宋金龙
- 作品数：12 被引量：60H指数：5
- 供职机构：广州医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 尿液分析系统自动审核规则建立与验证的多中心研究被引量：6
- 2020年
- 目的建立全自动尿液分析系统自动审核规则并对其进行验证,在保证结果可靠性的前提下提高检验效率。方法收集来自北京大学航天临床医学院航天中心医院、上海交通大学附属第六人民医院、广州医科大学附属第一医院、温州医科大学附属第一医院和山西省人民医院5家医院检验科2019年9月至2020年4月期间的尿液标本共5359份,其中建立表观健康人群参考区间组355份,规则建立组3449份和规则验证组1555份。以显微镜检查结果作为金标准,应用贝克曼库尔特全自动尿液分析系统对尿液标本进行检测,建立尿液分析系统自动审核规则。各实验室均进行严格的室内质量控制,保证结果的准确性和稳定性。在规则建立阶段计算正常人群参考范围和自动审核规则结果(包括真阳性率、真阴性率、假阳性率、假阴性率、自动审核通过率),规则验证阶段计算自动审核规则的性能指标包括(有效拦截率、无效拦截率、有效审核率、无效审核率、自动审核通过率、自动审核通过正确率)。结果以显微镜检查结果为金标准,初步建立贝克曼库尔特全自动尿液分析系统自动审核规则,其自动审核通过率为52.51%(1811/3449),显微镜检查率为2.58%(89/3449),假阴性率、假阳性率、真阴性率和真阳性率分别为2.26%(78/3449)、11.86%(409/3449)、47.00%(1621/3449)和38.88%(1341/3449)。验证数据与规则建立数据一致并有一定提升,最终设定20条自动审核规则,其有效拦截率、无效拦截率、有效审核率、无效审核率、自动审核通过正确率分别为38.52%(599/1555)、10.35%(161/1555)、49.07%(763/1555)、2.06%(32/1555)和87.59%(1362/1555)。结论应用全自动尿液分析系统自动审核规则能够提高尿液检验的效率,节省人力,同时保证检测结果可靠性。
- 刘雪凯陈卫宾李小龙宋金龙郭慧芳冯璟刘沁青徐斐王伟鑫刘锋耿庆茂李小莉杜宇晓梁国威
- 关键词：尿液分析
- 16S rDNA序列分析在临床不常见细菌鉴定中的初步应用被引量：7
- 2014年
- 目的建立细菌16SrDNA序列分析技术并探讨其在临床不常见细菌鉴定中的应用价值。方法收集经全自动微生物分析系统鉴定其可靠率在99％及以上的常见细菌10株和常规方法难以鉴定或少见菌17株。通过PCR扩增16SrDNAv3．v4区基因片段并进行序列测定，序列与16SpathDB2．0数据库上已知细菌的16SrDNA序列进行比对分析确定细菌种属。当v3．v4序列片段不能明确鉴定细菌时，结合16SrDNA长片段测序及管家基因dnaJ和rpoB的序列做进一步分析。结果经16SrDNAv3．v4区序列分析，10株（100％）临床常见菌都能鉴定到种水平，其可靠性大于98．0％。17株不常见菌株中，10株（58．8％）细菌只与1种菌相似性大于98．0％，成功鉴定到单个种水平；6株（35．3％）细菌与不止1种菌的相似比大于98．0％；1株菌与已知菌相似性在96．0％～98．0％之间只能鉴定到属（棒状杆菌）。进一步结合16SrDNA长片段及管家基因dnaJ和rpoB的序列分析，所有菌株均可鉴定到单个种水平。结论结合16SrDNA和管家基因序列分析，可用于临床常见及不常见细菌的分子鉴定。
- 宋金龙林勇平梁颖罗娅莎陈定强刘忠民
- 关键词：管家基因
- AMA-M2、SP100和GP210在诊断原发性胆汁性肝硬化中的应用评估被引量：3
- 2018年
- 目的评估AMA-M2、SP100和GP210三种自身抗体在诊断原发性胆汁性肝硬化(primary biliary cirrhosis,PBC)中的应用价值。方法收集我院近3年就诊患者的AMA-M2、SP100、GP210、ALP和GGT检测数据,其中PBC患者50例,非PBC肝胆疾病或自身免疫病患者226例,正常对照290例。分析这些检测指标对PBC诊断的敏感度和特异度。结果 AMA-M2、SP100和GP210诊断原发性胆汁性肝硬化的敏感度分别为96.00%、36.00%、8.00%,特异度分别为98.26%、97.87%、99.03%。PBC组病人的ALP和GGT检测结果高于非PBC病人组。结论 AMA-M2、SP100和GP210对PBC的临床诊断特异度较高;AMA-M2的敏感度高,但SP100和GP210敏感度低。
- 俞辉宋金龙陈定强林勇平刘忠民刘利东
- 关键词：原发性胆汁性肝硬化AMA-M2SP100GP210
- 人pcsk9基因原核表达载体的构建及诱导表达被引量：1
- 2013年
- 目的构建人前蛋白转化酶枯草溶菌素9(pcsk9)的原核表达载体,优化pcsk9诱导表达条件。方法聚合酶链式反应扩增人工合成的pcsk9 cDNA序列。扩增产物经双酶切、连接,构建pET-28b-pcsk9表达载体;将重组质粒转化入大肠杆菌表达菌BL21(DE3)的感受态细胞中,分别在不同条件下对其进行诱导,获得pET-28b-pcsk9的最佳诱导表达条件。结果成功构建了pET-28b-pcsk9重组表达载体,其最佳表达条件为菌液光密度值取0.6,诱导温度取30℃,诱导剂终浓度取1.0 mmol/L,诱导时间取8 h。结论该重组表达载体构建成功,在大肠杆菌表达菌BL21(DE3)中可有效地表达,对诱导所用的温度和时间相对比较敏感。
- 李风梅俞辉宋金龙刘忠民
- 复发性流产患者血栓前状态分析及其与MTHFR基因C677T位点多态性的相关性研究被引量：11
- 2020年
- 目的探讨复发性自然流产(RSA)与凝血相关指标之间的关系,以及亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T位点多态性与RSA遗传易感性的相关性。方法选择2018年9月—2019年3月就诊于广州医科大学附属第一医院RSA患者77例为RSA组,另选择41名正常健康女性为正常对照组。采集两组人群EDTA抗凝全血,比较两组人群凝血指标和易栓症标志物的差异。对MTHFR基因通过聚合酶链式反应(PCR)扩增后进行Sanger法测序,分析比较两组MTHFR基因C677T位点的基因多态性。结果RSA组纤维蛋白原(FIB)水平高于正常对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。RSA组蛋白S(PS)缺陷发生率高于正常对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。以PS判断RSA患者存在血栓前状态(PTS)的最佳临界值为45%,曲线下面积为0.701(95%CI:0.611~0.791,P<0.01),灵敏度为95.1%,特异度为42.9%。两组人群中基因型比较,差异有统计学意义(P<0.05)。两组人群等位基因频率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论FIB水平升高及PS缺陷可能与RSA的发生相关,可作为RSA的筛查指标,且PS缺陷对于RSA的判断具有一定的参考价值。MTHFR基因多态位点C677T的突变可能为RSA发病的原因之一。
- 宋金龙陈萍萍王鹏鲲赖毛华马红霞李娟
- 关键词：亚甲基四氢叶酸还原酶
- 呼吸道标本中H7N9禽流感病毒全基因组深度测序与分析
- 研究背景
新发传染病（emerging infectious diseases，EID）是人类面临的一个重要威胁。据WHO的研究报告，自1967年以来，至少有40种新的病原体被发现，其中病毒性病原体超过70/%，重...
- 宋金龙
- 关键词：高通量测序宏基因组基因组分析
- 文献传递
- 人前蛋白转化酶枯草溶菌素9的cDNA克隆和表达及多克隆抗体的制备被引量：1
- 2013年
- 目的构建人前蛋白转化酶枯草溶菌素9(pcsk9)的原核表达载体并诱导其表达,制备其蛋白的多克隆抗体。方法聚合酶链式反应扩增人工合成的pcsk9 cDNA序列;扩增产物经TA克隆、双酶切、连接,构建pET-28b-pcsk9表达载体;将重组质粒转化入大肠杆菌表达菌BL21(DE3)的感受态细胞中,诱导表达;用纯化检测过的目的蛋白免疫新西兰兔,最后采集全血收集血清,获得多克隆抗体,并对该抗体进行免疫印迹及效价测定。结果 PET-28b-pcsk9原核表达载体构建成功,用诱导表达的目的蛋白免疫动物,收集血清获得多克隆抗体。对多克隆抗体进行纯化,免疫印迹检测结果证明自制多克隆抗体特异性良好,效价测定为1:13 200。结论成功构建了pcsk9原核表达载体pET-28b-pcsk9,且获得了其蛋白的多克隆抗体。
- 李风梅俞辉宋金龙刘忠民
- 关键词：PCSK9多克隆抗体
- 病毒宏基因组高通量测序在临床感染性疾病诊断中的应用被引量：2
- 2014年
- 目的以1例恶性胸腺瘤并发外阴部感染患者溃疡部位拭子标本为模型,建立适用于临床病毒检测的宏基因测序平台。方法提取该患者外阴部水疱液中的全部核酸,通过不依赖序列的单引物扩增(SISPA)后进行Ion Torrent PGM高通量测序,筛选出与病毒相关的测序读长(reads)与NCBI数据库中的序列进行比对,分析标本中病毒核酸的种类及丰度,并与荧光定量PCR法比较。结果共获得320 049条读长,4 288条(1.3%)与病毒相关,其中2 629条为噬菌体基因,其余1 659条读长中与人类疾病相关的有单纯疱疹病毒2型(HSV-2)14条(0.84%)、指环病毒属(Anellovirus)1 361条(82.0%)、多瘤病毒属(Polyomavirus)19条(1.14%)、乳头瘤病毒属101(Papillomavirus 101)6条(0.40%),反转录病毒科80条(4.82%)、痘病毒科45条(2.7%)、其他病毒如植物、鱼类、禽类病毒117条(7.05%)、未分类病毒17条(1.02%);疱疹病毒序列鉴定结果表明,14条读长注释为HSV-2(NC_001798),且用荧光定量PCR确认为HSV-2阳性,两法结果一致;噬菌体序列分析发现2 629条读长为噬菌体基因,其中1 251条为肠杆菌噬菌体(占47.6%),1 331条为葡萄球菌噬菌体(占50.6%)。结论初步建立了基于Ion Torrent PGM的病毒宏基因组测序平台并成功检测出HSV-2,为其在临床中的应用提供了实验依据。
- 罗娅莎林勇平宋金龙梁颖周强卢妙莲
- 关键词：高通量测序
- 病毒宏基因组分析在病毒性疾病中的应用
- 下一代测序技术的问世从根本上改变了基因组研究方法、促进了宏基因组的发展并且使研究者可以尝试新的实验技术。宏基因组这种研究微生物生态学必不可少的工具也很快的进入到病毒学研究领域，在感染性疾病特别是病毒性疾病方面，病毒宏基因...
- 宋金龙刘忠民林勇平
- 非小细胞肺癌EGFR基因突变的异质性被引量：13
- 2015年
- 目的分析非小细胞肺癌表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的不一致性,为EGFR突变的临床检测与药物应用提供参考。方法应用突变扩增阻滞系统(ARMS)法对80例非小细胞肺癌患者的同一病灶不同取样点检测组(34例)、多发结节肺癌组(28例)、原发灶与转移灶组(18例)进行EGFR突变检测,分析不同临床病理特征非小细胞肺癌患者的EGFR突变率及配对组内EGFR基因突变检测结果的不一致性。结果非小细胞肺癌患者EGFR基因总体突变率为55.00%(44/80)。80对配对样本的EGFR突变不一致率为31.25%(25/80),同一病灶不同取样点检测组、多发结节肺癌组、原发灶与转移灶组的EGFR突变不一致率分别为23.53%、50.00%、16.67%。其中19例患者出现一个部位样本为EGFR阳性突变,另一部位为EGFR阴性突变;6例患者出现EGFR变异类型不相同。组织学全为腺癌。其中不吸烟患者占80%(20/25)。结论非小细胞肺癌EGFR基因突变不一致率较高,临床工作中须关注送检组织及检测结果的代表性,为肺癌的精准治疗提供可靠的依据。
- 梁颖林勇平徐韫健王慧宋金龙刘忠民
- 关键词：非小细胞癌表皮生长因子受体突变
