王霞
- 作品数:5 被引量:0H指数:0
- 供职机构:华东理工大学药学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生自动化与计算机技术化学工程更多>>
- eSHAFTS:基于分子三维相似性的药物设计图形用户界面系统
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- 王霞魏文浩何高奇李洪林
- 文献传递
- 基于反向药效团匹配的网络药理学方法
- 多向药理学计算方法为药物重定位和毒副作用预测提供了有力工具。靶标预测平台PharmMapper采用反向药效团匹配策略,并整合了配套的靶标数据库。但是,鉴于靶标数据库之间的差异难以衡量,直接将靶标得分作为不同药物之间的评价...
- 王霞潘晨旭龚家瑜刘晓峰李洪林
- iDrug:在线可交互式药物设计平台
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- 王霞李洪林
- 文献传递
- 基于反向药效团匹配的网络药理学方法
- 2015年
- 多向药理学计算方法为药物重定位和毒副作用预测提供了有力工具.靶标预测平台PharmMapper采用反向药效团匹配策略,并整合了配套的靶标数据库.但是,鉴于靶标数据库之间的差异难以衡量,直接将靶标得分作为不同药物之间的评价指标,往往会影响其预测可靠性.本文提出了一种新方法以提高PharmMapper的区分能力.通过计算配体与靶标数据库中所有药效团的匹配值,作者建立了配体-靶标交叉得分矩阵.该矩阵能反射背景数据库的活跃程度,并可通过靶标得分评估随机发现一个给定靶标的概率.为验证策略有效性,作者从DrugBank搜集整理了1490个药物分子和673个靶标,开展了回顾性靶标筛选测试,以及针对两种常用药物的不良反应进行靶标预测,结果均表明改进后的得分可获得更高的预测精度.
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- eSHAFTS:基于分子三维相似性的药物设计图形用户界面系统
- eSHAFTS是基于分子三维相似性的药物设计图形用户界面软件包。该系统为从事药物设计的专业人员及非专业药化工作者提供了一种简易便捷的操作方式,以实现药物研发流程中的常用计算方法,如虚拟筛选、骨架跃迁、药物重定位以及多向药...
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