徐佳 作品数:5 被引量:20 H指数:2 供职机构: 上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 国家大学生创新性实验计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 理学 更多>>
UPLC-Q-TOFMS/MS联用技术分析大鼠肠道微生物体外对小檗碱的代谢产物 被引量:7 2014年 采用大鼠肠道微生物和小檗碱进行体外厌氧共培养,并利用超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱联用仪(UPLC-Q-TOFMS/MS)分析小檗碱的代谢产物,探讨大鼠肠道微生物对小檗碱的生物转化过程.采用UPLC的方法,有效分离得到小檗碱及其代谢产物,再采用串联质谱对代谢产物进行结构解析及鉴定.研究结果发现,在体外条件下,大鼠肠道微生物通过脱甲基、脱羟基、去亚甲基等反应将小檗碱转化为小檗红碱,药根碱等5种代谢产物. 李梦 徐佳 赵梅 吴欢 赵宇峰关键词:小檗碱 肠道微生物 生物转化 重度肥胖患者肠道内机会性致病菌Escherichia coli微多样性分析 被引量:2 2015年 本研究利用志贺氏菌显色培养基和ERIC-PCR指纹图谱技术,从一名重度肥胖患者肠道内分离出19种不同ERIC类型的分离物。选取不同ERIC类型的代表菌株进行16S r RNA基因分子鉴定并构建系统发育树,发现19种代表菌株的16S r RNA基因和埃希氏菌属(Escherichia)、志贺氏菌属(Shigella)的相似性达到99%。经生理生化反应鉴定,19种代表菌株均为肠杆菌科的肠埃希氏菌(Escherichia coli)。体外生物学分析发现19种E.coli代表菌株在生化特性、耐药性、毒性方面有明显差异。本研究表明来自一名重度肥胖患者肠道内同一种群的E.coli在菌株水平上具有丰富的微多样性,不同ERIC类型的E.coli在生理生化特性上存在较大的差异,且部分菌株具有潜在致病性。 赵梅 王睿瑞 徐佳 方超 赵宇峰定量PCR比较两种苦瓜制品对人肠道菌群结构的体外调节作用 被引量:1 2014年 目的通过体外厌氧培养联合定量PCR的方法比较两种不同的苦瓜制品,苦瓜全粉(Bitter melon power,BMP)和苦瓜乙醇提取物(Bitter melon ethanol extract,BME),对健康人和2型糖尿患者肠道菌群结构的调节作用。方法采集一名健康个体和一名2型糖尿病个体的新鲜粪便样品,在体外厌氧的条件下与不同浓度的BMP或BME共培养,收集0、12、24、48 h的菌体沉淀。采用定量PCR的方法,检测乳杆菌属细菌、双歧杆菌属细菌、丁酸盐产生菌、硫酸盐还原菌和肠杆菌科细菌这5类细菌在总菌中相对含量的变化。结果培养过程中,双歧杆菌属细菌、硫酸盐还原菌和肠杆菌科细菌在两名个体培养样本中表现出类似的生长趋势,而乳杆菌属细菌和丁酸盐产生菌则有差异。相同培养时间下,与对照组相比,BMP和BME在两名个体的培养样本中均能富集乳杆菌属细菌、双歧杆菌属细菌和丁酸盐产生菌,并抑制肠杆菌科细菌,但是只有BMP 15 mg/mL能持续抑制硫酸盐还原菌。相同浓度之下,BMP对菌群结构的调节效果比BME显著。结论来自不同个体的相同肠道细菌类群可能呈现不同的体外生长趋势,但BMP和BME均能对同一细菌类群起到类似的调节作用;且相较于BME,BMP通过富集一些有益细菌并抑制机会致病细菌从而改善肠道菌群结构的效果更显著。 何欣欣 徐佳 宋岷埈 张旭 龙文敏 王凌华关键词:肠道菌群 定量PCR 上海市西南部气传致敏真菌消长规律 被引量:8 2011年 目的研究上海市全年大气真菌孢子的数量变化规律及其与气象因素之间的关系。方法使用重力沉降法(曝片法)收集真菌孢子,记录气象参数,取得数据录入计算机,使用SPSS软件包和Excel 2010进行统计学分析。将曝片中发现的优势菌种交链孢霉分离,置于不同温度下培养,使用Excel 2010分析其生长与温度之间的关系。结果上海市西南部地区空气中全年都有真菌孢子飘散,5和6月份日均观察到的气传真菌孢子数目最多,12、1和2月份最少。全年曝片共收集到真菌孢子5602个,其中交链孢霉(Alternaria)2669个(47.6%)、黑孢子菌(Negrospora Sphoric)1439个(25.7%)、匍柄霉(Stemphylium)215个(3.8%)、镰刀菌(Fusarium)199个(3.6%)、棒孢霉(Corynespora cassiicola)166个(3.0%)、弯孢霉(Curvularia)132个(2.4%)、附球菌(Epicoccum)125个(2.2%)、大孢枝孢霉(Cladosporium macrocarpum Preuss)122个(2.2%)、尾孢霉(Ceveospora)112个(2.0%)、蠕孢霉(Helminthosporium halodes)110个(2.0%)等。空气中真菌孢子数量与气象因素的偏相关性分析结果为:温度的偏相关系数为0.388,P<0.001;天气情况为-0.152,P=0.006;风向为0.102,P=0.063;湿度为0.053,P=0.337;风力为0.051,P=0.352。对优势菌种交链孢霉进行分离培养,交链孢霉在不同温度下培养8d后的菌落直径分别为:12.5mm(4℃),14mm(10℃),31.5mm(15℃),43mm(20℃),63mm(25℃),63mm(30℃),33.5mm(35℃),3.5mm(40℃)。结论交链孢霉和黑孢子菌是上海市西南部空气中的优势菌种。温度是与空气中真菌数量相关性最大的因素,25~30℃可能为交链孢霉以及大部分气传真菌的生长最适温度。天气状况也与气传真菌孢子数量有显著的相关性,而其他气象因素,如湿度、风向、风力与空气中真菌数量无显著相关性。 杨辰宸 范月蕾 刘阳 何丽明 程辰 蒋潇 贾蒙杨 高萍 徐佳 陈晨杰 王莲芸关键词:气象因素 变态反应 苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物健康功效的体外评估 被引量:2 2019年 本研究的目的是运用体外模型评估苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物的健康功效。苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物以7.5 mg/mL和15 mg/mL的剂量与新鲜粪便样品进行体外厌氧培养。通过454焦磷酸测序技术分析粪便菌群组成的变化,同时测定发酵上清中短链脂肪酸的含量以及对Caco-2单层细胞跨膜电阻的影响。结果显示,苦瓜全粉(15 mg/mL)可以明显地扶植Faecalibacterium属细菌,同时抑制Bilophila和Desulfovibrio属细菌的增殖;同等剂量的苦瓜全粉发酵上清中短链脂肪酸的含量明显高于苦瓜乙醇提取物发酵上清;源自苦瓜乙醇提取物(15 mg/mL)的发酵上清对Caco-2单层细胞跨膜电阻的增强作用要大于苦瓜全粉(15 mg/mL)。本研究探究了体外苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物不同的生理功效,为以后苦瓜制品的选择提供了初步证据。 黄鲁燕 何欣欣 薛正晟 徐佳 肖水明 王凌华关键词:短链脂肪酸 肠道菌群