彭忠
- 作品数：59 被引量：155H指数：8
- 供职机构：华中农业大学更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生化学工程更多>>
- 2018年伪狂犬病病毒的流行特征及其遗传变异分析被引量：18
- 2020年
- 为了了解当前伪狂犬病病毒(PRV)在我国猪群中的流行现状及其遗传变异情况,本研究利用PCR的方法对2018年1-12月来源于我国28个省、市、自治区的1 328份疑似猪伪狂犬病发病猪的组织样品开展了PRV-gE的检测及病毒的分离鉴定,同时针对所分离的病毒的gB、gC和gE基因进行PCR扩增和DNA测序,并展开遗传变异分析。结果显示,共有92份样品为PRV-gE基因检测阳性,阳性检出率为6.93%。从92份PRV-gE阳性样品分离到13株PRV。分别基于gB基因部分片段、gC和gE基因进行遗传变异分析发现13株PRV与我国2012年以后流行的毒株(如HeN1等变异株)亲缘关系较近,而与2012年以前所分离的毒株(如Ea等经典毒株)的亲缘关系较远;此外,绝大多数中国分离株与国外分离毒株(如NIA-3、Bartha、Kaplan等)在遗传进化树中位于不同的进化分支;相对于国外分离株及国内早期流行的经典毒株而言,13株PRV分离株的gB、gC和gE蛋白中均存在许多特征性的氨基酸位点变异。本研究对于了解我国PRV流行现状及当前流行的PRV毒株的生物学特征具有十分重要的意义。
- 孙颖王雪莹梁婉谢思思彭忠陈宏建华琳宋文博汤细彪陈焕春吴斌
- 关键词：伪狂犬病病毒PCR检测病毒分离遗传变异分析
- 一种浓缩水中猪源性病毒的方法
- 本发明属于水体中病毒浓缩和检测技术领域，具体涉及一种浓缩水中猪源性病毒的方法。本发明制备了一种有效吸附水中病毒的玻璃棉，以威胁养猪业和公共卫生安全的病原体伪狂犬病病毒和猪流行性腹泻病毒为模型评估了病毒核酸回收率；以沙门菌...
- 吴斌樊杰彭忠陈宏建华琳宋文博
- 猪源艰难梭菌的分离鉴定与生物学特性分析被引量：2
- 2022年
- 为了了解我国猪源艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)的病原学及分子生物学特征,本研究收集湖北和广东地区疑似患有肠炎的病猪粪便样品,提取基因组DNA,利用已经报道的5重PCR方法对艰难梭菌的16S rDNA基因、毒素A的编码基因tcdA、毒素B的编码基因tcdB以及二元毒素编码基因cdtA和cdtB进行检测,同时采用厌氧培养法,对PCR检测毒素编码基因为阳性的粪便样品进行艰难梭菌的分离培养,并对所分离到的菌株进行药物敏感性测试和全基因组重测序。结果发现:本研究所采集到的97份粪便样品经PCR检测显示有80份样品为16S rDNA阳性,其中仅有2份样品为tcdA和tcdB阳性。从这两份样品中分离出一株tcdA和tcdB阳性的艰难梭菌,命名为HuB01。药敏试验发现,HuB01对头孢菌素(FOX)、氯霉素(CHL)、克林霉素(CLI)、氨苄西林(AMP)、头孢曲松钠(CRO)耐药,对莫西沙星(MXF)和万古霉素(VAN)表现出中度耐药,而对利福西明(RFX)、甲硝哒唑(MTZ)、非达霉素(FDX)敏感。全基因组重测序发现HuB01的全基因组大小为3.93 Mb,平均GC含量为28.31%,编码3691个蛋白基因及63个tRNA和10个rRNA;3691个基因中含有31个耐药基因和164个毒力相关基因。多序列位点分型(MLST)结果显示HuB01为ST11。由于目前国内对于艰难梭菌的研究大多集中在人医领域,因此本研究可为兽医领域艰难梭菌的相关研究奠定基础。
- 张悦艾伟诚王斐梁婉谢思思华琳李春辉彭忠吴斌
- 关键词：艰难梭菌PCR检测药敏试验
- 多杀性巴氏杆菌HN06基因组分泌蛋白的预测与分析被引量：4
- 2015年
- 预测分析多杀性巴氏杆菌HN06株的分泌蛋白并筛选多株巴氏杆菌共有Sec途径分泌蛋白,为研究多杀性巴氏杆菌亚单位疫苗候选蛋白奠定基础。利用Signal P、Tmhmm、Phobius、Target P、Lipop、GPI-SOM、Tat P、SecretomeP对已完成全基因组测序的多杀性巴氏杆菌HN06株进行分泌蛋白预测及功能分析,并结合已公布全基因组序列的多杀性巴氏杆菌Pm70、3480、36950的基因组序列筛选4株多杀性巴氏杆菌中共有的Sec途径分泌蛋白。结果表明,预测出HN06株分泌蛋白共373个,其中Sec分泌蛋白157个,Tat途径分泌蛋白8个,无信号肽的非经典途径分泌蛋白208个。Sec分泌蛋白中被Ⅰ型信号肽酶识别的有120个,被Ⅱ型信号肽酶识别的有37个。再对Pm70、3480、36950株进行Sec途径分泌蛋白的预测,使用blastp筛选它们共有的Sec蛋白114个。经过统计发现,多杀性巴氏杆菌HN06株不同类型分泌蛋白的功能分布各有侧重,其中ABC转运蛋白和铁摄取相关蛋白对于巴氏杆菌毒力因子的研究具有很重要的意义。因此,对分泌蛋白的深入分析对于更清晰地了解巴氏杆菌的致病机制及筛选免疫原性蛋白具有重要意义。
- 彭忠梁婉刘文静徐卓菲谭臣吴斌周锐陈焕春
- 关键词：多杀性巴氏杆菌分泌蛋白
- 湖北两个奶牛场奶牛乳房炎病原菌的分离鉴定及药物敏感性分析
- 本研究对黄冈、宜昌两个规模化奶牛场(500头、800头)采集患临床型乳房炎、隐形乳房炎和健康奶牛奶样共99份,进行了细菌分离与鉴定,对分离鉴定出的金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、无乳链球菌、停乳链球菌、乳房链球菌、大肠杆菌...
- 郭锐苑宇彭忠吴斌
- 关键词：奶牛乳房炎病原菌药敏试验
- 文献传递
- 巴氏杆菌基因组测序研究进展
- 巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)是一种人兽共患病原微生物,其可对多种畜禽及人具有一定的致病性,该菌在世界范围内广泛存在并传播流行,造成严重的经济损失.2001年巴氏杆菌Pm70株全基因组序列首...
- 梁婉彭忠吴斌刘文静徐卓菲周锐陈焕春
- 关键词：巴氏杆菌全基因组序列基因组学比较基因组学
- 利用杆状病毒表达系统表达PRV/gE蛋白及间接免疫荧光抗体(IDF)检测方法的建立被引量：8
- 2019年
- 为了建立高效灵敏的伪狂犬病病毒(PRV) gE蛋白的间接免疫荧光抗体诊断方法,本研究将PRV/HN/SMX/2012毒株gE蛋白的自身信号肽及胞外域片段克隆到pFastBacHT B载体上,构建重组质粒pFastBacHTB-gE,并转化至大肠杆菌DH10Bac感受态细胞中,经过3次蓝白斑筛选获得含有gE基因的重组杆粒rBacmid-gE。随后,将该杆粒转染至sf9昆虫细胞中,获得重组杆状病毒rAcMNPV-gE。经Western blot和间接免疫荧光实验(IFA)进行鉴定分析,发现重组gE蛋白在sf9细胞中表达。利用该sf9细胞建立检测血清中gE抗体的间接免疫荧光抗体(IDF)方法,通过反应条件的优化发现,将血清和羊抗猪FITC-IgG分别进行1∶40和1∶2 000稀释时所建立的方法能针对血清中gE抗体产生较强的特异性荧光;通过与商业化的ELISA检测gI/gE试剂盒(IDEXX)比较,所建立的检测方法与商业化试剂盒的总符合率为93.18%(164/176),阳性结果符合率93.75%(120/128),阴性结果符合率91.67%(44/48),2种方法存在很强的一致性(Kappa=0.832,CI=95%);-20℃条件下保存2个月的稳定性和重复性良好。
- 朱和超梁婉范桂芳彭忠华琳汤细彪陈焕春吴斌
- 关键词：GE基因
- 湖北省部分地区2020-2021年PRRSV的流行病学调查
- 引言猪繁殖与呼吸综合征(Porine reproductive and respiratory syndromne virus,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive And Re...
- 张晨陈宏建王雪莹杨豪彭忠吴斌
- 我国部分地区猪沙门菌的耐药性被引量：6
- 2017年
- 以2014-2015年从我国部分省市规模化养殖场中分离的55株沙门菌为对象,选取临床常用的12种抗菌药,用微量肉汤稀释法检测所分离的沙门菌的耐药性。结果显示:测试的12种药物中沙门菌对甲氧苄啶最敏感,耐药率只有1.82%,除此之外对其他11种药物的耐药率均在50%以上,而且对其中的氨苄西林、氟苯尼考、多西环素和四环素等4大类共计7种药物的耐药率在80%以上;在多重耐药性分析方面,1株沙门菌对所有药物完全敏感,另外54株菌的药物耐受数量在5种到11种之间,其中耐受10种药物是所有沙门菌中最大的一类菌株,占总数的30.91%。根据菌株的耐药特点,设计了23对包含各类药物主要耐药基因的引物,用PCR法检测相应耐药菌株对该耐药基因的携带情况,一共检测出了15种耐药基因,其中检出率最高的几种基因分别是sul2基因(检出率78.43%)、sul1基因(检出率60.78%)和tet A基因(检出率72.55%)等。此外,对于耐受喹诺酮类药物的菌株还检测了其耐药决定区域基因gyrA和parC所编码氨基酸的突变情况。测序结果表明,gyrA基因所编码氨基酸序列的第83个位点和第87个位点发生了突变,分别由酪氨酸变成了丝氨酸或亮氨酸、苯丙氨酸,由天冬氨酸变成了天冬酰胺或酪氨酸,parC基因所编码氨基酸序列没有发现突变的情况。
- 朱顺彭忠王帅王豪男张洪峰常宇慧郭龙陈焕春吴斌
- 关键词：沙门菌药敏试验耐药基因聚合酶链式反应
- 一株突变的金黄色葡萄球菌噬菌体及其应用
- 本发明属于动物传染性病防治技术领域，具体涉及一株突变的金黄色葡萄球菌噬菌体及其应用。本发明分离的金黄色葡萄球菌噬菌体4PHCISA25保藏在中国典型培养物保藏中心，保藏编号为CCTCC NO：M20211354。本发明提...
- 吴斌王霜彭忠杨丹华琳宋文博陈焕春
