陈沛 作品数:10 被引量:7 H指数:2 供职机构: 华中农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
黄颡鱼MHC classⅡ基因全长的克隆及饲料维生素D3对其组织表达的影响 被引量:4 2017年 为进一步丰富鱼类MHC class Ⅱ基因的研究,同时也为进一步探讨低磷饲料中添加维生素D3对鱼类免疫功能可能的影响,实验利用RACE(Rapid-amplification of c DNA ends)即c DNA末端快速扩增技术,成功克隆出黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)class Ⅱ抗原基因,全长1074 bp,其中ORF(Open reading frame)708 bp,编码236个氨基酸,5′UTR(5′端非翻译区)78 bp,3′UTR(3′端非翻译区)259 bp。进行氨基酸序列比对分析得到:黄颡鱼MHC class Ⅱ基因ORF氨基酸序列与长吻逘(Leiocassis longirostris)的氨基酸序列相似度最高为69.5%,与锦鲤(Cyprinus carpio)的氨基酸序列相似度最低为50.4%。利用q PCR对黄颡鱼MHC class Ⅱ基因进行组织表达分析,结果表明MHC class Ⅱ在小肠、肝脏、鳃中表达较高;在肌肉、鳍条中表达较低;而在肾、脾脏、脑、头肾中表达量极低(几乎检测不到)。在低磷饲料中添加维生素D3显著诱导了该基因的上调表达。研究结果展示了黄颡鱼MHC class Ⅱ抗原基因的分子结构、组织表达以及维生素D3的作用,在降低磷排放的同时,为今后黄颡鱼免疫抗病及分子选育等方向的深入研究及免疫型饲料的使用奠定了基础。 冯美惠 陈沛 雷文 李大鹏 王春芳关键词:黄颡鱼 黄颡鱼Cyp24a1基因及其获得全长序列的方法 本发明公开了一种黄颡鱼Cyp24a1基因及其获得全长序列的方法,Cyp24a1序列的全长为2180bp,编码506个氨基酸。黄颡鱼Cyp24a1蛋白的分子式为C<Sub>2602</Sub>H<Sub>4112</Sub... 王春芳 陈沛 何绪刚 谢从新 李大鹏文献传递 黄颡鱼Cyp24a1基因及其获得全长序列的方法 本发明公开了一种黄颡鱼Cyp24a1基因及其获得全长序列的方法,Cyp24a1序列的全长为2180bp,编码506个氨基酸。黄颡鱼Cyp24a1蛋白的分子式为C<Sub>2602</Sub>H<Sub>4112</Sub... 王春芳 陈沛 何绪刚 谢从新 李大鹏文献传递 提高黄颡鱼免疫力的低磷饲料及其制备方法 本发明公开了一种提高黄颡鱼免疫力的低磷饲料,按重量百分比包括如下组分:豆粕15~25%、菜粕20~30%、鱼粉10~20%、棉粕5~15%、小麦粉5~15%、大豆油3~5%、无磷矿物盐预混物2.05~2.5%、维生素预混... 王春芳 陈沛 黄艳青 冯美惠 李大鹏 何绪刚文献传递 黄颡鱼RNA-seq转录组分析及维生素D3对钠磷协同转运载体slc34a2表达影响的研究 为了进一步地提高鱼体对磷的利用率和减少磷的排放,本实验在低磷饲料的基础上通过添加不同浓度的维生素D3(VD3)来研究黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)鱼体中与VD3代谢和功能有关的基因和VD3对sl... 陈沛关键词:黄颡鱼 维生素D3 分子特征 文献传递 草鱼钠磷协同转运载体SlC34a2基因的克隆及组织表达分析 2016年 为了揭示草鱼对磷的吸收机制,运用RT-PCR和快速扩增c DNA末端方法,从草鱼(Ctenopharyngodon idella)肠中克隆获得钠磷协同转运载体基因Slc34a2,该基因全长为2446 bp,包含了1938 bp的开放阅读框,47 bp的5′非编码区(Untranslated region,UTR)和461 bp的3′UTR,编码645个氨基酸。草鱼SLC34A2蛋白的分子式为C3215H5125N801O902S30,分子量大小为70.39 k D,等电点为5.68,总平均疏水指数为0.458。对草鱼SLC34A2蛋白结构和功能预测分析,发现SLC34A2蛋白有11个跨膜域,1个半胱氨酸富集区,且N-端在胞外而C-端在胞内,也在第二个细胞外环中发现4个N-糖基化位点。用邻接法构建系统进化树,发现草鱼Slc34a2基因与硬骨鱼类聚类为一支,且草鱼SLC34A2蛋白与鲤(Cyprinus carpio)和斑马鱼(Danio rerio)SLC34A2的相似性最高,分别为90.3%和87.0%。实验采用了实时荧光定量PCR对草鱼Slc34a2 m RNA进行组织表达分析,结果表明Slc34a2 m RNA在组织中广谱表达,且在肠中表达最高,其次是肝脏、鳃、肾脏、脾脏、皮肤、肌肉、脑和头肾。实验为以后研究提高鱼对磷的利用和减少磷的排放奠定分子基础。 陈沛 黄艳青 谢从新 王春芳关键词:草鱼 分子克隆 基因表达 一种低磷配方的黄颡鱼饲料 本发明提供了一种低磷配方的黄颡鱼饲料,其特征在于:所述饲料配方的重量百分比为:酪蛋白35%、血粉10%、明胶2%、鱿鱼粉7%、面粉21%、鱼油6%、豆油3%、无磷矿物盐预混物2.75%、多维0.5%、磷酸二氢钙1.2%、... 王春芳 陈沛 唐琴 汤蓉 谢从新文献传递 低磷条件下添加维生素D3对黄颡鱼钠磷转运载体(Slc34a2)基因表达影响的研究 为了提高鱼体对磷的利用率和减少磷的排放,运用RACE-PCR技术,在黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)肠和肾脏中克隆得到三条Slc34a2(type Ⅱb sodium-dependent phos... 陈沛 王春芳关键词:黄颡鱼 基因表达 维生素D3 饲料VD3水平对黄颡鱼转录组差异基因表达的影响 被引量:4 2016年 为研究饲料中添加维生素D_3对黄颡鱼基因表达的影响,实验基于RNA-Seq技术对用添加不同水平维生素D_3[0(VD0),1243(VD2),22700(VD20)IU/kg]的饲料喂养的黄颡鱼肾脏和小肠的转录组数据进行分析。通过对305 568982条原始reads的筛选和排除,得到了83 265条unigenes,平均长845.38 nt,N50为1620 nt。利用Blast等相关软件对数据进行深度分析,得到功能注释基因共29 224个。根据GO富集分析发现,差异表达基因主要集中在细胞过程、代谢通路、生物调控等通路中,KEGGpathway富集分析结果显示,代谢通路涉及基因最多,有1532个。相对于对照组,添加1243和22700 IU/kg的VD_3(VD0 vs VD2/VD0vs VD20)可得到共同上下调基因共380个,其中上调基因266个,下调基因114个;3种水平下共同上下调的基因共2 1个,其中上调基因4个,下调基因1 7个。研究表明,在饲料中添加不同浓度维生素D_3会对黄颡鱼的生长代谢和生物调控等相关基因表达产生影响,且不同浓度实验组,相关基因的表达存在差异。本实验通过对差异表达基因的后续分析及预测,为黄颡鱼的生长代谢及疾病预防等方面的研究提供了丰富的数据来源。 冯美惠 陈沛 段鸣鸣 王春芳关键词:黄颡鱼 基因表达 一种低磷配方的黄颡鱼饲料 本发明提供了一种低磷配方的黄颡鱼饲料,其特征在于:所述饲料配方的重量百分比为:酪蛋白35%、血粉10%、明胶2%、鱿鱼粉7%、面粉21%、鱼油6%、豆油3%、无磷矿物盐预混物2.75%、多维0.5%、磷酸二氢钙1.2%、... 王春芳 陈沛 唐琴 汤蓉 谢从新文献传递