用3个防御素基因Bi‑PASA标记提高鸡群沙门氏菌抵抗力的方法、引物、试剂盒,提供了三个防御素基因的双向等位基因特异PCR(Bi‑PASA)遗传标记。本发明首次采用Bi‑PA... 史宪伟 李杨 陈多珍 杨向东 罗袁山文献传递